Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2AT48

Protein Details
Accession H2AT48    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
158-183LQYSYKSTAKPKEKKKNTNRIVALKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
166-184AKPKEKKKNTNRIVALKKT
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039723  Vps71/ZNHIT1  
IPR007529  Znf_HIT  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
KEGG kaf:KAFR_0C05570  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51083  ZF_HIT  
Amino Acid Sequences MPSSLVEEIDKKTYNPNVYFTTSDPQSYRTKNKVGKSSGSSQFRSVKRVNYSLTDLEARLYATKPDGKGNDNENLPGNNSTNSYLDRYTPQQIMQSQRRFMELNTENLSDLKDIPSLLSSITGYDKDKISSSTSTISQIDSDLSARAAKNKWEIPKSLQYSYKSTAKPKEKKKNTNRIVALKKTLSSKRKLPTYVDTMNQLDKSIIFNNVYNKKYFKVLPLITTCSICGGYDSISSCVNCNDKICSLRCYKLHNETRCTHS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.4
3 0.42
4 0.41
5 0.44
6 0.45
7 0.41
8 0.41
9 0.34
10 0.35
11 0.32
12 0.31
13 0.35
14 0.4
15 0.46
16 0.46
17 0.54
18 0.57
19 0.64
20 0.69
21 0.67
22 0.66
23 0.64
24 0.66
25 0.66
26 0.65
27 0.59
28 0.56
29 0.59
30 0.54
31 0.55
32 0.5
33 0.48
34 0.48
35 0.51
36 0.47
37 0.43
38 0.46
39 0.4
40 0.39
41 0.33
42 0.27
43 0.23
44 0.21
45 0.17
46 0.14
47 0.13
48 0.12
49 0.13
50 0.17
51 0.18
52 0.23
53 0.26
54 0.27
55 0.31
56 0.33
57 0.35
58 0.32
59 0.32
60 0.29
61 0.26
62 0.25
63 0.23
64 0.2
65 0.16
66 0.16
67 0.16
68 0.16
69 0.17
70 0.17
71 0.16
72 0.16
73 0.18
74 0.2
75 0.22
76 0.22
77 0.21
78 0.23
79 0.26
80 0.33
81 0.39
82 0.41
83 0.4
84 0.39
85 0.4
86 0.37
87 0.33
88 0.34
89 0.27
90 0.27
91 0.27
92 0.27
93 0.25
94 0.24
95 0.25
96 0.15
97 0.14
98 0.1
99 0.08
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.06
105 0.06
106 0.05
107 0.06
108 0.07
109 0.08
110 0.08
111 0.1
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.12
116 0.13
117 0.13
118 0.13
119 0.13
120 0.14
121 0.15
122 0.15
123 0.14
124 0.11
125 0.11
126 0.1
127 0.08
128 0.08
129 0.06
130 0.06
131 0.08
132 0.08
133 0.11
134 0.12
135 0.14
136 0.18
137 0.22
138 0.28
139 0.29
140 0.31
141 0.33
142 0.4
143 0.42
144 0.42
145 0.43
146 0.4
147 0.42
148 0.44
149 0.46
150 0.4
151 0.42
152 0.47
153 0.52
154 0.58
155 0.65
156 0.72
157 0.75
158 0.83
159 0.88
160 0.9
161 0.86
162 0.87
163 0.82
164 0.81
165 0.78
166 0.71
167 0.66
168 0.56
169 0.52
170 0.49
171 0.51
172 0.48
173 0.46
174 0.49
175 0.51
176 0.56
177 0.57
178 0.55
179 0.52
180 0.54
181 0.53
182 0.47
183 0.44
184 0.39
185 0.39
186 0.35
187 0.29
188 0.21
189 0.18
190 0.19
191 0.16
192 0.17
193 0.15
194 0.18
195 0.26
196 0.33
197 0.35
198 0.34
199 0.35
200 0.33
201 0.36
202 0.36
203 0.32
204 0.34
205 0.35
206 0.38
207 0.41
208 0.44
209 0.41
210 0.4
211 0.35
212 0.27
213 0.25
214 0.19
215 0.16
216 0.11
217 0.11
218 0.13
219 0.15
220 0.15
221 0.17
222 0.17
223 0.17
224 0.21
225 0.23
226 0.22
227 0.22
228 0.25
229 0.27
230 0.33
231 0.35
232 0.37
233 0.4
234 0.45
235 0.47
236 0.5
237 0.53
238 0.58
239 0.65
240 0.67
241 0.68