Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2APK3

Protein Details
Accession H2APK3    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
508-529EQWRVNKEKRKQQQALNLKNNNHydrophilic
586-631GQNSSTDKSKTKRPRKTKKTADSEESSQTKKKKVTKKKGAAGSTSVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
582-624KGKRGQNSSTDKSKTKRPRKTKKTADSEESSQTKKKKVTKKKG
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
KEGG kaf:KAFR_0A08690  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MNNDNSSVGIPVNVGSSSTAVNGGHALPVSTSPPTGGPVNIKQKTESNTNLTNFSSSNNMPNSQTASLNNLSQQIQAQLQQPNVTPQQKQRLLLQQRAIQQQRQQQAMQNYENQFYQLLTTLNRKPKRLYNFVEDTDSILKKYEQYRPSFEFHIYENNYKICAPANTRLQKQQKSPEISNNGLVLTKNNETLKEFLEYVARGRIPESIMEVLRDCNIQFYEANLILQVYDHTNTVDIVPKDQQETSQTKSDSTDLSPKKTQEEMNAERNQSDVNTSKEPSHQSQQQQQQQKRATAFKRPRVYRTLLKPNDLTNYYDMMTYADQARFSDHIYQQLESEVLILTKRNINLDVDLNPYEHTDKLDPNDFVEPVWDASKQKLEFVHREESNEDGTKGKVGHIEEHEDLPQHSSNYEQLMLIMSERTTTSTSSTFAASIARQAAATSPNVSGGSSGSALNRTDSGFISRSNSNTRNGNTSENQVSIAAAAVAAAVSSNMGNENNQFSRLKFIEQWRVNKEKRKQQQALNLKNNNGIAAIPFNTKISMTTPLTPVQQQLLQQKQQAQQLQKQMQNGDGSTSGKATQAKGKRGQNSSTDKSKTKRPRKTKKTADSEESSQTKKKKVTKKKGAAGSTSVGTPNSINTYTGSASDSNTPNI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.1
4 0.1
5 0.1
6 0.12
7 0.1
8 0.11
9 0.12
10 0.12
11 0.12
12 0.11
13 0.11
14 0.1
15 0.11
16 0.13
17 0.13
18 0.13
19 0.12
20 0.13
21 0.16
22 0.17
23 0.18
24 0.22
25 0.3
26 0.41
27 0.44
28 0.45
29 0.45
30 0.49
31 0.51
32 0.53
33 0.5
34 0.46
35 0.49
36 0.49
37 0.5
38 0.45
39 0.42
40 0.34
41 0.29
42 0.28
43 0.22
44 0.27
45 0.28
46 0.29
47 0.28
48 0.3
49 0.34
50 0.3
51 0.31
52 0.25
53 0.28
54 0.28
55 0.27
56 0.27
57 0.26
58 0.24
59 0.23
60 0.23
61 0.2
62 0.2
63 0.22
64 0.26
65 0.26
66 0.27
67 0.29
68 0.28
69 0.32
70 0.38
71 0.38
72 0.38
73 0.42
74 0.51
75 0.53
76 0.54
77 0.55
78 0.58
79 0.61
80 0.63
81 0.62
82 0.57
83 0.59
84 0.66
85 0.64
86 0.58
87 0.58
88 0.58
89 0.58
90 0.57
91 0.52
92 0.48
93 0.51
94 0.53
95 0.5
96 0.49
97 0.45
98 0.43
99 0.41
100 0.35
101 0.28
102 0.21
103 0.19
104 0.13
105 0.12
106 0.13
107 0.19
108 0.26
109 0.36
110 0.4
111 0.43
112 0.46
113 0.53
114 0.59
115 0.62
116 0.6
117 0.59
118 0.61
119 0.6
120 0.59
121 0.51
122 0.46
123 0.42
124 0.36
125 0.28
126 0.23
127 0.21
128 0.22
129 0.28
130 0.33
131 0.35
132 0.39
133 0.46
134 0.49
135 0.52
136 0.49
137 0.45
138 0.37
139 0.32
140 0.36
141 0.33
142 0.33
143 0.32
144 0.3
145 0.3
146 0.28
147 0.27
148 0.2
149 0.2
150 0.22
151 0.26
152 0.35
153 0.4
154 0.44
155 0.52
156 0.59
157 0.61
158 0.63
159 0.66
160 0.64
161 0.65
162 0.66
163 0.65
164 0.62
165 0.58
166 0.54
167 0.45
168 0.36
169 0.3
170 0.26
171 0.19
172 0.17
173 0.16
174 0.18
175 0.18
176 0.19
177 0.2
178 0.21
179 0.22
180 0.2
181 0.19
182 0.15
183 0.17
184 0.16
185 0.16
186 0.18
187 0.17
188 0.14
189 0.15
190 0.16
191 0.14
192 0.14
193 0.16
194 0.14
195 0.14
196 0.15
197 0.15
198 0.14
199 0.14
200 0.14
201 0.11
202 0.1
203 0.1
204 0.11
205 0.1
206 0.11
207 0.14
208 0.14
209 0.14
210 0.11
211 0.11
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.09
222 0.13
223 0.12
224 0.14
225 0.16
226 0.17
227 0.18
228 0.18
229 0.18
230 0.19
231 0.22
232 0.24
233 0.27
234 0.26
235 0.25
236 0.27
237 0.27
238 0.22
239 0.21
240 0.27
241 0.24
242 0.29
243 0.31
244 0.31
245 0.33
246 0.34
247 0.34
248 0.31
249 0.37
250 0.37
251 0.42
252 0.45
253 0.42
254 0.39
255 0.38
256 0.31
257 0.22
258 0.2
259 0.15
260 0.15
261 0.17
262 0.18
263 0.19
264 0.23
265 0.26
266 0.27
267 0.29
268 0.31
269 0.33
270 0.41
271 0.48
272 0.52
273 0.58
274 0.58
275 0.61
276 0.58
277 0.58
278 0.54
279 0.53
280 0.48
281 0.49
282 0.54
283 0.54
284 0.6
285 0.59
286 0.59
287 0.57
288 0.59
289 0.56
290 0.56
291 0.59
292 0.52
293 0.52
294 0.49
295 0.45
296 0.44
297 0.38
298 0.31
299 0.21
300 0.2
301 0.17
302 0.16
303 0.14
304 0.11
305 0.1
306 0.09
307 0.1
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.1
312 0.1
313 0.11
314 0.16
315 0.14
316 0.19
317 0.2
318 0.2
319 0.19
320 0.19
321 0.17
322 0.12
323 0.11
324 0.06
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.06
329 0.08
330 0.09
331 0.09
332 0.1
333 0.11
334 0.12
335 0.14
336 0.14
337 0.14
338 0.14
339 0.14
340 0.13
341 0.13
342 0.13
343 0.12
344 0.12
345 0.11
346 0.12
347 0.14
348 0.18
349 0.17
350 0.18
351 0.19
352 0.17
353 0.15
354 0.14
355 0.12
356 0.09
357 0.1
358 0.1
359 0.09
360 0.1
361 0.16
362 0.16
363 0.17
364 0.2
365 0.24
366 0.27
367 0.31
368 0.36
369 0.31
370 0.33
371 0.32
372 0.3
373 0.29
374 0.25
375 0.21
376 0.15
377 0.14
378 0.15
379 0.14
380 0.13
381 0.13
382 0.13
383 0.17
384 0.18
385 0.22
386 0.22
387 0.22
388 0.22
389 0.19
390 0.19
391 0.17
392 0.16
393 0.12
394 0.11
395 0.11
396 0.12
397 0.13
398 0.13
399 0.1
400 0.09
401 0.09
402 0.09
403 0.09
404 0.08
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.08
409 0.08
410 0.08
411 0.1
412 0.11
413 0.12
414 0.12
415 0.13
416 0.11
417 0.11
418 0.12
419 0.09
420 0.11
421 0.11
422 0.1
423 0.09
424 0.09
425 0.1
426 0.11
427 0.11
428 0.11
429 0.1
430 0.11
431 0.12
432 0.11
433 0.1
434 0.09
435 0.09
436 0.08
437 0.09
438 0.08
439 0.1
440 0.11
441 0.11
442 0.12
443 0.11
444 0.11
445 0.11
446 0.14
447 0.14
448 0.14
449 0.17
450 0.18
451 0.21
452 0.27
453 0.29
454 0.29
455 0.33
456 0.34
457 0.36
458 0.36
459 0.39
460 0.33
461 0.36
462 0.34
463 0.29
464 0.28
465 0.23
466 0.2
467 0.15
468 0.13
469 0.07
470 0.05
471 0.04
472 0.03
473 0.03
474 0.03
475 0.02
476 0.02
477 0.03
478 0.03
479 0.03
480 0.05
481 0.05
482 0.06
483 0.08
484 0.14
485 0.14
486 0.18
487 0.18
488 0.17
489 0.24
490 0.25
491 0.27
492 0.27
493 0.34
494 0.41
495 0.47
496 0.54
497 0.54
498 0.62
499 0.65
500 0.69
501 0.71
502 0.71
503 0.74
504 0.77
505 0.77
506 0.75
507 0.8
508 0.81
509 0.83
510 0.83
511 0.78
512 0.69
513 0.66
514 0.58
515 0.48
516 0.37
517 0.27
518 0.17
519 0.15
520 0.15
521 0.13
522 0.13
523 0.14
524 0.14
525 0.14
526 0.14
527 0.14
528 0.18
529 0.2
530 0.22
531 0.24
532 0.26
533 0.29
534 0.29
535 0.28
536 0.24
537 0.24
538 0.26
539 0.33
540 0.39
541 0.4
542 0.43
543 0.49
544 0.51
545 0.55
546 0.57
547 0.54
548 0.52
549 0.58
550 0.62
551 0.59
552 0.58
553 0.52
554 0.49
555 0.46
556 0.39
557 0.32
558 0.26
559 0.25
560 0.21
561 0.21
562 0.17
563 0.18
564 0.2
565 0.2
566 0.27
567 0.33
568 0.4
569 0.48
570 0.55
571 0.6
572 0.63
573 0.66
574 0.66
575 0.68
576 0.66
577 0.67
578 0.65
579 0.63
580 0.62
581 0.67
582 0.69
583 0.71
584 0.75
585 0.77
586 0.83
587 0.87
588 0.94
589 0.95
590 0.94
591 0.94
592 0.92
593 0.89
594 0.84
595 0.78
596 0.76
597 0.7
598 0.64
599 0.6
600 0.56
601 0.55
602 0.57
603 0.62
604 0.64
605 0.7
606 0.77
607 0.82
608 0.87
609 0.89
610 0.9
611 0.87
612 0.81
613 0.74
614 0.66
615 0.56
616 0.47
617 0.39
618 0.3
619 0.25
620 0.2
621 0.18
622 0.2
623 0.19
624 0.18
625 0.18
626 0.21
627 0.21
628 0.21
629 0.21
630 0.17
631 0.18
632 0.25