Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2B008

Protein Details
Accession H2B008    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
90-118VTAAVQSVRRNRKRSIKRRNVALMKKNASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
98-109RRNRKRSIKRRN
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007147  TF_Vhr  
KEGG kaf:KAFR_0I01770  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04001  Vhr1  
Amino Acid Sequences MTNVTDSDEADDSRSNSSTGITSKIRKQLNFTDDSKWKQFSSRRLELIDKFNLSERKASEQDQPIKQIAHILRTEFNYPLPTSNKFEKLVTAAVQSVRRNRKRSIKRRNVALMKKNASLNNPRSTITDFDNEFSSNVSSSSTSPTPSNIPLNNGTPDRTCNFRGPSIVSINASTKLQPILHKPSLASKKSSSPPLLSNNIQNINGKYSLPLPLPLQNKLDIPFTHNQAINTIKIPSCVIQPKLSSITTSDTSYYSKVLKSMISELLDNVVPLSEQEEKDKLTSNNLANILSDVNQTGNSYLKQSEIPFFLKKQILRKIQQSKTCSGISKASDNLITDITFANLKILGKSSLKISLSYILERFFNNDSKSMEYILEKFWDQTNLSQLAVNLFQSSMKNYKIQDYPINDLQTHLLYLLIGSIIKDFGFDDTLYQLGEIAYSNIMIRYPLTSSRNTAIYSTLPMNPEKANEKLNKSVIIKYKDSFQEFNFNLLTNSPPTIMEILENCSKLFKIEDFKKFGIFHNNELTENDGQLNQLFKDLNCLKLSLELREIQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.19
3 0.17
4 0.18
5 0.19
6 0.18
7 0.23
8 0.26
9 0.31
10 0.38
11 0.46
12 0.51
13 0.5
14 0.55
15 0.58
16 0.6
17 0.6
18 0.56
19 0.57
20 0.57
21 0.62
22 0.61
23 0.55
24 0.48
25 0.5
26 0.54
27 0.55
28 0.58
29 0.59
30 0.57
31 0.59
32 0.64
33 0.62
34 0.62
35 0.59
36 0.51
37 0.44
38 0.46
39 0.46
40 0.41
41 0.41
42 0.36
43 0.37
44 0.39
45 0.41
46 0.43
47 0.48
48 0.55
49 0.54
50 0.56
51 0.51
52 0.49
53 0.46
54 0.45
55 0.38
56 0.35
57 0.33
58 0.31
59 0.31
60 0.33
61 0.36
62 0.28
63 0.28
64 0.26
65 0.25
66 0.27
67 0.27
68 0.29
69 0.32
70 0.38
71 0.41
72 0.39
73 0.39
74 0.36
75 0.35
76 0.34
77 0.29
78 0.24
79 0.22
80 0.24
81 0.29
82 0.3
83 0.37
84 0.45
85 0.51
86 0.55
87 0.6
88 0.67
89 0.73
90 0.8
91 0.82
92 0.83
93 0.83
94 0.87
95 0.89
96 0.88
97 0.87
98 0.85
99 0.83
100 0.76
101 0.73
102 0.68
103 0.6
104 0.57
105 0.57
106 0.54
107 0.51
108 0.49
109 0.45
110 0.43
111 0.43
112 0.39
113 0.33
114 0.32
115 0.26
116 0.25
117 0.26
118 0.24
119 0.21
120 0.2
121 0.17
122 0.11
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.1
127 0.15
128 0.15
129 0.16
130 0.16
131 0.18
132 0.2
133 0.22
134 0.27
135 0.23
136 0.26
137 0.28
138 0.3
139 0.32
140 0.3
141 0.29
142 0.24
143 0.26
144 0.24
145 0.26
146 0.26
147 0.27
148 0.29
149 0.29
150 0.3
151 0.3
152 0.32
153 0.3
154 0.29
155 0.24
156 0.23
157 0.23
158 0.21
159 0.19
160 0.15
161 0.14
162 0.14
163 0.15
164 0.17
165 0.22
166 0.29
167 0.31
168 0.31
169 0.3
170 0.37
171 0.45
172 0.44
173 0.41
174 0.35
175 0.4
176 0.43
177 0.49
178 0.42
179 0.36
180 0.39
181 0.41
182 0.43
183 0.37
184 0.37
185 0.36
186 0.36
187 0.34
188 0.32
189 0.27
190 0.25
191 0.24
192 0.2
193 0.16
194 0.15
195 0.17
196 0.15
197 0.15
198 0.14
199 0.19
200 0.22
201 0.24
202 0.24
203 0.22
204 0.23
205 0.23
206 0.25
207 0.18
208 0.21
209 0.22
210 0.24
211 0.26
212 0.26
213 0.25
214 0.24
215 0.26
216 0.22
217 0.2
218 0.18
219 0.14
220 0.13
221 0.14
222 0.12
223 0.15
224 0.18
225 0.19
226 0.2
227 0.2
228 0.22
229 0.24
230 0.23
231 0.19
232 0.16
233 0.18
234 0.16
235 0.17
236 0.15
237 0.13
238 0.14
239 0.15
240 0.15
241 0.13
242 0.12
243 0.12
244 0.12
245 0.11
246 0.11
247 0.13
248 0.14
249 0.14
250 0.13
251 0.13
252 0.13
253 0.12
254 0.11
255 0.08
256 0.05
257 0.04
258 0.04
259 0.06
260 0.08
261 0.08
262 0.1
263 0.12
264 0.12
265 0.13
266 0.17
267 0.15
268 0.16
269 0.21
270 0.2
271 0.22
272 0.23
273 0.22
274 0.18
275 0.18
276 0.15
277 0.11
278 0.1
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.07
286 0.08
287 0.09
288 0.09
289 0.11
290 0.12
291 0.14
292 0.15
293 0.18
294 0.18
295 0.19
296 0.23
297 0.25
298 0.26
299 0.32
300 0.37
301 0.42
302 0.44
303 0.52
304 0.58
305 0.6
306 0.65
307 0.61
308 0.55
309 0.52
310 0.5
311 0.42
312 0.34
313 0.32
314 0.27
315 0.26
316 0.24
317 0.21
318 0.2
319 0.19
320 0.18
321 0.14
322 0.12
323 0.1
324 0.09
325 0.09
326 0.08
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.08
331 0.07
332 0.09
333 0.11
334 0.12
335 0.13
336 0.14
337 0.17
338 0.18
339 0.18
340 0.17
341 0.2
342 0.2
343 0.22
344 0.21
345 0.17
346 0.17
347 0.17
348 0.19
349 0.16
350 0.19
351 0.18
352 0.2
353 0.21
354 0.23
355 0.24
356 0.22
357 0.21
358 0.18
359 0.18
360 0.16
361 0.17
362 0.14
363 0.14
364 0.14
365 0.16
366 0.16
367 0.16
368 0.2
369 0.19
370 0.2
371 0.19
372 0.18
373 0.17
374 0.17
375 0.15
376 0.1
377 0.09
378 0.1
379 0.1
380 0.13
381 0.15
382 0.16
383 0.2
384 0.2
385 0.26
386 0.27
387 0.31
388 0.34
389 0.34
390 0.39
391 0.41
392 0.42
393 0.36
394 0.34
395 0.32
396 0.26
397 0.21
398 0.15
399 0.1
400 0.07
401 0.07
402 0.06
403 0.05
404 0.04
405 0.04
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.06
410 0.06
411 0.07
412 0.08
413 0.08
414 0.09
415 0.09
416 0.1
417 0.09
418 0.09
419 0.08
420 0.06
421 0.07
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.07
427 0.06
428 0.07
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.1
433 0.16
434 0.19
435 0.21
436 0.25
437 0.27
438 0.3
439 0.29
440 0.27
441 0.23
442 0.21
443 0.23
444 0.22
445 0.22
446 0.21
447 0.21
448 0.23
449 0.22
450 0.25
451 0.25
452 0.26
453 0.31
454 0.35
455 0.39
456 0.44
457 0.46
458 0.48
459 0.47
460 0.51
461 0.52
462 0.51
463 0.5
464 0.44
465 0.49
466 0.49
467 0.51
468 0.47
469 0.41
470 0.45
471 0.42
472 0.45
473 0.38
474 0.31
475 0.27
476 0.25
477 0.25
478 0.17
479 0.18
480 0.15
481 0.14
482 0.16
483 0.16
484 0.15
485 0.15
486 0.15
487 0.18
488 0.22
489 0.22
490 0.2
491 0.21
492 0.21
493 0.19
494 0.2
495 0.2
496 0.26
497 0.35
498 0.43
499 0.49
500 0.5
501 0.54
502 0.53
503 0.53
504 0.54
505 0.48
506 0.45
507 0.47
508 0.48
509 0.44
510 0.43
511 0.43
512 0.34
513 0.32
514 0.28
515 0.18
516 0.17
517 0.18
518 0.2
519 0.15
520 0.17
521 0.18
522 0.16
523 0.26
524 0.28
525 0.31
526 0.3
527 0.3
528 0.27
529 0.34
530 0.37
531 0.3