Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E5R538

Protein Details
Accession A0A1E5R538    Localization Confidence High Confidence Score 23.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
156-187DREKTKKDSKGAHKNNKTKSNKKKEYQPAMEKBasic
341-364GAGVTKSKRSKRGSTKDGKKRSSLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
159-179KTKKDSKGAHKNNKTKSNKKK
346-361KSKRSKRGSTKDGKKR
429-432KKRK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MEDNGLPEERVRKHIEESEDDEDVDVNVNNRVINNDDDEEQSYAGGNHLQPDYQAEGVVMDEHARKRHDLEVRMTQALKRQGRGSSRRSRRDEEDLEQMLDDKILRLKDEMTLAAQRDMETIERRINDDEEEEEEEDDEEDDEEDDEEDYEEDDEDREKTKKDSKGAHKNNKTKSNKKKEYQPAMEKVKLLPKVAAALNKVSLADTILDNNLLQAVKFWLEPLPDGSLPSFEIQKTLIQAIAQLPIKTEHLKESGLGKVMIFYTKSSRVEPSLKRLSDKIVAEWTRPIIGASDNYRDKSIMKIDFDVQKYKEKSTQELKKNLAKEKSARLALANGGADVSGAGVTKSKRSKRGSTKDGKKRSSLYDPGQQRKNRTVIPQQTTTDYKYAPVSNVDNLKDHQLSFKTSGVGSSLSNSELYKRINSRLGNTKKRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.49
3 0.48
4 0.51
5 0.5
6 0.45
7 0.42
8 0.37
9 0.3
10 0.25
11 0.2
12 0.14
13 0.1
14 0.12
15 0.13
16 0.13
17 0.13
18 0.15
19 0.16
20 0.18
21 0.21
22 0.21
23 0.22
24 0.23
25 0.25
26 0.24
27 0.21
28 0.19
29 0.15
30 0.13
31 0.12
32 0.14
33 0.12
34 0.14
35 0.15
36 0.15
37 0.15
38 0.18
39 0.2
40 0.17
41 0.16
42 0.12
43 0.12
44 0.12
45 0.12
46 0.09
47 0.09
48 0.13
49 0.16
50 0.2
51 0.22
52 0.23
53 0.26
54 0.33
55 0.38
56 0.4
57 0.44
58 0.49
59 0.52
60 0.54
61 0.52
62 0.45
63 0.45
64 0.48
65 0.45
66 0.39
67 0.38
68 0.41
69 0.49
70 0.56
71 0.59
72 0.6
73 0.67
74 0.74
75 0.77
76 0.77
77 0.73
78 0.75
79 0.71
80 0.64
81 0.63
82 0.55
83 0.49
84 0.42
85 0.37
86 0.27
87 0.22
88 0.18
89 0.1
90 0.11
91 0.11
92 0.12
93 0.12
94 0.13
95 0.15
96 0.16
97 0.16
98 0.15
99 0.18
100 0.19
101 0.19
102 0.19
103 0.17
104 0.15
105 0.16
106 0.16
107 0.15
108 0.17
109 0.19
110 0.19
111 0.21
112 0.22
113 0.22
114 0.21
115 0.19
116 0.18
117 0.17
118 0.19
119 0.17
120 0.15
121 0.14
122 0.13
123 0.12
124 0.11
125 0.08
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.06
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.1
144 0.11
145 0.12
146 0.16
147 0.24
148 0.29
149 0.35
150 0.43
151 0.51
152 0.61
153 0.7
154 0.77
155 0.79
156 0.82
157 0.84
158 0.85
159 0.83
160 0.82
161 0.83
162 0.83
163 0.83
164 0.79
165 0.82
166 0.81
167 0.83
168 0.82
169 0.78
170 0.75
171 0.72
172 0.69
173 0.6
174 0.51
175 0.47
176 0.4
177 0.33
178 0.25
179 0.19
180 0.2
181 0.21
182 0.21
183 0.16
184 0.15
185 0.15
186 0.14
187 0.14
188 0.11
189 0.09
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.08
209 0.09
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.09
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.1
223 0.09
224 0.09
225 0.07
226 0.09
227 0.09
228 0.13
229 0.13
230 0.12
231 0.12
232 0.13
233 0.15
234 0.15
235 0.15
236 0.14
237 0.14
238 0.14
239 0.15
240 0.16
241 0.16
242 0.16
243 0.16
244 0.13
245 0.12
246 0.12
247 0.12
248 0.1
249 0.09
250 0.12
251 0.17
252 0.19
253 0.19
254 0.2
255 0.24
256 0.31
257 0.33
258 0.38
259 0.41
260 0.41
261 0.41
262 0.4
263 0.4
264 0.38
265 0.36
266 0.3
267 0.3
268 0.3
269 0.29
270 0.29
271 0.26
272 0.21
273 0.2
274 0.18
275 0.1
276 0.11
277 0.13
278 0.14
279 0.21
280 0.22
281 0.23
282 0.24
283 0.23
284 0.23
285 0.23
286 0.27
287 0.24
288 0.23
289 0.25
290 0.28
291 0.34
292 0.36
293 0.38
294 0.34
295 0.38
296 0.38
297 0.4
298 0.41
299 0.37
300 0.41
301 0.46
302 0.53
303 0.54
304 0.59
305 0.62
306 0.62
307 0.66
308 0.67
309 0.62
310 0.58
311 0.55
312 0.55
313 0.57
314 0.53
315 0.47
316 0.41
317 0.37
318 0.33
319 0.31
320 0.22
321 0.15
322 0.13
323 0.12
324 0.1
325 0.08
326 0.07
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.07
331 0.08
332 0.16
333 0.25
334 0.31
335 0.4
336 0.47
337 0.57
338 0.65
339 0.75
340 0.79
341 0.81
342 0.86
343 0.87
344 0.91
345 0.85
346 0.8
347 0.74
348 0.71
349 0.69
350 0.66
351 0.61
352 0.6
353 0.65
354 0.68
355 0.71
356 0.69
357 0.67
358 0.66
359 0.66
360 0.62
361 0.61
362 0.63
363 0.64
364 0.66
365 0.66
366 0.6
367 0.6
368 0.58
369 0.54
370 0.47
371 0.38
372 0.33
373 0.31
374 0.31
375 0.27
376 0.28
377 0.28
378 0.3
379 0.36
380 0.35
381 0.34
382 0.33
383 0.38
384 0.35
385 0.32
386 0.33
387 0.29
388 0.33
389 0.33
390 0.35
391 0.3
392 0.28
393 0.28
394 0.24
395 0.23
396 0.18
397 0.17
398 0.16
399 0.15
400 0.16
401 0.16
402 0.17
403 0.21
404 0.23
405 0.28
406 0.32
407 0.37
408 0.43
409 0.46
410 0.5
411 0.56
412 0.64