Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E5RDS6

Protein Details
Accession A0A1E5RDS6    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
402-421LHLDREFHFPNKNKKRKPNDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
282-300EAIRAQRRKEIQHTSRXKN
420-423KKRK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MISXSAEIISKRSEEPEDTDHEKDDPILQYQKNLLPLRLANPDYKCPLPTEDIIKESAVATKKVIEKLLGQSGPISSTAISSSATRLNNSKNFSHSIPNIFNDNRAKTXVKVIERHQDPLAPSTKKILKKIPLADDNTELLETPILQNDKGIGHKVSEKEKALLNIPSAVSSWENSKGFSVSIDKRLQYNQSDKKNAPKEINDKFVELTKALDATSEKKRIELAQRNERLLKVKEEQEEIERIKGKISEIKNFEQRQKETQRYSRYNQQNKXERPAQGDRREAIRAQRRKEIQHTSRXKNMPKKAPASTLEQRDMQXASGSLDEEGEKEVQYDSRFFTRAADASWKRSDDQMYDTPLFHQRNETASSIYRNRRSAQRTERGAENDVVNLRDTPVEFVGTEAKDETTLHLDREFHFPNKNKKRKPND
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.33
3 0.37
4 0.4
5 0.4
6 0.38
7 0.35
8 0.33
9 0.29
10 0.29
11 0.25
12 0.25
13 0.31
14 0.3
15 0.33
16 0.37
17 0.39
18 0.42
19 0.42
20 0.38
21 0.35
22 0.37
23 0.38
24 0.41
25 0.4
26 0.38
27 0.39
28 0.44
29 0.44
30 0.43
31 0.4
32 0.34
33 0.36
34 0.34
35 0.34
36 0.36
37 0.34
38 0.34
39 0.35
40 0.32
41 0.28
42 0.24
43 0.26
44 0.21
45 0.19
46 0.18
47 0.22
48 0.27
49 0.29
50 0.3
51 0.26
52 0.28
53 0.32
54 0.39
55 0.34
56 0.29
57 0.27
58 0.26
59 0.26
60 0.22
61 0.17
62 0.09
63 0.09
64 0.1
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.11
69 0.16
70 0.17
71 0.18
72 0.22
73 0.29
74 0.34
75 0.38
76 0.38
77 0.36
78 0.39
79 0.39
80 0.42
81 0.38
82 0.39
83 0.38
84 0.37
85 0.39
86 0.36
87 0.4
88 0.39
89 0.37
90 0.35
91 0.34
92 0.33
93 0.29
94 0.36
95 0.37
96 0.37
97 0.4
98 0.42
99 0.45
100 0.48
101 0.47
102 0.42
103 0.37
104 0.37
105 0.38
106 0.33
107 0.29
108 0.32
109 0.38
110 0.4
111 0.44
112 0.46
113 0.46
114 0.52
115 0.58
116 0.59
117 0.59
118 0.58
119 0.55
120 0.49
121 0.43
122 0.36
123 0.29
124 0.21
125 0.14
126 0.1
127 0.09
128 0.07
129 0.09
130 0.1
131 0.09
132 0.09
133 0.11
134 0.12
135 0.13
136 0.15
137 0.12
138 0.12
139 0.17
140 0.2
141 0.24
142 0.27
143 0.27
144 0.27
145 0.28
146 0.29
147 0.27
148 0.26
149 0.21
150 0.19
151 0.17
152 0.16
153 0.14
154 0.14
155 0.11
156 0.1
157 0.12
158 0.14
159 0.14
160 0.14
161 0.15
162 0.14
163 0.13
164 0.14
165 0.18
166 0.15
167 0.22
168 0.24
169 0.24
170 0.25
171 0.27
172 0.3
173 0.28
174 0.35
175 0.37
176 0.41
177 0.46
178 0.46
179 0.53
180 0.55
181 0.55
182 0.49
183 0.47
184 0.48
185 0.47
186 0.53
187 0.44
188 0.39
189 0.35
190 0.34
191 0.28
192 0.2
193 0.17
194 0.1
195 0.1
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.11
200 0.17
201 0.21
202 0.21
203 0.21
204 0.22
205 0.25
206 0.34
207 0.39
208 0.41
209 0.46
210 0.49
211 0.51
212 0.52
213 0.49
214 0.44
215 0.37
216 0.33
217 0.27
218 0.29
219 0.29
220 0.3
221 0.3
222 0.27
223 0.3
224 0.26
225 0.26
226 0.23
227 0.21
228 0.2
229 0.2
230 0.19
231 0.21
232 0.23
233 0.27
234 0.29
235 0.33
236 0.41
237 0.43
238 0.48
239 0.48
240 0.48
241 0.5
242 0.53
243 0.56
244 0.55
245 0.59
246 0.63
247 0.62
248 0.64
249 0.65
250 0.67
251 0.69
252 0.7
253 0.72
254 0.72
255 0.71
256 0.74
257 0.68
258 0.61
259 0.59
260 0.61
261 0.57
262 0.57
263 0.53
264 0.49
265 0.47
266 0.45
267 0.47
268 0.48
269 0.49
270 0.44
271 0.5
272 0.52
273 0.55
274 0.61
275 0.63
276 0.62
277 0.66
278 0.7
279 0.68
280 0.73
281 0.77
282 0.76
283 0.74
284 0.73
285 0.71
286 0.68
287 0.68
288 0.65
289 0.58
290 0.59
291 0.57
292 0.56
293 0.49
294 0.46
295 0.41
296 0.36
297 0.33
298 0.25
299 0.21
300 0.15
301 0.12
302 0.12
303 0.11
304 0.1
305 0.1
306 0.1
307 0.09
308 0.09
309 0.08
310 0.08
311 0.09
312 0.12
313 0.13
314 0.14
315 0.15
316 0.18
317 0.19
318 0.19
319 0.21
320 0.22
321 0.22
322 0.22
323 0.3
324 0.29
325 0.34
326 0.38
327 0.37
328 0.34
329 0.37
330 0.38
331 0.3
332 0.34
333 0.33
334 0.35
335 0.35
336 0.35
337 0.34
338 0.39
339 0.38
340 0.33
341 0.33
342 0.28
343 0.3
344 0.34
345 0.32
346 0.27
347 0.28
348 0.35
349 0.38
350 0.45
351 0.48
352 0.48
353 0.51
354 0.57
355 0.6
356 0.64
357 0.66
358 0.67
359 0.67
360 0.67
361 0.69
362 0.65
363 0.62
364 0.55
365 0.45
366 0.4
367 0.35
368 0.32
369 0.26
370 0.22
371 0.2
372 0.19
373 0.18
374 0.17
375 0.16
376 0.17
377 0.15
378 0.16
379 0.21
380 0.19
381 0.2
382 0.17
383 0.17
384 0.16
385 0.17
386 0.18
387 0.19
388 0.2
389 0.2
390 0.23
391 0.24
392 0.26
393 0.33
394 0.35
395 0.33
396 0.41
397 0.47
398 0.56
399 0.65
400 0.74
401 0.76