Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E5RW20

Protein Details
Accession A0A1E5RW20    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
142-163ASSPAPQKPQQQQQQQQQQQQQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047192  Euk_RPA1_DBD_C  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR004365  NA-bd_OB_tRNA  
IPR013955  Rep_factor-A_C  
IPR031657  REPA_OB_2  
IPR004591  Rfa1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0044271  P:cellular nitrogen compound biosynthetic process  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0009059  P:macromolecule biosynthetic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF08646  Rep_fac-A_C  
PF16900  REPA_OB_2  
PF01336  tRNA_anti-codon  
CDD cd04474  RPA1_DBD_A  
cd04475  RPA1_DBD_B  
cd04476  RPA1_DBD_C  
Amino Acid Sequences MAEISNKGLYQIFTDNDKFNNPVNFNFQIFNIKKTGDPSKPSILIMIHDGTYHTKALLREKSLENFSQKNLQVGDIIRVIEGEAALLTAKKKCVLLIDDYSVVSTNGPAINMEKSQMLESYLYQNPHLSNVAQLRELAGSAASSPAPQKPQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQPVMNTSTPKSSFNQVKPSSMEQKPIFAIEQISPYQNMWTIKARVSFKSDMKKWSNQKGEGKLFNVNFLDETGEIRATSFNDNAEKYYEMLQEGKIYYVSKARVQPSKPAFSNLKHPYELQLDRDSIVELCTDNTDNVPNVKFDIVKLNDLDNVDKTSTIDVMGIIQTVEPAFKLQTKSGKTYDRRDVVIGDDTGVSISLGLWNKPALEFSLPEGSVLVAKGCKVTDFNGKSLSMIPGGHLISNPEIPEAYELKGWYDNYGKETKFLNLKRESGLATGGGNYFGNISERKTIQQAKDENLGRSERGDFFNIKGNITFIRAENFAYPACSSPDCQKKVIEQPDGTWRCEKCQINHPQPNYRYTLSISVFDETDQIWLTLFDDQANQLLGISANELNEMKNSGQELSHFFNKFQMKEYNFRVRAREDNYNNESRIRYSCSNLGKVDFNAEVEHLSDLLLSSFN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.31
3 0.31
4 0.33
5 0.33
6 0.33
7 0.39
8 0.36
9 0.36
10 0.4
11 0.41
12 0.4
13 0.39
14 0.35
15 0.37
16 0.36
17 0.36
18 0.32
19 0.29
20 0.29
21 0.34
22 0.42
23 0.38
24 0.42
25 0.45
26 0.5
27 0.51
28 0.49
29 0.47
30 0.38
31 0.33
32 0.31
33 0.27
34 0.19
35 0.18
36 0.19
37 0.19
38 0.21
39 0.19
40 0.16
41 0.18
42 0.21
43 0.3
44 0.35
45 0.35
46 0.39
47 0.43
48 0.48
49 0.5
50 0.52
51 0.49
52 0.45
53 0.44
54 0.47
55 0.43
56 0.42
57 0.37
58 0.32
59 0.3
60 0.28
61 0.29
62 0.22
63 0.22
64 0.17
65 0.16
66 0.16
67 0.12
68 0.11
69 0.07
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.07
74 0.09
75 0.11
76 0.12
77 0.15
78 0.15
79 0.16
80 0.21
81 0.23
82 0.28
83 0.3
84 0.32
85 0.31
86 0.31
87 0.3
88 0.25
89 0.22
90 0.16
91 0.11
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.1
96 0.11
97 0.13
98 0.14
99 0.15
100 0.13
101 0.13
102 0.14
103 0.14
104 0.14
105 0.12
106 0.13
107 0.18
108 0.21
109 0.21
110 0.21
111 0.23
112 0.21
113 0.23
114 0.23
115 0.17
116 0.19
117 0.23
118 0.24
119 0.22
120 0.21
121 0.2
122 0.19
123 0.18
124 0.13
125 0.08
126 0.06
127 0.06
128 0.07
129 0.06
130 0.07
131 0.09
132 0.12
133 0.17
134 0.2
135 0.28
136 0.35
137 0.45
138 0.54
139 0.62
140 0.68
141 0.74
142 0.81
143 0.81
144 0.8
145 0.78
146 0.77
147 0.75
148 0.73
149 0.71
150 0.68
151 0.68
152 0.69
153 0.67
154 0.64
155 0.61
156 0.56
157 0.49
158 0.44
159 0.39
160 0.32
161 0.28
162 0.25
163 0.26
164 0.25
165 0.26
166 0.25
167 0.3
168 0.36
169 0.39
170 0.48
171 0.44
172 0.45
173 0.46
174 0.5
175 0.51
176 0.44
177 0.47
178 0.38
179 0.39
180 0.36
181 0.34
182 0.28
183 0.2
184 0.21
185 0.14
186 0.17
187 0.15
188 0.15
189 0.15
190 0.14
191 0.14
192 0.16
193 0.16
194 0.15
195 0.19
196 0.2
197 0.22
198 0.28
199 0.3
200 0.29
201 0.34
202 0.36
203 0.37
204 0.44
205 0.45
206 0.48
207 0.51
208 0.57
209 0.58
210 0.63
211 0.64
212 0.62
213 0.66
214 0.65
215 0.66
216 0.61
217 0.56
218 0.52
219 0.45
220 0.41
221 0.34
222 0.26
223 0.2
224 0.17
225 0.16
226 0.1
227 0.11
228 0.08
229 0.08
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.1
235 0.1
236 0.11
237 0.13
238 0.14
239 0.14
240 0.15
241 0.14
242 0.13
243 0.16
244 0.15
245 0.13
246 0.14
247 0.13
248 0.14
249 0.13
250 0.13
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.13
255 0.15
256 0.17
257 0.22
258 0.26
259 0.31
260 0.32
261 0.4
262 0.41
263 0.46
264 0.42
265 0.42
266 0.41
267 0.36
268 0.45
269 0.43
270 0.41
271 0.35
272 0.35
273 0.33
274 0.36
275 0.36
276 0.29
277 0.25
278 0.22
279 0.22
280 0.21
281 0.19
282 0.13
283 0.11
284 0.09
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.07
289 0.06
290 0.07
291 0.08
292 0.08
293 0.09
294 0.1
295 0.09
296 0.09
297 0.1
298 0.09
299 0.09
300 0.16
301 0.15
302 0.16
303 0.17
304 0.17
305 0.18
306 0.18
307 0.19
308 0.12
309 0.12
310 0.11
311 0.1
312 0.1
313 0.08
314 0.08
315 0.07
316 0.06
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.03
327 0.04
328 0.05
329 0.08
330 0.09
331 0.12
332 0.18
333 0.21
334 0.25
335 0.29
336 0.37
337 0.39
338 0.45
339 0.5
340 0.46
341 0.45
342 0.41
343 0.38
344 0.31
345 0.29
346 0.22
347 0.15
348 0.12
349 0.11
350 0.1
351 0.09
352 0.06
353 0.04
354 0.04
355 0.07
356 0.07
357 0.08
358 0.08
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.1
363 0.07
364 0.08
365 0.08
366 0.1
367 0.15
368 0.14
369 0.14
370 0.14
371 0.13
372 0.12
373 0.11
374 0.1
375 0.05
376 0.06
377 0.07
378 0.06
379 0.07
380 0.07
381 0.1
382 0.19
383 0.21
384 0.23
385 0.25
386 0.25
387 0.25
388 0.25
389 0.24
390 0.15
391 0.13
392 0.12
393 0.12
394 0.12
395 0.12
396 0.11
397 0.11
398 0.11
399 0.12
400 0.12
401 0.09
402 0.09
403 0.09
404 0.11
405 0.11
406 0.11
407 0.11
408 0.11
409 0.12
410 0.15
411 0.15
412 0.15
413 0.17
414 0.17
415 0.2
416 0.25
417 0.24
418 0.23
419 0.25
420 0.26
421 0.31
422 0.33
423 0.38
424 0.36
425 0.38
426 0.38
427 0.38
428 0.35
429 0.27
430 0.25
431 0.17
432 0.13
433 0.12
434 0.11
435 0.1
436 0.09
437 0.08
438 0.07
439 0.07
440 0.09
441 0.09
442 0.11
443 0.14
444 0.15
445 0.17
446 0.23
447 0.3
448 0.31
449 0.38
450 0.4
451 0.39
452 0.47
453 0.49
454 0.43
455 0.4
456 0.39
457 0.31
458 0.29
459 0.29
460 0.23
461 0.23
462 0.24
463 0.22
464 0.22
465 0.3
466 0.29
467 0.27
468 0.24
469 0.23
470 0.2
471 0.22
472 0.22
473 0.14
474 0.16
475 0.15
476 0.16
477 0.16
478 0.17
479 0.14
480 0.15
481 0.15
482 0.13
483 0.16
484 0.15
485 0.16
486 0.23
487 0.33
488 0.34
489 0.35
490 0.36
491 0.4
492 0.49
493 0.55
494 0.54
495 0.45
496 0.45
497 0.54
498 0.55
499 0.51
500 0.48
501 0.41
502 0.38
503 0.45
504 0.47
505 0.41
506 0.48
507 0.56
508 0.61
509 0.68
510 0.7
511 0.71
512 0.7
513 0.69
514 0.64
515 0.55
516 0.46
517 0.41
518 0.42
519 0.34
520 0.34
521 0.31
522 0.27
523 0.26
524 0.24
525 0.22
526 0.15
527 0.15
528 0.12
529 0.1
530 0.09
531 0.09
532 0.09
533 0.11
534 0.11
535 0.1
536 0.1
537 0.11
538 0.12
539 0.13
540 0.12
541 0.09
542 0.1
543 0.09
544 0.08
545 0.1
546 0.1
547 0.09
548 0.11
549 0.11
550 0.11
551 0.12
552 0.15
553 0.12
554 0.14
555 0.15
556 0.14
557 0.15
558 0.17
559 0.21
560 0.24
561 0.32
562 0.3
563 0.29
564 0.36
565 0.41
566 0.4
567 0.4
568 0.43
569 0.4
570 0.47
571 0.55
572 0.58
573 0.58
574 0.61
575 0.6
576 0.56
577 0.6
578 0.59
579 0.61
580 0.56
581 0.59
582 0.63
583 0.64
584 0.61
585 0.57
586 0.52
587 0.45
588 0.44
589 0.41
590 0.38
591 0.37
592 0.43
593 0.46
594 0.5
595 0.49
596 0.48
597 0.44
598 0.42
599 0.41
600 0.34
601 0.28
602 0.24
603 0.22
604 0.19
605 0.16
606 0.16
607 0.11
608 0.1
609 0.09
610 0.08