FuNGI

A0A1F5LPW7

Protein Details

Accession

A0A1F5LPW7

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-51	APPMRMRRPKAADPLVRPKRRPAPKPAGVPPAG	Hydrophilic
132-153	ESQFTRPVRLHRRDPRRGQDAH	Basic
506-531	ASGTDTSRKKPKKTNPTSQPPSRPMS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
20-51	PPMRMRRPKAADPLVRPKRRPAPKPAGVPPAG
407-427	REREARHVLGKSVRKALKRRE
458-500	EERKKAEAEKEKESSSKGTNTPSGRPKHTDPLKKSAAGRKRLG
513-518	RKKPKK

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSTPTNPSNARTPAGPNGAPPMRMRRPKAADPLVRPKRRPAPKPAGVPPAGRIATKTLPTRPPVSNIPPAPVERPQLGVTSNNAPVNGFSGPLLTDKYFDYPVVTTKRALMEGLKHHIARFASKKNVDPRDESQFTRPVRLHRRDPRRGQDAHASRFEDPDAPPMDEAEREAFDARRAAREKERAENMAQIAPALGTTSKRPNAPKQKTQQVFKSDMTPEEVAKMRIKYEEALQWHLEDFDNKHTWVGNYEAALSGTHAVFVLDGGKMRMIPAEKWYKFSAKSNFKALTIEEAEKFMAKKVKDPRWFMEKQQELEQKKELDIYAKQRKVYAGKQGIPTSGGAGLEAGEMDFEEDRFADDEEHDDGLFNDDEDAKEAEKRIKEDQLKANVFDLKDEKDYEAEEKRELREREARHVLGKSVRKALKRREKNFDYSSGSENNPYSDDESSDDTETEKAKEEERKKAEAEKEKESSSKGTNTPSGRPKHTDPLKKSAAGRKRLGSPTSDASGTDTSRKKPKKTNPTSQPPSRPMSPSAIQTGTKRVRIPGSGANSGSDVEAGAASSNETNENNKKKLKLNPPNATSRSGTPAGSRAGSPMAGRQPGSRASSPEGPMRGGRVSTPLSASGSGSFPTPAEIHAAIPASGISSGDLLKLFRPRIGDNHRKFIAIVKDVSVYGKEDRMLRPGPWKGN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.42
3	0.35
4	0.4
5	0.41
6	0.41
7	0.39
8	0.42
9	0.45
10	0.53
11	0.58
12	0.59
13	0.64
14	0.7
15	0.77
16	0.77
17	0.76
18	0.76
19	0.81
20	0.82
21	0.82
22	0.77
23	0.77
24	0.77
25	0.79
26	0.78
27	0.77
28	0.77
29	0.77
30	0.83
31	0.82
32	0.81
33	0.74
34	0.67
35	0.59
36	0.57
37	0.49
38	0.4
39	0.34
40	0.3
41	0.32
42	0.36
43	0.39
44	0.37
45	0.43
46	0.47
47	0.51
48	0.48
49	0.48
50	0.5
51	0.52
52	0.54
53	0.49
54	0.49
55	0.47
56	0.47
57	0.45
58	0.42
59	0.4
60	0.32
61	0.33
62	0.31
63	0.29
64	0.28
65	0.26
66	0.24
67	0.26
68	0.29
69	0.27
70	0.26
71	0.24
72	0.22
73	0.23
74	0.19
75	0.14
76	0.1
77	0.09
78	0.1
79	0.11
80	0.14
81	0.12
82	0.13
83	0.13
84	0.17
85	0.17
86	0.17
87	0.18
88	0.16
89	0.22
90	0.27
91	0.27
92	0.25
93	0.27
94	0.29
95	0.28
96	0.28
97	0.24
98	0.25
99	0.29
100	0.35
101	0.36
102	0.34
103	0.34
104	0.37
105	0.35
106	0.35
107	0.37
108	0.38
109	0.42
110	0.45
111	0.52
112	0.58
113	0.65
114	0.61
115	0.6
116	0.57
117	0.58
118	0.58
119	0.54
120	0.49
121	0.49
122	0.46
123	0.47
124	0.45
125	0.45
126	0.52
127	0.57
128	0.62
129	0.65
130	0.75
131	0.78
132	0.85
133	0.84
134	0.82
135	0.77
136	0.71
137	0.71
138	0.69
139	0.64
140	0.6
141	0.53
142	0.45
143	0.44
144	0.41
145	0.33
146	0.26
147	0.26
148	0.24
149	0.22
150	0.21
151	0.2
152	0.2
153	0.17
154	0.18
155	0.14
156	0.12
157	0.12
158	0.14
159	0.13
160	0.14
161	0.18
162	0.17
163	0.22
164	0.25
165	0.28
166	0.35
167	0.43
168	0.45
169	0.49
170	0.53
171	0.48
172	0.47
173	0.46
174	0.4
175	0.34
176	0.3
177	0.22
178	0.17
179	0.14
180	0.12
181	0.08
182	0.07
183	0.06
184	0.1
185	0.17
186	0.2
187	0.24
188	0.3
189	0.39
190	0.5
191	0.57
192	0.64
193	0.66
194	0.73
195	0.75
196	0.76
197	0.74
198	0.68
199	0.65
200	0.57
201	0.54
202	0.45
203	0.4
204	0.38
205	0.31
206	0.25
207	0.23
208	0.24
209	0.2
210	0.22
211	0.22
212	0.18
213	0.19
214	0.2
215	0.17
216	0.19
217	0.22
218	0.21
219	0.24
220	0.23
221	0.22
222	0.21
223	0.21
224	0.18
225	0.15
226	0.14
227	0.17
228	0.18
229	0.18
230	0.18
231	0.18
232	0.18
233	0.18
234	0.19
235	0.14
236	0.12
237	0.12
238	0.12
239	0.12
240	0.11
241	0.1
242	0.08
243	0.07
244	0.07
245	0.06
246	0.05
247	0.05
248	0.05
249	0.06
250	0.04
251	0.05
252	0.05
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.08
257	0.08
258	0.09
259	0.15
260	0.25
261	0.25
262	0.29
263	0.31
264	0.32
265	0.33
266	0.39
267	0.42
268	0.41
269	0.43
270	0.47
271	0.46
272	0.42
273	0.42
274	0.35
275	0.3
276	0.24
277	0.23
278	0.17
279	0.17
280	0.16
281	0.16
282	0.16
283	0.14
284	0.16
285	0.14
286	0.2
287	0.29
288	0.38
289	0.44
290	0.49
291	0.5
292	0.54
293	0.56
294	0.52
295	0.53
296	0.48
297	0.43
298	0.46
299	0.5
300	0.43
301	0.44
302	0.44
303	0.35
304	0.31
305	0.3
306	0.22
307	0.18
308	0.19
309	0.26
310	0.32
311	0.34
312	0.34
313	0.34
314	0.36
315	0.38
316	0.37
317	0.38
318	0.35
319	0.36
320	0.39
321	0.39
322	0.37
323	0.33
324	0.29
325	0.2
326	0.15
327	0.11
328	0.07
329	0.06
330	0.06
331	0.05
332	0.04
333	0.03
334	0.02
335	0.02
336	0.03
337	0.03
338	0.03
339	0.03
340	0.03
341	0.04
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.07
347	0.08
348	0.09
349	0.08
350	0.08
351	0.07
352	0.09
353	0.09
354	0.07
355	0.06
356	0.06
357	0.06
358	0.08
359	0.09
360	0.07
361	0.08
362	0.1
363	0.13
364	0.15
365	0.17
366	0.19
367	0.26
368	0.29
369	0.35
370	0.41
371	0.45
372	0.45
373	0.43
374	0.42
375	0.38
376	0.33
377	0.29
378	0.24
379	0.17
380	0.17
381	0.17
382	0.16
383	0.13
384	0.15
385	0.16
386	0.19
387	0.18
388	0.19
389	0.2
390	0.22
391	0.29
392	0.29
393	0.3
394	0.33
395	0.34
396	0.4
397	0.44
398	0.43
399	0.39
400	0.39
401	0.37
402	0.36
403	0.39
404	0.34
405	0.36
406	0.39
407	0.42
408	0.48
409	0.56
410	0.6
411	0.65
412	0.69
413	0.71
414	0.72
415	0.74
416	0.7
417	0.66
418	0.6
419	0.52
420	0.48
421	0.41
422	0.37
423	0.31
424	0.28
425	0.23
426	0.18
427	0.17
428	0.16
429	0.13
430	0.13
431	0.12
432	0.15
433	0.16
434	0.15
435	0.14
436	0.13
437	0.14
438	0.15
439	0.14
440	0.14
441	0.13
442	0.17
443	0.26
444	0.3
445	0.38
446	0.42
447	0.45
448	0.44
449	0.5
450	0.54
451	0.55
452	0.55
453	0.52
454	0.5
455	0.48
456	0.48
457	0.42
458	0.38
459	0.31
460	0.32
461	0.27
462	0.28
463	0.33
464	0.34
465	0.4
466	0.44
467	0.46
468	0.45
469	0.48
470	0.49
471	0.53
472	0.59
473	0.61
474	0.59
475	0.62
476	0.62
477	0.61
478	0.62
479	0.61
480	0.6
481	0.58
482	0.57
483	0.53
484	0.56
485	0.58
486	0.54
487	0.48
488	0.43
489	0.39
490	0.37
491	0.33
492	0.25
493	0.23
494	0.24
495	0.22
496	0.26
497	0.25
498	0.28
499	0.38
500	0.45
501	0.48
502	0.56
503	0.65
504	0.69
505	0.76
506	0.82
507	0.83
508	0.87
509	0.89
510	0.88
511	0.86
512	0.8
513	0.75
514	0.69
515	0.61
516	0.53
517	0.51
518	0.44
519	0.38
520	0.38
521	0.35
522	0.33
523	0.32
524	0.38
525	0.37
526	0.38
527	0.37
528	0.35
529	0.36
530	0.35
531	0.38
532	0.36
533	0.37
534	0.37
535	0.36
536	0.33
537	0.3
538	0.28
539	0.24
540	0.17
541	0.1
542	0.07
543	0.06
544	0.05
545	0.05
546	0.05
547	0.05
548	0.06
549	0.07
550	0.08
551	0.1
552	0.16
553	0.25
554	0.32
555	0.37
556	0.42
557	0.46
558	0.51
559	0.6
560	0.65
561	0.67
562	0.71
563	0.75
564	0.75
565	0.8
566	0.76
567	0.7
568	0.61
569	0.53
570	0.48
571	0.41
572	0.36
573	0.28
574	0.29
575	0.28
576	0.26
577	0.24
578	0.19
579	0.19
580	0.19
581	0.18
582	0.2
583	0.23
584	0.24
585	0.25
586	0.25
587	0.27
588	0.32
589	0.37
590	0.34
591	0.32
592	0.35
593	0.4
594	0.42
595	0.44
596	0.4
597	0.36
598	0.35
599	0.35
600	0.31
601	0.25
602	0.23
603	0.23
604	0.23
605	0.23
606	0.24
607	0.22
608	0.22
609	0.22
610	0.22
611	0.19
612	0.17
613	0.16
614	0.15
615	0.14
616	0.12
617	0.14
618	0.13
619	0.11
620	0.15
621	0.15
622	0.15
623	0.17
624	0.18
625	0.15
626	0.14
627	0.14
628	0.1
629	0.1
630	0.09
631	0.07
632	0.07
633	0.08
634	0.09
635	0.1
636	0.1
637	0.14
638	0.21
639	0.22
640	0.23
641	0.27
642	0.28
643	0.38
644	0.47
645	0.55
646	0.54
647	0.62
648	0.61
649	0.58
650	0.55
651	0.53
652	0.51
653	0.45
654	0.4
655	0.33
656	0.34
657	0.33
658	0.35
659	0.29
660	0.23
661	0.21
662	0.22
663	0.23
664	0.26
665	0.28
666	0.33
667	0.35
668	0.35
669	0.41

A0A1F5LPW7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer