Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2APN6

Protein Details
Accession H2APN6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
161-185DGRTVKSQAKQKKTKAKQSCTVHLFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038609  HDA1_su2/3_sf  
IPR021006  Hda2/3  
IPR026216  HDA3  
Gene Ontology GO:0070823  C:HDA1 complex  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
KEGG kaf:KAFR_0B00360  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11496  HDA2-3  
Amino Acid Sequences MDLLKILDTKPIPTIVDSQSLGVSGDVSGDYWLPTTMCLYQKKLTDEIISLHYSDILKYFETDDYKEDVILGSMRTMCLNSEYVATHPYLLIEHHMPKTLTTRDIPINLADTSGKFTVLRDLMTLVQEYETNTALVCRPGRTMDLLEALLLGNKVNIKRYDGRTVKSQAKQKKTKAKQSCTVHLFPSQDLDLQKFPINEKHHFDMLIAVDPTVDTNVDFIQEILTFSRDQSRNENKAPIVRLVTINSIDHCDLYFSKKFNKGSKDFLESTTAAVVVLRDSVGTLPPDLRPIYSQQLHYLTEWLEDPSLPWPLPDIYPLKRYNSMDVERSLLNEVNFNEADDLETAFANNSKKRHRHPDETTDVNKKDGPTKSFYELKRLKNDYLANPINQGMANLAGIVTGNVKDSINYHLSSNILTHKLIQIMGQVYVDINRETQELDDYSTLNGLENDHVSFYQQEKETMSKKLQTRMDEINESNEKSISMEFTNKEKFELIEKIEIEIEGLLKKVEAKDTGLKNLFISVGDLKDEIDKETRQNESKLTEKEYMEKEIERAQTATNELEVEMEKVLKDFENVQNELREIKLNQELKKDGAIERIENLKRAIVEEKLVYDDLESKLNSLVGKLKNFPPPRIRVTTNTTRRRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.26
3 0.31
4 0.29
5 0.28
6 0.25
7 0.24
8 0.22
9 0.16
10 0.13
11 0.08
12 0.08
13 0.07
14 0.07
15 0.07
16 0.07
17 0.08
18 0.08
19 0.09
20 0.08
21 0.08
22 0.11
23 0.15
24 0.22
25 0.26
26 0.31
27 0.35
28 0.4
29 0.44
30 0.45
31 0.43
32 0.39
33 0.36
34 0.34
35 0.33
36 0.29
37 0.25
38 0.22
39 0.22
40 0.2
41 0.18
42 0.18
43 0.15
44 0.14
45 0.15
46 0.17
47 0.18
48 0.21
49 0.22
50 0.23
51 0.25
52 0.25
53 0.24
54 0.22
55 0.17
56 0.15
57 0.15
58 0.13
59 0.11
60 0.11
61 0.12
62 0.12
63 0.12
64 0.12
65 0.13
66 0.14
67 0.12
68 0.14
69 0.14
70 0.15
71 0.16
72 0.16
73 0.14
74 0.12
75 0.12
76 0.11
77 0.1
78 0.13
79 0.16
80 0.21
81 0.22
82 0.26
83 0.25
84 0.26
85 0.32
86 0.31
87 0.31
88 0.28
89 0.31
90 0.31
91 0.33
92 0.33
93 0.28
94 0.28
95 0.23
96 0.23
97 0.19
98 0.15
99 0.17
100 0.16
101 0.16
102 0.13
103 0.13
104 0.19
105 0.19
106 0.19
107 0.15
108 0.17
109 0.17
110 0.19
111 0.19
112 0.12
113 0.11
114 0.12
115 0.12
116 0.12
117 0.11
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.11
122 0.15
123 0.15
124 0.15
125 0.16
126 0.17
127 0.19
128 0.21
129 0.21
130 0.19
131 0.19
132 0.18
133 0.16
134 0.15
135 0.13
136 0.12
137 0.1
138 0.08
139 0.07
140 0.1
141 0.11
142 0.16
143 0.17
144 0.22
145 0.29
146 0.34
147 0.44
148 0.45
149 0.47
150 0.49
151 0.54
152 0.57
153 0.57
154 0.6
155 0.59
156 0.65
157 0.72
158 0.73
159 0.78
160 0.79
161 0.83
162 0.85
163 0.84
164 0.83
165 0.81
166 0.81
167 0.77
168 0.7
169 0.62
170 0.56
171 0.49
172 0.4
173 0.35
174 0.26
175 0.23
176 0.21
177 0.21
178 0.18
179 0.18
180 0.2
181 0.19
182 0.2
183 0.25
184 0.29
185 0.31
186 0.35
187 0.37
188 0.36
189 0.35
190 0.33
191 0.29
192 0.24
193 0.23
194 0.17
195 0.13
196 0.12
197 0.12
198 0.12
199 0.09
200 0.08
201 0.04
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.17
215 0.18
216 0.2
217 0.29
218 0.38
219 0.43
220 0.45
221 0.48
222 0.41
223 0.44
224 0.44
225 0.37
226 0.3
227 0.25
228 0.24
229 0.21
230 0.22
231 0.18
232 0.17
233 0.14
234 0.15
235 0.13
236 0.12
237 0.11
238 0.11
239 0.1
240 0.15
241 0.18
242 0.17
243 0.23
244 0.29
245 0.34
246 0.38
247 0.46
248 0.44
249 0.48
250 0.5
251 0.51
252 0.46
253 0.42
254 0.4
255 0.32
256 0.29
257 0.22
258 0.18
259 0.11
260 0.1
261 0.09
262 0.05
263 0.05
264 0.04
265 0.03
266 0.04
267 0.04
268 0.05
269 0.06
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.13
278 0.18
279 0.2
280 0.21
281 0.21
282 0.24
283 0.24
284 0.23
285 0.21
286 0.15
287 0.13
288 0.13
289 0.1
290 0.08
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.09
295 0.08
296 0.07
297 0.08
298 0.09
299 0.09
300 0.11
301 0.14
302 0.14
303 0.21
304 0.23
305 0.24
306 0.28
307 0.29
308 0.29
309 0.31
310 0.31
311 0.27
312 0.26
313 0.26
314 0.21
315 0.21
316 0.19
317 0.14
318 0.12
319 0.13
320 0.12
321 0.13
322 0.13
323 0.13
324 0.11
325 0.1
326 0.1
327 0.08
328 0.08
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.08
334 0.1
335 0.12
336 0.16
337 0.24
338 0.3
339 0.36
340 0.47
341 0.52
342 0.59
343 0.63
344 0.68
345 0.67
346 0.67
347 0.66
348 0.62
349 0.55
350 0.47
351 0.42
352 0.33
353 0.34
354 0.32
355 0.31
356 0.28
357 0.3
358 0.33
359 0.39
360 0.38
361 0.42
362 0.45
363 0.47
364 0.51
365 0.52
366 0.48
367 0.47
368 0.51
369 0.43
370 0.45
371 0.42
372 0.33
373 0.31
374 0.3
375 0.25
376 0.21
377 0.18
378 0.09
379 0.07
380 0.06
381 0.05
382 0.05
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.05
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.07
393 0.11
394 0.13
395 0.14
396 0.13
397 0.14
398 0.14
399 0.14
400 0.15
401 0.14
402 0.13
403 0.13
404 0.14
405 0.14
406 0.15
407 0.15
408 0.13
409 0.13
410 0.12
411 0.13
412 0.11
413 0.1
414 0.09
415 0.1
416 0.11
417 0.08
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.09
422 0.09
423 0.1
424 0.09
425 0.11
426 0.11
427 0.11
428 0.11
429 0.11
430 0.1
431 0.09
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.09
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.09
440 0.11
441 0.11
442 0.16
443 0.15
444 0.16
445 0.18
446 0.23
447 0.25
448 0.28
449 0.3
450 0.31
451 0.35
452 0.41
453 0.44
454 0.42
455 0.45
456 0.47
457 0.48
458 0.46
459 0.43
460 0.42
461 0.4
462 0.37
463 0.33
464 0.27
465 0.22
466 0.18
467 0.18
468 0.13
469 0.12
470 0.16
471 0.17
472 0.23
473 0.28
474 0.27
475 0.28
476 0.26
477 0.26
478 0.25
479 0.29
480 0.26
481 0.26
482 0.26
483 0.26
484 0.26
485 0.24
486 0.2
487 0.15
488 0.13
489 0.08
490 0.08
491 0.07
492 0.07
493 0.09
494 0.1
495 0.13
496 0.13
497 0.17
498 0.25
499 0.28
500 0.36
501 0.36
502 0.35
503 0.32
504 0.32
505 0.28
506 0.2
507 0.2
508 0.14
509 0.13
510 0.13
511 0.13
512 0.12
513 0.15
514 0.15
515 0.15
516 0.17
517 0.18
518 0.21
519 0.26
520 0.32
521 0.32
522 0.34
523 0.35
524 0.36
525 0.42
526 0.41
527 0.42
528 0.42
529 0.39
530 0.44
531 0.44
532 0.44
533 0.39
534 0.37
535 0.33
536 0.34
537 0.35
538 0.3
539 0.28
540 0.24
541 0.24
542 0.25
543 0.24
544 0.18
545 0.16
546 0.14
547 0.14
548 0.14
549 0.12
550 0.11
551 0.11
552 0.1
553 0.1
554 0.11
555 0.1
556 0.11
557 0.16
558 0.22
559 0.28
560 0.3
561 0.32
562 0.33
563 0.34
564 0.34
565 0.29
566 0.26
567 0.2
568 0.23
569 0.3
570 0.34
571 0.37
572 0.42
573 0.44
574 0.41
575 0.44
576 0.42
577 0.35
578 0.36
579 0.35
580 0.3
581 0.31
582 0.39
583 0.37
584 0.36
585 0.36
586 0.31
587 0.28
588 0.3
589 0.3
590 0.22
591 0.24
592 0.24
593 0.24
594 0.24
595 0.24
596 0.21
597 0.19
598 0.21
599 0.19
600 0.21
601 0.2
602 0.18
603 0.19
604 0.21
605 0.19
606 0.17
607 0.24
608 0.25
609 0.3
610 0.34
611 0.39
612 0.47
613 0.53
614 0.59
615 0.6
616 0.62
617 0.65
618 0.68
619 0.67
620 0.63
621 0.67
622 0.7
623 0.71