Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2AQJ8

Protein Details
Accession H2AQJ8    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-79VFDISVKGKREKKSKKDKKDKKSKKDKKVKKPAKDRKLKLERKLKKHKKQTKGYTEDVKHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-69KGKREKKSKKDKKDKKSKKDKKVKKPAKDRKLKLERKLKKHKKQ
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014720  dsRBD_dom  
IPR040540  RNase_3_N  
IPR011907  RNase_III  
IPR000999  RNase_III_dom  
IPR036389  RNase_III_sf  
IPR044449  Rnt1/Pac1_DSRM_fungi  
Gene Ontology GO:0003725  F:double-stranded RNA binding  
GO:0004525  F:ribonuclease III activity  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG kaf:KAFR_0B03510  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00035  dsrm  
PF00636  Ribonuclease_3  
PF18497  RNase_3_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50137  DS_RBD  
PS50142  RNASE_3_2  
CDD cd19876  DSRM_RNT1p-like  
cd00593  RIBOc  
Amino Acid Sequences MDNKGTVTKRKIDKVEEEEVFDISVKGKREKKSKKDKKDKKSKKDKKVKKPAKDRKLKLERKLKKHKKQTKGYTEDVKHGEGDDPVEVFSKSKKSQSLSKPNPASDEPSEIQEGSDRSGAIGADDTFLTPYTYSEAIQLEYAVTKFIDSYKRIIELSPNFAAYADTVNNQEKIDIELLPILSRYKLKLAAELKSLHMENGSPAFTELLNYEKKFARPDNRPLIGELQQEHLASGIEYDASKTKKLEVLTNDDRHDENNINNAQSSAENTSLLHSTESVSTDKSVWPPQIPEIKNPALKARVFIHKSTINDKLFLTEEEMLHAHNERLEFMGDSVLNALVTNIIYNQFPQYGDGQLSKLRIELVNNERLKEWASMYGLDKKLRFKELSERARSKFLNGKQKLHADVFEAYIGALMEEDPKGNLLNIREWLRKLVQPTINDVTKKEVSLEETNELDINAKRRLYSLIGYAALKLQYVTVQKPTKNDPNCIVECRIGDGTILGKGIARNMKLAGIKAAEDVLSKKDIVEKYANIRASIPRSESVVSNNSFPNKRRKVSASASNDSEQNERDTQRVFFQKESDFPSTPTTNPDSLQAPDICSEEISLLQVVKKGKITLGPDGDFNLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.72
3 0.64
4 0.6
5 0.52
6 0.45
7 0.39
8 0.3
9 0.23
10 0.16
11 0.19
12 0.19
13 0.26
14 0.33
15 0.41
16 0.52
17 0.62
18 0.7
19 0.78
20 0.85
21 0.88
22 0.93
23 0.95
24 0.95
25 0.96
26 0.96
27 0.96
28 0.97
29 0.96
30 0.96
31 0.96
32 0.96
33 0.96
34 0.96
35 0.95
36 0.95
37 0.95
38 0.95
39 0.95
40 0.95
41 0.91
42 0.91
43 0.92
44 0.9
45 0.89
46 0.89
47 0.88
48 0.88
49 0.92
50 0.91
51 0.91
52 0.93
53 0.93
54 0.93
55 0.93
56 0.94
57 0.93
58 0.89
59 0.86
60 0.85
61 0.78
62 0.75
63 0.67
64 0.57
65 0.47
66 0.4
67 0.34
68 0.25
69 0.23
70 0.17
71 0.14
72 0.13
73 0.13
74 0.13
75 0.12
76 0.15
77 0.21
78 0.22
79 0.28
80 0.33
81 0.36
82 0.45
83 0.55
84 0.63
85 0.64
86 0.72
87 0.72
88 0.68
89 0.69
90 0.61
91 0.57
92 0.48
93 0.46
94 0.37
95 0.34
96 0.34
97 0.28
98 0.26
99 0.24
100 0.22
101 0.17
102 0.17
103 0.14
104 0.13
105 0.14
106 0.13
107 0.1
108 0.11
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.08
114 0.09
115 0.09
116 0.07
117 0.07
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.13
122 0.13
123 0.13
124 0.13
125 0.13
126 0.1
127 0.11
128 0.1
129 0.09
130 0.08
131 0.07
132 0.07
133 0.11
134 0.17
135 0.17
136 0.21
137 0.22
138 0.25
139 0.25
140 0.25
141 0.29
142 0.27
143 0.31
144 0.29
145 0.27
146 0.25
147 0.25
148 0.24
149 0.17
150 0.15
151 0.1
152 0.1
153 0.13
154 0.15
155 0.16
156 0.16
157 0.16
158 0.13
159 0.15
160 0.15
161 0.12
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.09
168 0.1
169 0.11
170 0.11
171 0.13
172 0.17
173 0.17
174 0.24
175 0.27
176 0.28
177 0.31
178 0.31
179 0.3
180 0.29
181 0.28
182 0.21
183 0.18
184 0.15
185 0.13
186 0.13
187 0.12
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.09
192 0.1
193 0.09
194 0.1
195 0.14
196 0.14
197 0.17
198 0.19
199 0.21
200 0.25
201 0.31
202 0.35
203 0.39
204 0.48
205 0.54
206 0.55
207 0.54
208 0.51
209 0.49
210 0.44
211 0.4
212 0.31
213 0.25
214 0.23
215 0.22
216 0.2
217 0.16
218 0.12
219 0.09
220 0.08
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.05
225 0.09
226 0.11
227 0.12
228 0.12
229 0.14
230 0.17
231 0.18
232 0.22
233 0.22
234 0.3
235 0.36
236 0.4
237 0.39
238 0.38
239 0.37
240 0.32
241 0.31
242 0.24
243 0.17
244 0.2
245 0.2
246 0.19
247 0.18
248 0.18
249 0.16
250 0.14
251 0.15
252 0.1
253 0.1
254 0.09
255 0.1
256 0.11
257 0.1
258 0.11
259 0.09
260 0.07
261 0.08
262 0.08
263 0.1
264 0.09
265 0.09
266 0.1
267 0.1
268 0.11
269 0.13
270 0.15
271 0.15
272 0.15
273 0.16
274 0.2
275 0.28
276 0.27
277 0.28
278 0.32
279 0.34
280 0.35
281 0.34
282 0.32
283 0.28
284 0.27
285 0.26
286 0.23
287 0.28
288 0.29
289 0.28
290 0.3
291 0.29
292 0.31
293 0.32
294 0.36
295 0.28
296 0.27
297 0.27
298 0.24
299 0.21
300 0.2
301 0.19
302 0.12
303 0.12
304 0.12
305 0.12
306 0.1
307 0.1
308 0.1
309 0.08
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.08
315 0.07
316 0.07
317 0.08
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.06
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.06
333 0.07
334 0.07
335 0.08
336 0.09
337 0.09
338 0.11
339 0.11
340 0.11
341 0.12
342 0.13
343 0.12
344 0.11
345 0.11
346 0.1
347 0.11
348 0.17
349 0.2
350 0.28
351 0.28
352 0.28
353 0.28
354 0.27
355 0.28
356 0.23
357 0.19
358 0.13
359 0.13
360 0.14
361 0.16
362 0.23
363 0.24
364 0.25
365 0.26
366 0.28
367 0.31
368 0.33
369 0.32
370 0.27
371 0.35
372 0.42
373 0.49
374 0.53
375 0.56
376 0.53
377 0.58
378 0.56
379 0.5
380 0.48
381 0.46
382 0.48
383 0.47
384 0.5
385 0.49
386 0.53
387 0.53
388 0.46
389 0.39
390 0.31
391 0.28
392 0.24
393 0.18
394 0.14
395 0.1
396 0.1
397 0.09
398 0.06
399 0.04
400 0.04
401 0.05
402 0.05
403 0.06
404 0.05
405 0.06
406 0.06
407 0.07
408 0.09
409 0.1
410 0.12
411 0.16
412 0.21
413 0.24
414 0.24
415 0.27
416 0.28
417 0.28
418 0.29
419 0.33
420 0.33
421 0.32
422 0.37
423 0.39
424 0.41
425 0.39
426 0.37
427 0.34
428 0.31
429 0.3
430 0.25
431 0.2
432 0.22
433 0.25
434 0.27
435 0.23
436 0.22
437 0.22
438 0.21
439 0.2
440 0.17
441 0.15
442 0.16
443 0.18
444 0.18
445 0.17
446 0.18
447 0.21
448 0.21
449 0.21
450 0.2
451 0.2
452 0.21
453 0.21
454 0.2
455 0.2
456 0.17
457 0.15
458 0.12
459 0.09
460 0.11
461 0.14
462 0.16
463 0.23
464 0.28
465 0.3
466 0.34
467 0.41
468 0.47
469 0.49
470 0.51
471 0.48
472 0.51
473 0.52
474 0.52
475 0.47
476 0.4
477 0.36
478 0.35
479 0.3
480 0.22
481 0.19
482 0.16
483 0.14
484 0.12
485 0.12
486 0.08
487 0.09
488 0.09
489 0.14
490 0.18
491 0.17
492 0.18
493 0.18
494 0.22
495 0.23
496 0.23
497 0.21
498 0.18
499 0.18
500 0.17
501 0.17
502 0.13
503 0.13
504 0.13
505 0.13
506 0.14
507 0.13
508 0.13
509 0.19
510 0.2
511 0.24
512 0.27
513 0.28
514 0.33
515 0.4
516 0.41
517 0.35
518 0.36
519 0.37
520 0.37
521 0.37
522 0.34
523 0.29
524 0.3
525 0.31
526 0.29
527 0.29
528 0.31
529 0.28
530 0.28
531 0.31
532 0.35
533 0.39
534 0.42
535 0.48
536 0.5
537 0.53
538 0.57
539 0.59
540 0.61
541 0.64
542 0.69
543 0.67
544 0.64
545 0.65
546 0.59
547 0.56
548 0.49
549 0.44
550 0.35
551 0.32
552 0.31
553 0.28
554 0.29
555 0.29
556 0.29
557 0.34
558 0.41
559 0.39
560 0.36
561 0.4
562 0.42
563 0.44
564 0.49
565 0.48
566 0.41
567 0.39
568 0.44
569 0.41
570 0.38
571 0.39
572 0.37
573 0.32
574 0.32
575 0.33
576 0.29
577 0.28
578 0.33
579 0.28
580 0.25
581 0.25
582 0.26
583 0.23
584 0.2
585 0.19
586 0.14
587 0.13
588 0.12
589 0.12
590 0.12
591 0.13
592 0.16
593 0.18
594 0.21
595 0.24
596 0.24
597 0.25
598 0.3
599 0.33
600 0.38
601 0.42
602 0.4
603 0.38