Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E5REG0

Protein Details
Accession A0A1E5REG0    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-51LNSDKDYKKDKSHGSKQKKISKDGNDHydrophilic
62-86IDTSLFKKNKLKPHNKGTGLKQRRIHydrophilic
429-456DLDPKKAFRQFNKNYYKAKKKPRSAKPKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
195-202AKKNKKVK
234-246KIKKRKAKMLSQK
459-470KAKKKPRSAKPK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
Amino Acid Sequences MSILAISVEETNRIRQYFGLKLLPLLNSDKDYKKDKSHGSKQKKISXKDGNDLLGNYDASNFIDTSLFKKNKLKPHNKGTGLKQRRIDEDDXNDVAXSSDWLGKLAEKETQIPXIDEXKSVKSNTAKIKSSLANNIIMTLKEQDILGXQNDSSNPKNVLTVEKEFETKNFADVSQSSKFRKRKIDSKQNEELQAAKKNKKVKIEGKVRVSFGSLDXSADSNGYEHEPSDYMPAKIKKRKAKMLSQKPKSSLPHFEIKKVDLIDDDDPEEENGALDEIISSSRIQNVSTPYKVXRKDSTXNVHLRNDNPDKVQYEDHSEFFNLLKAPXLETGNLGHSHADVETEKLTDXATDEKIATNNKTVEKSISEEPNFYDGMASTLQFLSNSVSTASNSNXEGPVASIPLPANSTXSSLSKTNVDVXTTKEKKPLFSINLKYTDDVTGEDLDPKKAFRQFNKNYYKAKKKPRSAKPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.26
3 0.31
4 0.33
5 0.37
6 0.37
7 0.33
8 0.36
9 0.38
10 0.36
11 0.34
12 0.32
13 0.28
14 0.27
15 0.32
16 0.34
17 0.36
18 0.42
19 0.45
20 0.49
21 0.55
22 0.61
23 0.66
24 0.72
25 0.78
26 0.82
27 0.85
28 0.87
29 0.88
30 0.85
31 0.83
32 0.81
33 0.8
34 0.79
35 0.74
36 0.72
37 0.64
38 0.58
39 0.52
40 0.45
41 0.36
42 0.26
43 0.21
44 0.14
45 0.13
46 0.14
47 0.11
48 0.09
49 0.11
50 0.11
51 0.15
52 0.24
53 0.25
54 0.28
55 0.37
56 0.43
57 0.52
58 0.62
59 0.7
60 0.69
61 0.78
62 0.84
63 0.83
64 0.83
65 0.83
66 0.83
67 0.8
68 0.77
69 0.74
70 0.68
71 0.66
72 0.66
73 0.6
74 0.52
75 0.51
76 0.48
77 0.42
78 0.38
79 0.32
80 0.25
81 0.21
82 0.18
83 0.11
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.08
88 0.1
89 0.11
90 0.15
91 0.15
92 0.17
93 0.19
94 0.21
95 0.21
96 0.21
97 0.2
98 0.23
99 0.26
100 0.24
101 0.28
102 0.28
103 0.3
104 0.31
105 0.36
106 0.38
107 0.41
108 0.43
109 0.39
110 0.42
111 0.42
112 0.44
113 0.44
114 0.38
115 0.35
116 0.32
117 0.32
118 0.27
119 0.23
120 0.21
121 0.16
122 0.14
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.14
127 0.17
128 0.17
129 0.15
130 0.15
131 0.19
132 0.22
133 0.22
134 0.2
135 0.19
136 0.17
137 0.18
138 0.19
139 0.2
140 0.21
141 0.23
142 0.23
143 0.23
144 0.24
145 0.23
146 0.22
147 0.23
148 0.18
149 0.17
150 0.15
151 0.14
152 0.14
153 0.15
154 0.2
155 0.2
156 0.24
157 0.26
158 0.34
159 0.39
160 0.43
161 0.52
162 0.54
163 0.58
164 0.65
165 0.72
166 0.72
167 0.75
168 0.78
169 0.71
170 0.67
171 0.58
172 0.51
173 0.44
174 0.44
175 0.42
176 0.38
177 0.38
178 0.43
179 0.46
180 0.49
181 0.54
182 0.53
183 0.58
184 0.64
185 0.67
186 0.67
187 0.67
188 0.61
189 0.53
190 0.46
191 0.36
192 0.26
193 0.22
194 0.14
195 0.12
196 0.11
197 0.11
198 0.1
199 0.09
200 0.08
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.1
209 0.11
210 0.11
211 0.17
212 0.22
213 0.29
214 0.35
215 0.42
216 0.46
217 0.52
218 0.61
219 0.61
220 0.66
221 0.7
222 0.75
223 0.78
224 0.78
225 0.76
226 0.69
227 0.69
228 0.63
229 0.56
230 0.51
231 0.44
232 0.45
233 0.42
234 0.43
235 0.39
236 0.36
237 0.35
238 0.29
239 0.25
240 0.17
241 0.19
242 0.16
243 0.14
244 0.14
245 0.11
246 0.11
247 0.11
248 0.1
249 0.07
250 0.06
251 0.05
252 0.04
253 0.04
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.04
259 0.05
260 0.05
261 0.08
262 0.09
263 0.09
264 0.11
265 0.17
266 0.21
267 0.24
268 0.28
269 0.29
270 0.35
271 0.38
272 0.37
273 0.36
274 0.38
275 0.42
276 0.47
277 0.54
278 0.5
279 0.5
280 0.52
281 0.48
282 0.51
283 0.5
284 0.43
285 0.35
286 0.36
287 0.35
288 0.33
289 0.34
290 0.26
291 0.28
292 0.28
293 0.27
294 0.25
295 0.23
296 0.21
297 0.19
298 0.2
299 0.13
300 0.11
301 0.11
302 0.1
303 0.11
304 0.11
305 0.12
306 0.1
307 0.1
308 0.12
309 0.11
310 0.12
311 0.1
312 0.1
313 0.09
314 0.09
315 0.1
316 0.09
317 0.1
318 0.1
319 0.1
320 0.1
321 0.09
322 0.1
323 0.08
324 0.09
325 0.09
326 0.11
327 0.11
328 0.11
329 0.17
330 0.2
331 0.21
332 0.25
333 0.27
334 0.28
335 0.3
336 0.31
337 0.28
338 0.27
339 0.3
340 0.31
341 0.35
342 0.32
343 0.31
344 0.32
345 0.32
346 0.3
347 0.25
348 0.2
349 0.12
350 0.13
351 0.12
352 0.1
353 0.09
354 0.1
355 0.1
356 0.09
357 0.1
358 0.11
359 0.11
360 0.11
361 0.11
362 0.11
363 0.12
364 0.15
365 0.16
366 0.15
367 0.15
368 0.15
369 0.15
370 0.14
371 0.15
372 0.13
373 0.14
374 0.12
375 0.15
376 0.15
377 0.15
378 0.16
379 0.15
380 0.17
381 0.14
382 0.17
383 0.16
384 0.18
385 0.21
386 0.21
387 0.23
388 0.23
389 0.27
390 0.28
391 0.28
392 0.28
393 0.3
394 0.39
395 0.4
396 0.46
397 0.43
398 0.42
399 0.44
400 0.52
401 0.53
402 0.52
403 0.58
404 0.58
405 0.62
406 0.61
407 0.58
408 0.5
409 0.44
410 0.36
411 0.29
412 0.23
413 0.19
414 0.19
415 0.24
416 0.23
417 0.25
418 0.25
419 0.25
420 0.29
421 0.34
422 0.41
423 0.44
424 0.53
425 0.6
426 0.69
427 0.78
428 0.8
429 0.83
430 0.85
431 0.87
432 0.86
433 0.88
434 0.88
435 0.88
436 0.91