Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E5RI07

Protein Details
Accession A0A1E5RI07    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
140-168GTPSGPQRATKKKRTTNKRKQTGENETNGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
134-159GKPKSNGTPSGPQRATKKKRTTNKRK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 15.833, mito_nucl 11.165, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
Amino Acid Sequences MSTIEQVQEPVVSAVEQTEQAPVAQIVDEKSSTNETATPGDVVEEAAEPEKTFVPAPVPVASPWKVVDVSSATTGGKKVPSVAEAVEELKSNNENKSRNNQLLRSSSKDRWVPLHANITVSTKQPNSSPRQGSGKPKSNGTPSGPQRATKKKRTTNKRKQTGENETNGEELASDSISESSIPEDSKASSASASSKKPVHGNGVSKRATNKSKPFKKTQDEASIGSGESSETAESSNVEENATQVSETEGADSAERKPFSKRQNGYSYSNGNNNNRPFSRNGNGPRRSTQPRHHHNTGDGSSRPGYYNNNNGYRKHHNNYGYGQFPSQNFGNGTESQSHFKAHHPPSPYFAIKKVAKQLQYYFGEQNLTKDAYLKNQFSSKNGFIPLSLISKFYRVVNLSYGGDPNIILGALHQILSSSPSESNVEVAVLKENLENDNVLSKYVIRSNKWEQFLGEESQDIDYDLEKTVEAADLASFEVEAPVFETSTEEHNENNIDEPQAHAQSAKVIEQSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.1
3 0.11
4 0.1
5 0.11
6 0.11
7 0.11
8 0.13
9 0.12
10 0.11
11 0.11
12 0.12
13 0.12
14 0.15
15 0.16
16 0.15
17 0.17
18 0.2
19 0.19
20 0.19
21 0.2
22 0.19
23 0.21
24 0.21
25 0.19
26 0.15
27 0.16
28 0.14
29 0.12
30 0.11
31 0.09
32 0.09
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.11
37 0.12
38 0.13
39 0.13
40 0.12
41 0.14
42 0.15
43 0.18
44 0.18
45 0.19
46 0.19
47 0.24
48 0.25
49 0.24
50 0.22
51 0.23
52 0.21
53 0.19
54 0.21
55 0.18
56 0.19
57 0.19
58 0.19
59 0.17
60 0.18
61 0.18
62 0.18
63 0.17
64 0.15
65 0.16
66 0.16
67 0.17
68 0.18
69 0.18
70 0.17
71 0.16
72 0.17
73 0.15
74 0.14
75 0.13
76 0.14
77 0.17
78 0.17
79 0.22
80 0.27
81 0.3
82 0.35
83 0.44
84 0.5
85 0.55
86 0.59
87 0.57
88 0.57
89 0.62
90 0.62
91 0.6
92 0.58
93 0.54
94 0.55
95 0.55
96 0.5
97 0.46
98 0.48
99 0.45
100 0.43
101 0.47
102 0.4
103 0.38
104 0.37
105 0.37
106 0.32
107 0.29
108 0.28
109 0.21
110 0.22
111 0.24
112 0.31
113 0.34
114 0.41
115 0.43
116 0.44
117 0.51
118 0.55
119 0.61
120 0.64
121 0.66
122 0.59
123 0.59
124 0.59
125 0.57
126 0.56
127 0.51
128 0.51
129 0.46
130 0.54
131 0.51
132 0.51
133 0.54
134 0.6
135 0.63
136 0.64
137 0.7
138 0.69
139 0.77
140 0.85
141 0.88
142 0.89
143 0.91
144 0.91
145 0.87
146 0.87
147 0.87
148 0.86
149 0.82
150 0.75
151 0.67
152 0.57
153 0.5
154 0.41
155 0.31
156 0.2
157 0.13
158 0.09
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.09
172 0.1
173 0.1
174 0.09
175 0.08
176 0.09
177 0.14
178 0.17
179 0.18
180 0.21
181 0.23
182 0.25
183 0.28
184 0.29
185 0.31
186 0.31
187 0.38
188 0.4
189 0.46
190 0.45
191 0.43
192 0.45
193 0.44
194 0.45
195 0.45
196 0.49
197 0.52
198 0.6
199 0.65
200 0.7
201 0.73
202 0.73
203 0.7
204 0.68
205 0.66
206 0.59
207 0.55
208 0.48
209 0.39
210 0.32
211 0.27
212 0.19
213 0.1
214 0.08
215 0.07
216 0.05
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.05
221 0.06
222 0.08
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.07
227 0.08
228 0.08
229 0.06
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.08
240 0.11
241 0.12
242 0.12
243 0.16
244 0.23
245 0.3
246 0.39
247 0.4
248 0.44
249 0.52
250 0.56
251 0.56
252 0.53
253 0.51
254 0.43
255 0.46
256 0.44
257 0.38
258 0.4
259 0.37
260 0.38
261 0.34
262 0.34
263 0.31
264 0.32
265 0.32
266 0.34
267 0.4
268 0.46
269 0.5
270 0.51
271 0.51
272 0.52
273 0.56
274 0.55
275 0.56
276 0.57
277 0.61
278 0.66
279 0.68
280 0.63
281 0.58
282 0.59
283 0.51
284 0.45
285 0.36
286 0.3
287 0.27
288 0.26
289 0.23
290 0.19
291 0.2
292 0.2
293 0.27
294 0.31
295 0.39
296 0.41
297 0.42
298 0.47
299 0.51
300 0.55
301 0.5
302 0.51
303 0.46
304 0.47
305 0.5
306 0.49
307 0.42
308 0.36
309 0.33
310 0.29
311 0.26
312 0.25
313 0.21
314 0.18
315 0.16
316 0.17
317 0.2
318 0.18
319 0.19
320 0.2
321 0.22
322 0.22
323 0.22
324 0.21
325 0.19
326 0.21
327 0.3
328 0.3
329 0.33
330 0.35
331 0.36
332 0.39
333 0.44
334 0.43
335 0.35
336 0.33
337 0.37
338 0.35
339 0.38
340 0.42
341 0.42
342 0.42
343 0.44
344 0.45
345 0.45
346 0.45
347 0.45
348 0.37
349 0.33
350 0.33
351 0.29
352 0.28
353 0.23
354 0.2
355 0.17
356 0.19
357 0.18
358 0.23
359 0.29
360 0.29
361 0.28
362 0.33
363 0.34
364 0.34
365 0.4
366 0.34
367 0.32
368 0.32
369 0.3
370 0.24
371 0.24
372 0.24
373 0.2
374 0.18
375 0.16
376 0.15
377 0.17
378 0.18
379 0.17
380 0.2
381 0.18
382 0.19
383 0.2
384 0.22
385 0.23
386 0.23
387 0.23
388 0.18
389 0.17
390 0.15
391 0.12
392 0.09
393 0.07
394 0.05
395 0.05
396 0.07
397 0.07
398 0.08
399 0.07
400 0.07
401 0.08
402 0.1
403 0.11
404 0.1
405 0.1
406 0.12
407 0.14
408 0.14
409 0.15
410 0.13
411 0.13
412 0.11
413 0.11
414 0.12
415 0.11
416 0.11
417 0.12
418 0.13
419 0.13
420 0.14
421 0.14
422 0.11
423 0.17
424 0.16
425 0.15
426 0.15
427 0.15
428 0.17
429 0.23
430 0.28
431 0.25
432 0.33
433 0.42
434 0.49
435 0.52
436 0.5
437 0.44
438 0.43
439 0.44
440 0.4
441 0.31
442 0.24
443 0.21
444 0.21
445 0.2
446 0.16
447 0.13
448 0.1
449 0.11
450 0.11
451 0.1
452 0.09
453 0.09
454 0.09
455 0.09
456 0.09
457 0.08
458 0.07
459 0.07
460 0.08
461 0.07
462 0.06
463 0.06
464 0.07
465 0.06
466 0.06
467 0.07
468 0.08
469 0.08
470 0.08
471 0.09
472 0.1
473 0.14
474 0.17
475 0.17
476 0.17
477 0.19
478 0.22
479 0.21
480 0.23
481 0.2
482 0.19
483 0.18
484 0.21
485 0.24
486 0.24
487 0.24
488 0.21
489 0.19
490 0.23
491 0.26
492 0.25