Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E5RFH1

Protein Details
Accession A0A1E5RFH1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MISKLKKRNISRPLNSHTLLHydrophilic
332-351DMIKDYKRRKQQLTELKIRKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 8, mito 4, pero 4, cyto 3.5, E.R. 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040939  Vps38  
Gene Ontology GO:0034272  C:phosphatidylinositol 3-kinase complex, class III, type II  
Pfam View protein in Pfam  
PF17649  VPS38  
Amino Acid Sequences MISKLKKRNISRPLNSHTLLTSMAFPIARKLRHLKCVRFENIPLAASLSSIEWFYTIELVPGNQLIYISENSPVTLDTATRSIESSDHLNDLNNNRSLLTIEFDQLPEFTYNNHNVKISLYACVENVNCNSDGDDERSNHSLERSSSETVSVKIKELTLCLDANLRLKKNVLKTNNSTNAFYPTFQFDDLXWYVYVPETLSQERDETHSLESIDDAAIELAKFAYTNRKSYSFNALLKLNKLLEYHYELDQEISNLKDEIDVNYQLPEQPYKKTHPVFQIQSAIDQLELDVQKQQNDKAKQEGRNDKLNFIKISLQEKLKENVDFLLPDDSNDMIKDYKRRKQQLTELKIRKIQKLLNIFESCNVVSGLYPKTSVKKQYPTLAVLQPNDLLLESQTNDKKRLLLNSKLVFSFMVVLLWWNTITPFTLCPQKANKMRASK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.73
3 0.64
4 0.54
5 0.45
6 0.36
7 0.28
8 0.23
9 0.16
10 0.17
11 0.16
12 0.15
13 0.22
14 0.28
15 0.28
16 0.32
17 0.41
18 0.46
19 0.56
20 0.65
21 0.65
22 0.67
23 0.76
24 0.74
25 0.69
26 0.65
27 0.61
28 0.55
29 0.47
30 0.38
31 0.3
32 0.26
33 0.2
34 0.19
35 0.12
36 0.09
37 0.09
38 0.09
39 0.07
40 0.07
41 0.08
42 0.09
43 0.08
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.1
48 0.1
49 0.1
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.1
54 0.11
55 0.11
56 0.13
57 0.13
58 0.13
59 0.13
60 0.13
61 0.11
62 0.1
63 0.1
64 0.09
65 0.11
66 0.12
67 0.12
68 0.13
69 0.12
70 0.12
71 0.14
72 0.16
73 0.15
74 0.16
75 0.16
76 0.17
77 0.21
78 0.25
79 0.29
80 0.27
81 0.26
82 0.24
83 0.24
84 0.24
85 0.2
86 0.18
87 0.14
88 0.13
89 0.14
90 0.14
91 0.14
92 0.13
93 0.14
94 0.12
95 0.11
96 0.11
97 0.16
98 0.23
99 0.25
100 0.27
101 0.25
102 0.24
103 0.25
104 0.28
105 0.23
106 0.19
107 0.18
108 0.17
109 0.17
110 0.19
111 0.19
112 0.17
113 0.17
114 0.17
115 0.16
116 0.15
117 0.15
118 0.15
119 0.17
120 0.17
121 0.2
122 0.18
123 0.21
124 0.23
125 0.23
126 0.21
127 0.2
128 0.2
129 0.17
130 0.2
131 0.2
132 0.2
133 0.2
134 0.22
135 0.22
136 0.2
137 0.23
138 0.2
139 0.18
140 0.17
141 0.18
142 0.16
143 0.16
144 0.17
145 0.15
146 0.14
147 0.13
148 0.14
149 0.14
150 0.2
151 0.23
152 0.22
153 0.2
154 0.22
155 0.26
156 0.32
157 0.38
158 0.39
159 0.41
160 0.44
161 0.53
162 0.59
163 0.57
164 0.51
165 0.44
166 0.43
167 0.38
168 0.33
169 0.25
170 0.19
171 0.18
172 0.17
173 0.17
174 0.11
175 0.14
176 0.14
177 0.13
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.07
184 0.09
185 0.09
186 0.1
187 0.1
188 0.11
189 0.1
190 0.13
191 0.14
192 0.13
193 0.13
194 0.13
195 0.13
196 0.12
197 0.12
198 0.1
199 0.08
200 0.06
201 0.06
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.13
211 0.15
212 0.18
213 0.2
214 0.23
215 0.26
216 0.28
217 0.36
218 0.33
219 0.33
220 0.33
221 0.34
222 0.32
223 0.31
224 0.3
225 0.22
226 0.18
227 0.16
228 0.14
229 0.14
230 0.17
231 0.18
232 0.17
233 0.17
234 0.16
235 0.17
236 0.16
237 0.14
238 0.1
239 0.09
240 0.08
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.08
245 0.1
246 0.13
247 0.13
248 0.13
249 0.14
250 0.14
251 0.14
252 0.14
253 0.17
254 0.15
255 0.18
256 0.22
257 0.27
258 0.35
259 0.35
260 0.4
261 0.42
262 0.48
263 0.47
264 0.47
265 0.48
266 0.4
267 0.39
268 0.34
269 0.27
270 0.19
271 0.16
272 0.12
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.14
277 0.14
278 0.18
279 0.2
280 0.24
281 0.28
282 0.32
283 0.34
284 0.39
285 0.46
286 0.49
287 0.57
288 0.63
289 0.59
290 0.64
291 0.63
292 0.58
293 0.56
294 0.54
295 0.45
296 0.37
297 0.37
298 0.32
299 0.35
300 0.35
301 0.33
302 0.33
303 0.36
304 0.37
305 0.36
306 0.32
307 0.28
308 0.25
309 0.23
310 0.19
311 0.17
312 0.19
313 0.16
314 0.15
315 0.16
316 0.15
317 0.14
318 0.14
319 0.14
320 0.11
321 0.14
322 0.23
323 0.29
324 0.36
325 0.46
326 0.54
327 0.6
328 0.67
329 0.74
330 0.76
331 0.78
332 0.81
333 0.79
334 0.76
335 0.76
336 0.71
337 0.66
338 0.61
339 0.56
340 0.53
341 0.54
342 0.52
343 0.54
344 0.52
345 0.48
346 0.43
347 0.42
348 0.34
349 0.27
350 0.23
351 0.14
352 0.12
353 0.15
354 0.16
355 0.13
356 0.15
357 0.17
358 0.22
359 0.28
360 0.36
361 0.41
362 0.47
363 0.52
364 0.58
365 0.61
366 0.59
367 0.59
368 0.57
369 0.54
370 0.47
371 0.43
372 0.35
373 0.3
374 0.27
375 0.21
376 0.15
377 0.1
378 0.12
379 0.11
380 0.19
381 0.25
382 0.28
383 0.31
384 0.32
385 0.35
386 0.37
387 0.46
388 0.46
389 0.49
390 0.55
391 0.57
392 0.6
393 0.56
394 0.52
395 0.42
396 0.35
397 0.29
398 0.19
399 0.14
400 0.1
401 0.12
402 0.12
403 0.13
404 0.12
405 0.09
406 0.09
407 0.1
408 0.12
409 0.12
410 0.13
411 0.16
412 0.25
413 0.26
414 0.32
415 0.38
416 0.47
417 0.53
418 0.59