FuNGI

H2APC4

Protein Details

Accession

H2APC4

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
4-36	KPTESGGKKTLNKNQKLRKKRVRNARSIRAEAI	Hydrophilic
85-121	VFQALPRKLRRRTASHNIRRIPKRMRNRAIREMTKSA	Hydrophilic
599-626	NLYKRSSLKAKWDKKPRARRLNFEKIKD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
11-30	KKTLNKNQKLRKKRVRNARS
90-115	PRKLRRRTASHNIRRIPKRMRNRAIR
606-618	LKAKWDKKPRARR

Subcellular Location(s)

nucl 20, mito_nucl 13.333, cyto_nucl 11.333, mito 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039182 Pop1 IPR009723 Pop1_N IPR012590 POPLD_dom
Gene Ontology	GO:0005655 C:nucleolar ribonuclease P complex GO:0000172 C:ribonuclease MRP complex GO:0001682 P:tRNA 5'-leader removal
KEGG	kaf:KAFR_0A07900 -
Pfam	View protein in Pfam PF06978 POP1 PF08170 POPLD

Amino Acid Sequences

MSTKPTESGGKKTLNKNQKLRKKRVRNARSIRAEAIIASKSNTSNELTETGGILKVDQFINSRHYEINQLQIAMHRSKRSSSTRVFQALPRKLRRRTASHNIRRIPKRMRNRAIREMTKSAQQNPISPGLKGRKLHGLSSSALYKARMQVKLLRLAAKSNSLKLQLPEGATEAKVNLRQRIKLLNNAIKSSKRTTILKMNNRMGSYDNTGINEMAPIPRGRIKYYKRQRVFSWLPTHIWNAKRSHMMKRWGFQIPWSATQKCFKLSHRLGNSTAASDGALCIDSSFVGTMILRDNDSTGAFLKDLISKITNGRAILKKYYSSKCFFEGLLYDLNSHEVVLGPFDLLWINDVTVLLRLHPSLYSDLFNSLLQFKDNISIQDCRFSLASITLKGSKSSSALASILRSVGPSKSFEQLKLISRLTDPSVLPSKTMFAFNAIDPRHLANPKKITKPNKDLSVEQIMSLQTEFPATEFSSVLQRLVDPTERENSYKNQQTLKGLARRRRNLLLSDAANEHTSTIPHDSINDPSIPIVIIRRQKSMDWVVVMPWFWMLPFWYQLNRIPRIFNVGLRQVQQLNYEQRQLYFPDDYPFTSTGYMENNLYKRSSLKAKWDKKPRARRLNFEKIKDIHSVTLPSFTGEIGDYFSCDWKLLQILRNGIEFLTKNGEEVNMIESNKTTQFDDHKNRIVTVLNDLFELYKDEISADKVDDVVPVKFATALSEPVANKVSTLLDISTQALAIVPITCEVSGRGHPRDNARIYQIPSEHKIFWHNVVKGVYRSDGRIDHNQTIPLPKPHHLIGFITSGTFHLSEGRGVGNGFIDQKFAQEQKDKYILIRNVGTNVYRVAHWDYIHV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.71
2	0.77
3	0.8
4	0.83
5	0.85
6	0.88
7	0.9
8	0.91
9	0.92
10	0.92
11	0.93
12	0.93
13	0.93
14	0.93
15	0.93
16	0.91
17	0.84
18	0.77
19	0.68
20	0.58
21	0.48
22	0.42
23	0.33
24	0.25
25	0.21
26	0.21
27	0.2
28	0.21
29	0.22
30	0.21
31	0.19
32	0.21
33	0.21
34	0.2
35	0.19
36	0.18
37	0.17
38	0.16
39	0.15
40	0.13
41	0.12
42	0.14
43	0.14
44	0.15
45	0.16
46	0.17
47	0.23
48	0.25
49	0.26
50	0.25
51	0.26
52	0.31
53	0.31
54	0.36
55	0.33
56	0.31
57	0.29
58	0.31
59	0.35
60	0.34
61	0.37
62	0.34
63	0.34
64	0.37
65	0.45
66	0.48
67	0.52
68	0.53
69	0.56
70	0.59
71	0.62
72	0.61
73	0.58
74	0.61
75	0.61
76	0.64
77	0.67
78	0.68
79	0.7
80	0.77
81	0.79
82	0.78
83	0.78
84	0.79
85	0.81
86	0.82
87	0.85
88	0.83
89	0.85
90	0.83
91	0.82
92	0.82
93	0.8
94	0.81
95	0.83
96	0.85
97	0.85
98	0.87
99	0.89
100	0.88
101	0.85
102	0.81
103	0.77
104	0.69
105	0.65
106	0.61
107	0.55
108	0.54
109	0.48
110	0.46
111	0.43
112	0.5
113	0.43
114	0.39
115	0.42
116	0.42
117	0.47
118	0.44
119	0.43
120	0.44
121	0.45
122	0.47
123	0.43
124	0.39
125	0.34
126	0.36
127	0.35
128	0.27
129	0.26
130	0.25
131	0.23
132	0.27
133	0.32
134	0.3
135	0.31
136	0.37
137	0.41
138	0.48
139	0.48
140	0.46
141	0.4
142	0.42
143	0.41
144	0.43
145	0.4
146	0.35
147	0.35
148	0.33
149	0.35
150	0.32
151	0.35
152	0.29
153	0.27
154	0.25
155	0.23
156	0.22
157	0.19
158	0.19
159	0.15
160	0.15
161	0.19
162	0.21
163	0.27
164	0.3
165	0.32
166	0.35
167	0.43
168	0.44
169	0.47
170	0.53
171	0.53
172	0.52
173	0.53
174	0.54
175	0.48
176	0.49
177	0.46
178	0.42
179	0.39
180	0.39
181	0.41
182	0.47
183	0.54
184	0.59
185	0.63
186	0.65
187	0.64
188	0.61
189	0.57
190	0.49
191	0.43
192	0.38
193	0.33
194	0.27
195	0.24
196	0.24
197	0.23
198	0.21
199	0.17
200	0.13
201	0.1
202	0.11
203	0.1
204	0.12
205	0.17
206	0.18
207	0.22
208	0.31
209	0.36
210	0.45
211	0.56
212	0.64
213	0.65
214	0.68
215	0.67
216	0.67
217	0.68
218	0.65
219	0.62
220	0.55
221	0.51
222	0.48
223	0.5
224	0.46
225	0.43
226	0.4
227	0.35
228	0.36
229	0.42
230	0.43
231	0.48
232	0.5
233	0.55
234	0.55
235	0.55
236	0.57
237	0.53
238	0.5
239	0.43
240	0.44
241	0.38
242	0.4
243	0.42
244	0.38
245	0.36
246	0.41
247	0.4
248	0.36
249	0.37
250	0.33
251	0.39
252	0.42
253	0.49
254	0.5
255	0.52
256	0.48
257	0.49
258	0.47
259	0.37
260	0.32
261	0.22
262	0.16
263	0.12
264	0.11
265	0.06
266	0.06
267	0.05
268	0.04
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.05
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.05
277	0.07
278	0.08
279	0.08
280	0.08
281	0.09
282	0.09
283	0.1
284	0.1
285	0.08
286	0.08
287	0.08
288	0.08
289	0.09
290	0.11
291	0.11
292	0.12
293	0.12
294	0.12
295	0.14
296	0.18
297	0.18
298	0.16
299	0.22
300	0.25
301	0.26
302	0.29
303	0.29
304	0.29
305	0.34
306	0.4
307	0.4
308	0.39
309	0.38
310	0.37
311	0.37
312	0.33
313	0.27
314	0.22
315	0.19
316	0.18
317	0.16
318	0.13
319	0.12
320	0.13
321	0.12
322	0.1
323	0.08
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.06
328	0.05
329	0.04
330	0.05
331	0.05
332	0.04
333	0.05
334	0.05
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.07
340	0.07
341	0.07
342	0.07
343	0.07
344	0.07
345	0.08
346	0.09
347	0.09
348	0.1
349	0.1
350	0.1
351	0.11
352	0.12
353	0.12
354	0.11
355	0.1
356	0.09
357	0.09
358	0.09
359	0.08
360	0.1
361	0.11
362	0.11
363	0.12
364	0.16
365	0.16
366	0.2
367	0.19
368	0.18
369	0.17
370	0.16
371	0.14
372	0.14
373	0.15
374	0.11
375	0.13
376	0.15
377	0.16
378	0.16
379	0.16
380	0.14
381	0.13
382	0.13
383	0.12
384	0.09
385	0.1
386	0.1
387	0.1
388	0.09
389	0.09
390	0.07
391	0.07
392	0.07
393	0.07
394	0.08
395	0.1
396	0.12
397	0.16
398	0.17
399	0.17
400	0.2
401	0.22
402	0.24
403	0.26
404	0.24
405	0.2
406	0.2
407	0.21
408	0.19
409	0.19
410	0.15
411	0.14
412	0.19
413	0.18
414	0.18
415	0.17
416	0.17
417	0.15
418	0.16
419	0.12
420	0.1
421	0.11
422	0.11
423	0.17
424	0.16
425	0.16
426	0.16
427	0.17
428	0.19
429	0.21
430	0.23
431	0.23
432	0.31
433	0.36
434	0.43
435	0.49
436	0.54
437	0.59
438	0.66
439	0.65
440	0.64
441	0.61
442	0.54
443	0.52
444	0.5
445	0.42
446	0.33
447	0.29
448	0.21
449	0.19
450	0.18
451	0.13
452	0.06
453	0.06
454	0.06
455	0.04
456	0.06
457	0.06
458	0.07
459	0.07
460	0.07
461	0.11
462	0.11
463	0.11
464	0.1
465	0.09
466	0.09
467	0.11
468	0.14
469	0.11
470	0.13
471	0.17
472	0.19
473	0.2
474	0.21
475	0.23
476	0.27
477	0.32
478	0.33
479	0.32
480	0.33
481	0.35
482	0.38
483	0.41
484	0.41
485	0.42
486	0.46
487	0.52
488	0.54
489	0.56
490	0.56
491	0.52
492	0.47
493	0.45
494	0.43
495	0.35
496	0.32
497	0.28
498	0.24
499	0.22
500	0.19
501	0.16
502	0.11
503	0.1
504	0.09
505	0.11
506	0.1
507	0.1
508	0.12
509	0.12
510	0.14
511	0.15
512	0.14
513	0.12
514	0.11
515	0.11
516	0.09
517	0.09
518	0.08
519	0.12
520	0.19
521	0.2
522	0.23
523	0.24
524	0.25
525	0.3
526	0.32
527	0.28
528	0.24
529	0.22
530	0.21
531	0.2
532	0.2
533	0.15
534	0.11
535	0.08
536	0.06
537	0.06
538	0.06
539	0.07
540	0.09
541	0.1
542	0.12
543	0.14
544	0.2
545	0.26
546	0.3
547	0.29
548	0.28
549	0.27
550	0.34
551	0.32
552	0.3
553	0.28
554	0.29
555	0.3
556	0.3
557	0.32
558	0.26
559	0.26
560	0.26
561	0.27
562	0.29
563	0.28
564	0.31
565	0.29
566	0.28
567	0.29
568	0.28
569	0.26
570	0.22
571	0.21
572	0.2
573	0.2
574	0.2
575	0.22
576	0.21
577	0.18
578	0.16
579	0.15
580	0.14
581	0.15
582	0.16
583	0.14
584	0.17
585	0.18
586	0.19
587	0.19
588	0.19
589	0.18
590	0.21
591	0.28
592	0.27
593	0.36
594	0.45
595	0.55
596	0.63
597	0.73
598	0.79
599	0.81
600	0.89
601	0.89
602	0.9
603	0.86
604	0.87
605	0.86
606	0.87
607	0.84
608	0.77
609	0.74
610	0.65
611	0.62
612	0.56
613	0.47
614	0.38
615	0.32
616	0.31
617	0.23
618	0.24
619	0.21
620	0.17
621	0.16
622	0.13
623	0.12
624	0.1
625	0.1
626	0.09
627	0.08
628	0.08
629	0.09
630	0.11
631	0.1
632	0.1
633	0.1
634	0.09
635	0.13
636	0.17
637	0.21
638	0.23
639	0.27
640	0.28
641	0.29
642	0.28
643	0.24
644	0.23
645	0.19
646	0.17
647	0.19
648	0.17
649	0.17
650	0.17
651	0.17
652	0.14
653	0.14
654	0.16
655	0.13
656	0.14
657	0.14
658	0.14
659	0.16
660	0.18
661	0.19
662	0.16
663	0.16
664	0.23
665	0.33
666	0.41
667	0.45
668	0.5
669	0.5
670	0.5
671	0.48
672	0.44
673	0.35
674	0.34
675	0.31
676	0.24
677	0.23
678	0.23
679	0.21
680	0.19
681	0.21
682	0.14
683	0.11
684	0.11
685	0.11
686	0.12
687	0.14
688	0.15
689	0.13
690	0.11
691	0.12
692	0.12
693	0.14
694	0.15
695	0.13
696	0.12
697	0.11
698	0.11
699	0.12
700	0.11
701	0.12
702	0.12
703	0.13
704	0.13
705	0.18
706	0.18
707	0.2
708	0.23
709	0.19
710	0.17
711	0.17
712	0.17
713	0.13
714	0.14
715	0.11
716	0.1
717	0.12
718	0.13
719	0.12
720	0.11
721	0.1
722	0.09
723	0.08
724	0.08
725	0.07
726	0.06
727	0.06
728	0.07
729	0.07
730	0.08
731	0.09
732	0.12
733	0.17
734	0.23
735	0.28
736	0.32
737	0.36
738	0.43
739	0.51
740	0.52
741	0.51
742	0.51
743	0.52
744	0.51
745	0.53
746	0.51
747	0.47
748	0.47
749	0.47
750	0.42
751	0.37
752	0.4
753	0.36
754	0.39
755	0.43
756	0.39
757	0.4
758	0.43
759	0.45
760	0.42
761	0.41
762	0.38
763	0.31
764	0.31
765	0.3
766	0.32
767	0.34
768	0.41
769	0.44
770	0.46
771	0.47
772	0.48
773	0.45
774	0.47
775	0.47
776	0.45
777	0.43
778	0.41
779	0.42
780	0.42
781	0.44
782	0.39
783	0.36
784	0.31
785	0.3
786	0.27
787	0.23
788	0.2
789	0.17
790	0.17
791	0.15
792	0.12
793	0.13
794	0.14
795	0.14
796	0.15
797	0.16
798	0.14
799	0.14
800	0.15
801	0.12
802	0.13
803	0.15
804	0.14
805	0.16
806	0.15
807	0.18
808	0.22
809	0.23
810	0.28
811	0.32
812	0.34
813	0.4
814	0.46
815	0.44
816	0.42
817	0.5
818	0.47
819	0.45
820	0.49
821	0.43
822	0.4
823	0.42
824	0.4
825	0.32
826	0.31
827	0.26
828	0.21
829	0.23
830	0.25
831	0.26

H2APC4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer