Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2ATV3

Protein Details
Accession H2ATV3    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
273-298EGDFKPIKLKKRKTRNDPGSNRRKKLBasic
552-582AYKKLSQKFHGTRSNKKKLAKFQAKVQARNRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
278-297PIKLKKRKTRNDPGSNRRKK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG kaf:KAFR_0D01570  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MAEPIGNLQDCSSSYGNTGFKRGPSQENEQDKHFSNGEDLSVGETNKIRLSLGLKPIPLGDKIIKQEKKENDFIDVSKLDRLKRKLGNLKSSFNLISDNPDSSLKDDDDFQKNWLQDIGTKKKAHVQLRYDETKNEDDDLTEVQLSNSIGTILPGKEMVLTLKDSSIFETEDEGAPIDVLENENVMHEQRAAKHLELRKMNQQRKRNKMVLNVSSKMIAQEEEKEENVRHKSGSVIAVGAEVKPKEVSEEQESTSLDGKIKVIFDESDASAEEGDFKPIKLKKRKTRNDPGSNRRKKLILPDRMVKVDLQEDDTSTTYIDDFEENIIKPKKKLVERKSADELAIEIRKESLENEQRKREISRLHNISSQLILDERADFFNSLSSNVLEGTQVAPETFADHIGKNTTGHAFATVELPDNLNNKRVDNDIVDHSKSSSVNFYGGIASTLQFLQGQSIFPESRSSQTNTEIADDFLAHKHNIAAKETRKRMLEKGLSNVRNKYSKNESKTSQDREEQKMQQSLNEVQDELLEDYNPKINLVYKDNRGNELTTKEAYKKLSQKFHGTRSNKKKLAKFQAKVQARNRIQSLQYVFNPEEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.23
3 0.29
4 0.28
5 0.32
6 0.3
7 0.32
8 0.39
9 0.42
10 0.44
11 0.45
12 0.52
13 0.57
14 0.64
15 0.64
16 0.6
17 0.6
18 0.55
19 0.53
20 0.45
21 0.36
22 0.29
23 0.28
24 0.24
25 0.2
26 0.18
27 0.17
28 0.18
29 0.17
30 0.17
31 0.17
32 0.18
33 0.19
34 0.19
35 0.15
36 0.16
37 0.2
38 0.24
39 0.32
40 0.34
41 0.33
42 0.33
43 0.35
44 0.35
45 0.32
46 0.3
47 0.25
48 0.27
49 0.34
50 0.43
51 0.45
52 0.47
53 0.54
54 0.59
55 0.62
56 0.63
57 0.58
58 0.53
59 0.52
60 0.49
61 0.47
62 0.39
63 0.33
64 0.31
65 0.34
66 0.33
67 0.38
68 0.42
69 0.44
70 0.5
71 0.58
72 0.62
73 0.68
74 0.73
75 0.71
76 0.71
77 0.64
78 0.62
79 0.53
80 0.43
81 0.37
82 0.27
83 0.28
84 0.25
85 0.24
86 0.21
87 0.22
88 0.23
89 0.21
90 0.25
91 0.19
92 0.18
93 0.2
94 0.25
95 0.29
96 0.29
97 0.3
98 0.31
99 0.3
100 0.3
101 0.28
102 0.22
103 0.21
104 0.3
105 0.36
106 0.39
107 0.4
108 0.4
109 0.46
110 0.54
111 0.57
112 0.55
113 0.53
114 0.53
115 0.61
116 0.66
117 0.6
118 0.54
119 0.51
120 0.46
121 0.41
122 0.35
123 0.27
124 0.2
125 0.2
126 0.19
127 0.16
128 0.13
129 0.12
130 0.09
131 0.12
132 0.11
133 0.1
134 0.08
135 0.08
136 0.07
137 0.07
138 0.1
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.09
145 0.09
146 0.08
147 0.1
148 0.1
149 0.11
150 0.12
151 0.12
152 0.13
153 0.14
154 0.13
155 0.11
156 0.13
157 0.14
158 0.13
159 0.13
160 0.11
161 0.1
162 0.09
163 0.08
164 0.06
165 0.05
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.1
176 0.11
177 0.15
178 0.17
179 0.18
180 0.24
181 0.29
182 0.35
183 0.38
184 0.39
185 0.46
186 0.54
187 0.61
188 0.62
189 0.66
190 0.69
191 0.73
192 0.78
193 0.76
194 0.7
195 0.71
196 0.71
197 0.71
198 0.67
199 0.6
200 0.52
201 0.45
202 0.4
203 0.32
204 0.23
205 0.16
206 0.1
207 0.13
208 0.16
209 0.17
210 0.18
211 0.18
212 0.19
213 0.24
214 0.26
215 0.22
216 0.19
217 0.17
218 0.18
219 0.19
220 0.2
221 0.14
222 0.12
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.11
233 0.12
234 0.15
235 0.17
236 0.2
237 0.2
238 0.22
239 0.22
240 0.21
241 0.21
242 0.19
243 0.14
244 0.12
245 0.12
246 0.11
247 0.12
248 0.1
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.11
253 0.1
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.08
258 0.08
259 0.09
260 0.07
261 0.1
262 0.09
263 0.09
264 0.15
265 0.19
266 0.28
267 0.36
268 0.45
269 0.52
270 0.64
271 0.73
272 0.77
273 0.85
274 0.86
275 0.88
276 0.88
277 0.89
278 0.89
279 0.88
280 0.8
281 0.71
282 0.61
283 0.52
284 0.53
285 0.52
286 0.5
287 0.46
288 0.5
289 0.5
290 0.5
291 0.49
292 0.38
293 0.29
294 0.23
295 0.18
296 0.15
297 0.13
298 0.12
299 0.13
300 0.14
301 0.12
302 0.1
303 0.09
304 0.06
305 0.07
306 0.07
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.08
311 0.08
312 0.14
313 0.19
314 0.19
315 0.2
316 0.24
317 0.3
318 0.36
319 0.46
320 0.48
321 0.54
322 0.57
323 0.63
324 0.64
325 0.58
326 0.5
327 0.4
328 0.33
329 0.26
330 0.24
331 0.18
332 0.12
333 0.11
334 0.11
335 0.11
336 0.12
337 0.16
338 0.23
339 0.31
340 0.36
341 0.41
342 0.43
343 0.45
344 0.46
345 0.41
346 0.41
347 0.4
348 0.44
349 0.45
350 0.46
351 0.47
352 0.46
353 0.42
354 0.34
355 0.28
356 0.18
357 0.13
358 0.12
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.1
367 0.1
368 0.1
369 0.1
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.05
382 0.07
383 0.07
384 0.08
385 0.09
386 0.1
387 0.11
388 0.12
389 0.13
390 0.12
391 0.14
392 0.13
393 0.12
394 0.12
395 0.12
396 0.11
397 0.1
398 0.12
399 0.1
400 0.11
401 0.11
402 0.11
403 0.12
404 0.16
405 0.16
406 0.2
407 0.2
408 0.19
409 0.21
410 0.22
411 0.22
412 0.21
413 0.23
414 0.24
415 0.27
416 0.27
417 0.26
418 0.25
419 0.25
420 0.23
421 0.21
422 0.18
423 0.15
424 0.15
425 0.14
426 0.14
427 0.12
428 0.12
429 0.12
430 0.09
431 0.08
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.08
436 0.08
437 0.09
438 0.1
439 0.1
440 0.1
441 0.14
442 0.14
443 0.14
444 0.18
445 0.17
446 0.19
447 0.22
448 0.25
449 0.24
450 0.27
451 0.29
452 0.26
453 0.27
454 0.25
455 0.21
456 0.18
457 0.16
458 0.14
459 0.14
460 0.15
461 0.12
462 0.12
463 0.15
464 0.18
465 0.2
466 0.23
467 0.29
468 0.35
469 0.45
470 0.5
471 0.52
472 0.52
473 0.54
474 0.55
475 0.57
476 0.57
477 0.51
478 0.56
479 0.6
480 0.62
481 0.63
482 0.63
483 0.58
484 0.57
485 0.54
486 0.52
487 0.53
488 0.56
489 0.59
490 0.61
491 0.59
492 0.62
493 0.69
494 0.7
495 0.66
496 0.65
497 0.65
498 0.65
499 0.7
500 0.67
501 0.64
502 0.63
503 0.56
504 0.51
505 0.49
506 0.47
507 0.43
508 0.38
509 0.31
510 0.25
511 0.26
512 0.25
513 0.22
514 0.17
515 0.12
516 0.12
517 0.13
518 0.18
519 0.17
520 0.15
521 0.15
522 0.2
523 0.24
524 0.31
525 0.37
526 0.4
527 0.49
528 0.51
529 0.54
530 0.5
531 0.48
532 0.45
533 0.42
534 0.39
535 0.33
536 0.35
537 0.34
538 0.37
539 0.39
540 0.43
541 0.47
542 0.52
543 0.59
544 0.61
545 0.68
546 0.71
547 0.76
548 0.78
549 0.76
550 0.78
551 0.79
552 0.85
553 0.81
554 0.81
555 0.81
556 0.81
557 0.86
558 0.85
559 0.79
560 0.78
561 0.81
562 0.82
563 0.82
564 0.79
565 0.79
566 0.73
567 0.75
568 0.7
569 0.66
570 0.59
571 0.57
572 0.55
573 0.51
574 0.49
575 0.49