Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E5R3B8

Protein Details
Accession A0A1E5R3B8    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-58LLPLVSSKEKRKQQKEAAASKSTHydrophilic
392-418DKQSIAGKSKSRKQRRKKGAMSDTSGFHydrophilic
504-529DSVSKGKLSMRRRREQEKQEQSKSTGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
400-412GKSKSRKQRRKKG
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MSSKRFDKANAQKFSIVHRPHDDPRYYDSEASEHILLPLVSSKEKRKQQKEAAASKSTTTNTGKTASAPLRSNNPYVKLKKPVVKTETQPVNKGVINAHAGEAALYGIQFDDSKYDYTQHLKPIGLDPENSVFIAKSKSAGSSSKTQNAPKPSKKDIADMFTEDRYKETEKIQSEPVFKFGMAKPEYLEHQVDIAEDLKGFKPDMDPALREILEALEDDAYVINEDVVVDQKKLEKIEVSVDKADGXLANIKEGEEEEEEXDDDDEQNENETHEVGYYEPAEDFEDGDDDIFAELLGSGEAGENEAHEVDEWDIDNYEDDFGNSAQGDGSSAAIDLSQFDDDLSKFNEVGWGSDMSNFKKTQEKNGDFDNESNNDFDSEFAEDQDQLGDMPSFDKQSIAGKSKSRKQRRKKGAMSDTSGFSMSSSAIARTEVMTVLDDKFDQVIDGYQNYEEEQEDSDYEEFDMSKERSDLESMLDDFLDNYELASGGRKIVKKCEEKERLMKAADSVSKGKLSMRRRREQEKQEQSKSTGDYKKDVNSLRGITGGLNSLKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.6
3 0.53
4 0.5
5 0.5
6 0.53
7 0.56
8 0.64
9 0.6
10 0.54
11 0.56
12 0.57
13 0.53
14 0.49
15 0.43
16 0.36
17 0.34
18 0.34
19 0.28
20 0.21
21 0.19
22 0.18
23 0.16
24 0.15
25 0.17
26 0.16
27 0.2
28 0.24
29 0.32
30 0.4
31 0.49
32 0.59
33 0.64
34 0.72
35 0.78
36 0.83
37 0.85
38 0.85
39 0.83
40 0.79
41 0.71
42 0.62
43 0.57
44 0.47
45 0.44
46 0.38
47 0.33
48 0.3
49 0.31
50 0.3
51 0.26
52 0.34
53 0.32
54 0.34
55 0.35
56 0.35
57 0.41
58 0.44
59 0.48
60 0.45
61 0.47
62 0.5
63 0.53
64 0.56
65 0.57
66 0.61
67 0.63
68 0.65
69 0.68
70 0.65
71 0.67
72 0.64
73 0.65
74 0.68
75 0.63
76 0.6
77 0.52
78 0.5
79 0.44
80 0.41
81 0.32
82 0.26
83 0.25
84 0.22
85 0.21
86 0.17
87 0.15
88 0.14
89 0.13
90 0.08
91 0.06
92 0.05
93 0.04
94 0.04
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.07
99 0.09
100 0.11
101 0.12
102 0.14
103 0.16
104 0.21
105 0.25
106 0.28
107 0.3
108 0.28
109 0.29
110 0.32
111 0.36
112 0.32
113 0.3
114 0.27
115 0.26
116 0.27
117 0.25
118 0.2
119 0.14
120 0.14
121 0.15
122 0.13
123 0.12
124 0.12
125 0.13
126 0.16
127 0.19
128 0.2
129 0.27
130 0.32
131 0.38
132 0.41
133 0.44
134 0.48
135 0.55
136 0.61
137 0.61
138 0.63
139 0.61
140 0.65
141 0.62
142 0.62
143 0.57
144 0.51
145 0.46
146 0.42
147 0.38
148 0.34
149 0.34
150 0.27
151 0.23
152 0.22
153 0.22
154 0.2
155 0.21
156 0.26
157 0.26
158 0.29
159 0.34
160 0.36
161 0.38
162 0.37
163 0.36
164 0.3
165 0.27
166 0.29
167 0.24
168 0.28
169 0.24
170 0.24
171 0.22
172 0.23
173 0.25
174 0.25
175 0.24
176 0.15
177 0.14
178 0.14
179 0.13
180 0.12
181 0.11
182 0.08
183 0.07
184 0.08
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.11
191 0.15
192 0.15
193 0.15
194 0.16
195 0.2
196 0.19
197 0.18
198 0.16
199 0.12
200 0.1
201 0.09
202 0.08
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.04
209 0.04
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.04
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.11
219 0.13
220 0.13
221 0.14
222 0.12
223 0.12
224 0.19
225 0.22
226 0.22
227 0.2
228 0.2
229 0.19
230 0.18
231 0.17
232 0.11
233 0.1
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.09
241 0.07
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.05
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.04
275 0.04
276 0.03
277 0.03
278 0.03
279 0.03
280 0.03
281 0.03
282 0.02
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.04
287 0.03
288 0.03
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.05
294 0.04
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.05
305 0.06
306 0.06
307 0.07
308 0.06
309 0.06
310 0.05
311 0.05
312 0.06
313 0.05
314 0.05
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.06
326 0.07
327 0.08
328 0.1
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.13
333 0.12
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.12
338 0.17
339 0.19
340 0.18
341 0.22
342 0.21
343 0.21
344 0.27
345 0.28
346 0.34
347 0.42
348 0.44
349 0.42
350 0.47
351 0.5
352 0.44
353 0.44
354 0.39
355 0.3
356 0.27
357 0.25
358 0.2
359 0.16
360 0.15
361 0.13
362 0.1
363 0.11
364 0.1
365 0.11
366 0.11
367 0.1
368 0.1
369 0.1
370 0.09
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.05
375 0.06
376 0.07
377 0.08
378 0.08
379 0.08
380 0.08
381 0.14
382 0.2
383 0.23
384 0.27
385 0.32
386 0.4
387 0.48
388 0.58
389 0.64
390 0.69
391 0.75
392 0.82
393 0.87
394 0.91
395 0.91
396 0.91
397 0.9
398 0.87
399 0.82
400 0.74
401 0.65
402 0.55
403 0.46
404 0.35
405 0.24
406 0.18
407 0.11
408 0.1
409 0.09
410 0.09
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.1
415 0.1
416 0.09
417 0.09
418 0.09
419 0.1
420 0.11
421 0.11
422 0.1
423 0.1
424 0.1
425 0.09
426 0.08
427 0.07
428 0.09
429 0.1
430 0.1
431 0.11
432 0.11
433 0.12
434 0.12
435 0.13
436 0.11
437 0.1
438 0.11
439 0.11
440 0.11
441 0.13
442 0.13
443 0.12
444 0.12
445 0.12
446 0.1
447 0.09
448 0.15
449 0.13
450 0.15
451 0.15
452 0.16
453 0.17
454 0.19
455 0.19
456 0.16
457 0.19
458 0.18
459 0.19
460 0.17
461 0.15
462 0.13
463 0.13
464 0.12
465 0.08
466 0.07
467 0.07
468 0.07
469 0.07
470 0.1
471 0.1
472 0.12
473 0.18
474 0.23
475 0.25
476 0.34
477 0.44
478 0.5
479 0.55
480 0.63
481 0.66
482 0.7
483 0.77
484 0.75
485 0.72
486 0.65
487 0.6
488 0.51
489 0.5
490 0.46
491 0.41
492 0.36
493 0.33
494 0.32
495 0.32
496 0.35
497 0.35
498 0.41
499 0.47
500 0.54
501 0.61
502 0.69
503 0.78
504 0.83
505 0.85
506 0.87
507 0.88
508 0.88
509 0.87
510 0.84
511 0.78
512 0.73
513 0.66
514 0.65
515 0.61
516 0.54
517 0.5
518 0.49
519 0.52
520 0.54
521 0.54
522 0.49
523 0.49
524 0.48
525 0.44
526 0.4
527 0.34
528 0.27
529 0.25
530 0.25