Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2ATA1

Protein Details
Accession H2ATA1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-35ISMLGIQKRHGKKKSASEEHRPANRVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-23HGKKK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito 10, cyto_nucl 9.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035189  Std1/Mth1  
KEGG kaf:KAFR_0C06100  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17235  STD1  
Amino Acid Sequences MFVSPSPSNISMLGIQKRHGKKKSASEEHRPANRVDEKQEYHENDVHEHLRKEANFVNAPPEYADRARLEIKKRLLPNQKNLPNHSRNNNDISDAYSISTTVDSQSSFSSDAASSIFSQPSTIFSQTTNDSVPLTHSKFITQLSLEEALPKTFFDMYSPEVLMSDPSKVLYNGRPSFTKRELLDWDLNDVRSLLIVENLRPEWGHQLPEIINRTAPSLPKFRFQLLPLNSADTVIIQTLVNSDLYLEANIDYEFKLTSAKYTVAAARKRHEQIVGVHEPIMTLSKPEWRNIIENYLLNIAVEAQCRFDFKNHCNEFKKWKSEQHSLNLKKPDMPPPRMIPTTLNKNSSLLKKTLMKNLQLKNFQENKDSIAINTSNYNDGPSDNVYTTNHKITLTKEEKASIWSQCQTQVYQRLELDWKPDGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.34
3 0.42
4 0.51
5 0.59
6 0.61
7 0.63
8 0.64
9 0.74
10 0.81
11 0.82
12 0.81
13 0.82
14 0.85
15 0.86
16 0.85
17 0.76
18 0.66
19 0.65
20 0.64
21 0.58
22 0.54
23 0.53
24 0.49
25 0.53
26 0.61
27 0.55
28 0.53
29 0.52
30 0.48
31 0.42
32 0.43
33 0.42
34 0.39
35 0.35
36 0.33
37 0.36
38 0.34
39 0.37
40 0.36
41 0.38
42 0.35
43 0.35
44 0.39
45 0.32
46 0.32
47 0.29
48 0.27
49 0.25
50 0.23
51 0.27
52 0.22
53 0.25
54 0.31
55 0.36
56 0.4
57 0.43
58 0.48
59 0.51
60 0.54
61 0.61
62 0.65
63 0.67
64 0.71
65 0.74
66 0.76
67 0.75
68 0.77
69 0.77
70 0.75
71 0.74
72 0.72
73 0.68
74 0.64
75 0.64
76 0.57
77 0.5
78 0.41
79 0.36
80 0.3
81 0.24
82 0.2
83 0.14
84 0.13
85 0.11
86 0.11
87 0.09
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.09
92 0.1
93 0.11
94 0.12
95 0.11
96 0.12
97 0.11
98 0.11
99 0.11
100 0.11
101 0.11
102 0.12
103 0.13
104 0.11
105 0.12
106 0.11
107 0.14
108 0.17
109 0.16
110 0.14
111 0.14
112 0.18
113 0.18
114 0.2
115 0.17
116 0.14
117 0.13
118 0.13
119 0.16
120 0.19
121 0.2
122 0.21
123 0.2
124 0.2
125 0.22
126 0.22
127 0.21
128 0.15
129 0.13
130 0.14
131 0.16
132 0.15
133 0.16
134 0.16
135 0.14
136 0.14
137 0.13
138 0.12
139 0.1
140 0.1
141 0.08
142 0.1
143 0.11
144 0.13
145 0.14
146 0.12
147 0.12
148 0.12
149 0.12
150 0.1
151 0.09
152 0.07
153 0.08
154 0.08
155 0.09
156 0.11
157 0.14
158 0.23
159 0.25
160 0.27
161 0.29
162 0.31
163 0.38
164 0.38
165 0.4
166 0.31
167 0.33
168 0.34
169 0.36
170 0.37
171 0.3
172 0.31
173 0.27
174 0.26
175 0.22
176 0.19
177 0.13
178 0.1
179 0.1
180 0.06
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.12
190 0.13
191 0.14
192 0.12
193 0.14
194 0.15
195 0.19
196 0.21
197 0.16
198 0.16
199 0.15
200 0.17
201 0.16
202 0.17
203 0.16
204 0.2
205 0.21
206 0.24
207 0.26
208 0.26
209 0.27
210 0.27
211 0.33
212 0.28
213 0.31
214 0.28
215 0.28
216 0.26
217 0.23
218 0.22
219 0.13
220 0.11
221 0.06
222 0.07
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.07
243 0.06
244 0.08
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.11
249 0.16
250 0.21
251 0.27
252 0.29
253 0.31
254 0.37
255 0.39
256 0.4
257 0.37
258 0.33
259 0.32
260 0.36
261 0.36
262 0.29
263 0.28
264 0.25
265 0.24
266 0.21
267 0.18
268 0.1
269 0.08
270 0.08
271 0.16
272 0.17
273 0.19
274 0.22
275 0.22
276 0.26
277 0.27
278 0.3
279 0.25
280 0.24
281 0.24
282 0.22
283 0.2
284 0.16
285 0.14
286 0.11
287 0.1
288 0.11
289 0.09
290 0.1
291 0.11
292 0.13
293 0.14
294 0.18
295 0.23
296 0.26
297 0.37
298 0.39
299 0.48
300 0.51
301 0.55
302 0.6
303 0.62
304 0.67
305 0.61
306 0.65
307 0.64
308 0.68
309 0.7
310 0.69
311 0.71
312 0.69
313 0.71
314 0.69
315 0.62
316 0.59
317 0.57
318 0.58
319 0.56
320 0.55
321 0.54
322 0.53
323 0.59
324 0.55
325 0.52
326 0.47
327 0.46
328 0.52
329 0.51
330 0.48
331 0.42
332 0.43
333 0.47
334 0.49
335 0.45
336 0.36
337 0.36
338 0.41
339 0.45
340 0.52
341 0.53
342 0.54
343 0.58
344 0.64
345 0.67
346 0.66
347 0.64
348 0.65
349 0.67
350 0.61
351 0.58
352 0.51
353 0.46
354 0.44
355 0.41
356 0.31
357 0.29
358 0.27
359 0.23
360 0.25
361 0.23
362 0.21
363 0.2
364 0.22
365 0.16
366 0.16
367 0.18
368 0.17
369 0.19
370 0.17
371 0.19
372 0.2
373 0.26
374 0.3
375 0.32
376 0.3
377 0.28
378 0.3
379 0.31
380 0.4
381 0.39
382 0.39
383 0.38
384 0.39
385 0.39
386 0.41
387 0.42
388 0.36
389 0.37
390 0.36
391 0.36
392 0.38
393 0.4
394 0.39
395 0.42
396 0.46
397 0.43
398 0.46
399 0.44
400 0.43
401 0.45
402 0.44
403 0.42