FuNGI

H2AXC4

Protein Details

Accession

H2AXC4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
8-30	ASLPNSEKVNSKKKKPLDFDETY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 12, cyto 2.5, cysk 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039900 Pat1-like IPR019167 PAT1_dom
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0003723 F:RNA binding GO:0000290 P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA
KEGG	kaf:KAFR_0F04290 -
Pfam	View protein in Pfam PF09770 PAT1

Amino Acid Sequences

MSFFGFDASLPNSEKVNSKKKKPLDFDETYKGLGDYELEENDYLNNETFGANVELGTDFDFGHGDSTPVSNPDVPHRSYVAAASTGMNVPQENLDTTIDLKPMESLWGGSGHNNQQVMQQPIQPAEPQILSMEEIERQQRQLQMNPSMQQQGGYVMPPPGFMQQQGPPGNMNNQFPNQFPPQFVPPGMPNQPQFQQIPQDFHQQMYQPPNQQFHPQQMNVPPFQHPQAIEQQQQQQPRPNIQSPQEIQPNQAIQQQPNEAMKSPSVEQEAMKSSVQQQHLQSRLSPQQHRPRTSSMSRQQHQQQRREPPSAEEQKRLQIRHAKVEKILKHSGLMTPRDKDFITRYQLSQIVTEDPYNEDFYFQVYKIIQRGGVVGESNKGLIARAYLEHSGHRLGGRYKRADIALQRMQSQVEKAVTVAKERPHKNALEINDLDKNSEHGRDGVLGKISSTLNSKAPRRQLQIPLKSANSNDNSTSSLGSPIQGNNMMNAATSGALEEVTESLGNVDINAKSRVRRRSSYAFTSVDQNSVLSRSGGRKFVLRLIETVYGEVLELEANLRSGKKIDNNKLWDALHIDDEAYEVCPFVSMLSFDKGVKIMPRIFNFLNKEQKLKLLQIFFSELSHLNIIIISSYKTNPTPSESQLKQIDLFQTVFLKIIVSFLSNNSNFIEIMGLLLHLIKNNNVSFISTSKIGLNLITVLISRAALIRQDSNRSNILSSPEISTWNEIYDKLFTSLESKLSLIFPPKEYTNKIISITNDPQFLQDDTELNLCYYDQAYIWQFLASLALSGKLNHQRIIIDEVRDEIFGTITLAESLKSVNSNDSTYRREKLYQDLNLFLNVMGLVSRDGEITELK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.35
3	0.43
4	0.48
5	0.55
6	0.64
7	0.72
8	0.8
9	0.81
10	0.82
11	0.81
12	0.79
13	0.77
14	0.75
15	0.68
16	0.59
17	0.51
18	0.42
19	0.32
20	0.25
21	0.19
22	0.14
23	0.15
24	0.15
25	0.15
26	0.15
27	0.15
28	0.16
29	0.17
30	0.15
31	0.12
32	0.12
33	0.11
34	0.11
35	0.11
36	0.13
37	0.13
38	0.11
39	0.1
40	0.11
41	0.11
42	0.11
43	0.13
44	0.11
45	0.08
46	0.09
47	0.09
48	0.08
49	0.09
50	0.09
51	0.08
52	0.08
53	0.1
54	0.11
55	0.12
56	0.15
57	0.16
58	0.17
59	0.26
60	0.31
61	0.31
62	0.33
63	0.33
64	0.32
65	0.3
66	0.31
67	0.24
68	0.19
69	0.19
70	0.16
71	0.16
72	0.15
73	0.15
74	0.14
75	0.12
76	0.11
77	0.12
78	0.13
79	0.12
80	0.14
81	0.14
82	0.13
83	0.16
84	0.17
85	0.17
86	0.16
87	0.15
88	0.13
89	0.13
90	0.14
91	0.12
92	0.1
93	0.1
94	0.13
95	0.14
96	0.16
97	0.21
98	0.23
99	0.27
100	0.27
101	0.26
102	0.28
103	0.34
104	0.37
105	0.33
106	0.32
107	0.31
108	0.32
109	0.33
110	0.29
111	0.23
112	0.21
113	0.19
114	0.16
115	0.14
116	0.14
117	0.13
118	0.13
119	0.13
120	0.12
121	0.14
122	0.18
123	0.19
124	0.2
125	0.23
126	0.28
127	0.31
128	0.36
129	0.4
130	0.44
131	0.47
132	0.47
133	0.47
134	0.44
135	0.4
136	0.34
137	0.27
138	0.22
139	0.18
140	0.16
141	0.15
142	0.13
143	0.13
144	0.13
145	0.14
146	0.15
147	0.15
148	0.15
149	0.18
150	0.19
151	0.28
152	0.29
153	0.29
154	0.28
155	0.29
156	0.35
157	0.35
158	0.34
159	0.3
160	0.32
161	0.32
162	0.32
163	0.35
164	0.34
165	0.32
166	0.3
167	0.3
168	0.31
169	0.32
170	0.31
171	0.28
172	0.24
173	0.3
174	0.34
175	0.34
176	0.32
177	0.33
178	0.35
179	0.36
180	0.35
181	0.31
182	0.35
183	0.33
184	0.37
185	0.35
186	0.42
187	0.39
188	0.38
189	0.38
190	0.31
191	0.34
192	0.36
193	0.38
194	0.36
195	0.4
196	0.42
197	0.41
198	0.46
199	0.43
200	0.44
201	0.47
202	0.41
203	0.42
204	0.45
205	0.48
206	0.44
207	0.43
208	0.38
209	0.33
210	0.33
211	0.32
212	0.25
213	0.25
214	0.31
215	0.35
216	0.35
217	0.37
218	0.44
219	0.45
220	0.5
221	0.5
222	0.5
223	0.48
224	0.52
225	0.54
226	0.5
227	0.51
228	0.49
229	0.53
230	0.48
231	0.51
232	0.52
233	0.46
234	0.43
235	0.41
236	0.39
237	0.32
238	0.34
239	0.29
240	0.23
241	0.26
242	0.26
243	0.26
244	0.27
245	0.27
246	0.23
247	0.22
248	0.21
249	0.2
250	0.19
251	0.18
252	0.18
253	0.18
254	0.17
255	0.19
256	0.21
257	0.21
258	0.2
259	0.18
260	0.21
261	0.26
262	0.29
263	0.3
264	0.3
265	0.35
266	0.39
267	0.39
268	0.34
269	0.34
270	0.39
271	0.42
272	0.44
273	0.46
274	0.53
275	0.6
276	0.64
277	0.62
278	0.6
279	0.6
280	0.6
281	0.6
282	0.6
283	0.61
284	0.59
285	0.62
286	0.65
287	0.67
288	0.7
289	0.69
290	0.67
291	0.68
292	0.72
293	0.7
294	0.62
295	0.57
296	0.59
297	0.6
298	0.55
299	0.49
300	0.45
301	0.47
302	0.51
303	0.48
304	0.44
305	0.42
306	0.42
307	0.47
308	0.5
309	0.45
310	0.45
311	0.52
312	0.5
313	0.48
314	0.48
315	0.38
316	0.34
317	0.33
318	0.32
319	0.3
320	0.31
321	0.27
322	0.27
323	0.27
324	0.28
325	0.27
326	0.25
327	0.24
328	0.25
329	0.28
330	0.28
331	0.28
332	0.29
333	0.31
334	0.3
335	0.26
336	0.22
337	0.17
338	0.16
339	0.16
340	0.13
341	0.12
342	0.13
343	0.14
344	0.13
345	0.11
346	0.1
347	0.12
348	0.13
349	0.11
350	0.13
351	0.11
352	0.13
353	0.14
354	0.14
355	0.13
356	0.11
357	0.12
358	0.1
359	0.1
360	0.09
361	0.08
362	0.08
363	0.08
364	0.07
365	0.07
366	0.06
367	0.06
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.06
372	0.08
373	0.09
374	0.1
375	0.1
376	0.11
377	0.11
378	0.11
379	0.11
380	0.11
381	0.15
382	0.21
383	0.26
384	0.27
385	0.27
386	0.28
387	0.29
388	0.29
389	0.27
390	0.29
391	0.28
392	0.26
393	0.26
394	0.25
395	0.25
396	0.22
397	0.21
398	0.15
399	0.11
400	0.1
401	0.09
402	0.12
403	0.12
404	0.13
405	0.16
406	0.18
407	0.26
408	0.27
409	0.31
410	0.31
411	0.31
412	0.33
413	0.34
414	0.32
415	0.3
416	0.29
417	0.27
418	0.27
419	0.26
420	0.24
421	0.19
422	0.19
423	0.13
424	0.14
425	0.12
426	0.09
427	0.09
428	0.11
429	0.12
430	0.11
431	0.11
432	0.1
433	0.1
434	0.12
435	0.11
436	0.1
437	0.12
438	0.12
439	0.15
440	0.2
441	0.23
442	0.26
443	0.34
444	0.38
445	0.41
446	0.45
447	0.51
448	0.55
449	0.59
450	0.59
451	0.54
452	0.5
453	0.47
454	0.42
455	0.37
456	0.31
457	0.25
458	0.22
459	0.2
460	0.2
461	0.19
462	0.19
463	0.13
464	0.12
465	0.11
466	0.11
467	0.11
468	0.09
469	0.1
470	0.12
471	0.11
472	0.1
473	0.1
474	0.1
475	0.08
476	0.08
477	0.07
478	0.04
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.04
486	0.04
487	0.04
488	0.04
489	0.04
490	0.04
491	0.04
492	0.04
493	0.06
494	0.06
495	0.09
496	0.11
497	0.12
498	0.16
499	0.23
500	0.32
501	0.36
502	0.38
503	0.43
504	0.49
505	0.54
506	0.56
507	0.55
508	0.49
509	0.44
510	0.46
511	0.4
512	0.32
513	0.26
514	0.2
515	0.15
516	0.14
517	0.13
518	0.08
519	0.09
520	0.14
521	0.16
522	0.19
523	0.19
524	0.21
525	0.22
526	0.26
527	0.29
528	0.24
529	0.23
530	0.23
531	0.26
532	0.24
533	0.22
534	0.17
535	0.13
536	0.12
537	0.11
538	0.07
539	0.04
540	0.03
541	0.04
542	0.04
543	0.04
544	0.05
545	0.06
546	0.06
547	0.07
548	0.11
549	0.18
550	0.27
551	0.35
552	0.43
553	0.48
554	0.5
555	0.52
556	0.49
557	0.43
558	0.36
559	0.29
560	0.22
561	0.16
562	0.14
563	0.1
564	0.11
565	0.1
566	0.08
567	0.07
568	0.05
569	0.05
570	0.05
571	0.05
572	0.05
573	0.05
574	0.05
575	0.08
576	0.09
577	0.11
578	0.11
579	0.12
580	0.12
581	0.12
582	0.14
583	0.16
584	0.2
585	0.25
586	0.27
587	0.31
588	0.32
589	0.37
590	0.4
591	0.43
592	0.47
593	0.43
594	0.45
595	0.4
596	0.44
597	0.41
598	0.4
599	0.38
600	0.32
601	0.31
602	0.29
603	0.32
604	0.27
605	0.24
606	0.22
607	0.17
608	0.16
609	0.16
610	0.13
611	0.1
612	0.1
613	0.09
614	0.08
615	0.07
616	0.06
617	0.08
618	0.09
619	0.11
620	0.12
621	0.15
622	0.16
623	0.21
624	0.24
625	0.27
626	0.35
627	0.33
628	0.39
629	0.4
630	0.4
631	0.35
632	0.34
633	0.32
634	0.26
635	0.25
636	0.2
637	0.18
638	0.17
639	0.16
640	0.13
641	0.12
642	0.09
643	0.09
644	0.08
645	0.08
646	0.08
647	0.1
648	0.17
649	0.17
650	0.18
651	0.18
652	0.19
653	0.17
654	0.17
655	0.16
656	0.08
657	0.08
658	0.07
659	0.06
660	0.05
661	0.06
662	0.06
663	0.07
664	0.08
665	0.09
666	0.14
667	0.14
668	0.16
669	0.16
670	0.17
671	0.17
672	0.17
673	0.19
674	0.15
675	0.16
676	0.14
677	0.15
678	0.14
679	0.12
680	0.12
681	0.1
682	0.09
683	0.08
684	0.07
685	0.07
686	0.07
687	0.07
688	0.07
689	0.07
690	0.07
691	0.09
692	0.11
693	0.17
694	0.2
695	0.27
696	0.29
697	0.32
698	0.35
699	0.34
700	0.33
701	0.29
702	0.3
703	0.26
704	0.25
705	0.24
706	0.22
707	0.24
708	0.24
709	0.25
710	0.21
711	0.2
712	0.2
713	0.17
714	0.18
715	0.18
716	0.18
717	0.17
718	0.17
719	0.15
720	0.17
721	0.19
722	0.19
723	0.18
724	0.16
725	0.15
726	0.16
727	0.19
728	0.23
729	0.24
730	0.25
731	0.27
732	0.31
733	0.35
734	0.37
735	0.4
736	0.38
737	0.38
738	0.37
739	0.37
740	0.36
741	0.39
742	0.42
743	0.4
744	0.37
745	0.34
746	0.33
747	0.32
748	0.3
749	0.25
750	0.2
751	0.18
752	0.18
753	0.2
754	0.19
755	0.16
756	0.16
757	0.13
758	0.12
759	0.12
760	0.1
761	0.08
762	0.12
763	0.15
764	0.16
765	0.17
766	0.15
767	0.15
768	0.14
769	0.15
770	0.1
771	0.09
772	0.08
773	0.09
774	0.1
775	0.1
776	0.18
777	0.26
778	0.28
779	0.29
780	0.3
781	0.29
782	0.32
783	0.39
784	0.35
785	0.29
786	0.27
787	0.28
788	0.27
789	0.26
790	0.24
791	0.16
792	0.12
793	0.1
794	0.11
795	0.08
796	0.08
797	0.09
798	0.08
799	0.08
800	0.08
801	0.09
802	0.09
803	0.11
804	0.12
805	0.16
806	0.18
807	0.21
808	0.27
809	0.32
810	0.37
811	0.4
812	0.43
813	0.42
814	0.46
815	0.46
816	0.49
817	0.53
818	0.55
819	0.54
820	0.54
821	0.51
822	0.47
823	0.44
824	0.34
825	0.25
826	0.17
827	0.13
828	0.08
829	0.08
830	0.07
831	0.08
832	0.08
833	0.08
834	0.08

H2AXC4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer