Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2APX1

Protein Details
Accession H2APX1    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
69-88KCNNCSQRGHLKKNCPHVICHydrophilic
256-281NRNNNNTTSKKRRRHDNNNNNNNNNNHydrophilic
294-316NNNNSSRKKKTVQPHQRGKTLKPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016713  Air1/2_Saccharomycetales  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0043229  C:intracellular organelle  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0043633  P:polyadenylation-dependent RNA catabolic process  
KEGG kaf:KAFR_0B01220  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSSSLSEVEAMDTLPFVTDVSLEKPKIVAPSIEEVDEDPDTLRSLRGQGRYFGADGDDNDNVIKEALPKCNNCSQRGHLKKNCPHVICTYCGLMDDHYSQHCPKAIKCANCNENGHYRSQCPHKWKRTYCALCNSKKHSRERCPSIWRVYLLKDDANEKISLPLESVFCYNCGSKGHFGDDCDLRRSSRVPNEDGSAFSGDNLASSLKSQYFENLDRLSHKRNHESSIYDSYNNNDNGFFSYDDYEYDESLYDDINRNNNNTTSKKRRRHDNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNSNNNNSSRKKKTVQPHQRGKTLKPSRDKHPLDFPRNPQAISQSMNGSRYGSAYNNRNNGQYQQQPSNYENYNSFKPFRSGVLRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.07
3 0.06
4 0.06
5 0.07
6 0.09
7 0.14
8 0.21
9 0.21
10 0.21
11 0.22
12 0.24
13 0.26
14 0.26
15 0.23
16 0.2
17 0.27
18 0.28
19 0.27
20 0.25
21 0.22
22 0.24
23 0.22
24 0.19
25 0.13
26 0.12
27 0.13
28 0.13
29 0.13
30 0.11
31 0.17
32 0.23
33 0.29
34 0.31
35 0.33
36 0.36
37 0.38
38 0.36
39 0.31
40 0.27
41 0.22
42 0.21
43 0.22
44 0.19
45 0.16
46 0.16
47 0.16
48 0.14
49 0.12
50 0.11
51 0.13
52 0.17
53 0.25
54 0.31
55 0.32
56 0.37
57 0.45
58 0.5
59 0.48
60 0.5
61 0.48
62 0.53
63 0.61
64 0.67
65 0.66
66 0.72
67 0.75
68 0.79
69 0.81
70 0.72
71 0.65
72 0.63
73 0.58
74 0.5
75 0.46
76 0.36
77 0.27
78 0.26
79 0.24
80 0.17
81 0.16
82 0.15
83 0.15
84 0.15
85 0.19
86 0.18
87 0.2
88 0.23
89 0.22
90 0.21
91 0.3
92 0.35
93 0.38
94 0.43
95 0.5
96 0.51
97 0.55
98 0.56
99 0.49
100 0.52
101 0.47
102 0.47
103 0.39
104 0.37
105 0.36
106 0.41
107 0.43
108 0.44
109 0.53
110 0.58
111 0.66
112 0.69
113 0.71
114 0.74
115 0.76
116 0.72
117 0.73
118 0.71
119 0.69
120 0.71
121 0.71
122 0.69
123 0.69
124 0.72
125 0.72
126 0.73
127 0.75
128 0.76
129 0.76
130 0.75
131 0.74
132 0.7
133 0.63
134 0.55
135 0.48
136 0.41
137 0.37
138 0.31
139 0.26
140 0.22
141 0.2
142 0.2
143 0.19
144 0.17
145 0.14
146 0.14
147 0.14
148 0.13
149 0.11
150 0.11
151 0.1
152 0.1
153 0.11
154 0.09
155 0.09
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.11
160 0.12
161 0.14
162 0.15
163 0.17
164 0.17
165 0.18
166 0.2
167 0.22
168 0.22
169 0.22
170 0.21
171 0.19
172 0.19
173 0.2
174 0.21
175 0.24
176 0.26
177 0.25
178 0.26
179 0.28
180 0.27
181 0.26
182 0.22
183 0.17
184 0.14
185 0.11
186 0.11
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.07
194 0.07
195 0.08
196 0.08
197 0.1
198 0.14
199 0.16
200 0.19
201 0.18
202 0.18
203 0.22
204 0.25
205 0.29
206 0.31
207 0.33
208 0.38
209 0.39
210 0.42
211 0.4
212 0.4
213 0.39
214 0.4
215 0.38
216 0.32
217 0.3
218 0.28
219 0.32
220 0.29
221 0.25
222 0.17
223 0.16
224 0.17
225 0.18
226 0.16
227 0.11
228 0.13
229 0.12
230 0.13
231 0.15
232 0.14
233 0.12
234 0.12
235 0.11
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.08
240 0.1
241 0.13
242 0.18
243 0.19
244 0.2
245 0.22
246 0.25
247 0.29
248 0.32
249 0.39
250 0.45
251 0.54
252 0.62
253 0.67
254 0.75
255 0.8
256 0.86
257 0.88
258 0.88
259 0.89
260 0.91
261 0.93
262 0.85
263 0.78
264 0.71
265 0.65
266 0.6
267 0.54
268 0.49
269 0.46
270 0.48
271 0.5
272 0.51
273 0.51
274 0.5
275 0.49
276 0.48
277 0.46
278 0.45
279 0.43
280 0.43
281 0.43
282 0.44
283 0.49
284 0.5
285 0.55
286 0.58
287 0.62
288 0.61
289 0.64
290 0.68
291 0.71
292 0.76
293 0.78
294 0.81
295 0.81
296 0.84
297 0.8
298 0.75
299 0.74
300 0.73
301 0.7
302 0.7
303 0.68
304 0.68
305 0.75
306 0.75
307 0.69
308 0.71
309 0.73
310 0.72
311 0.75
312 0.72
313 0.72
314 0.69
315 0.64
316 0.55
317 0.5
318 0.44
319 0.39
320 0.35
321 0.31
322 0.31
323 0.32
324 0.31
325 0.27
326 0.24
327 0.23
328 0.23
329 0.21
330 0.26
331 0.33
332 0.4
333 0.45
334 0.47
335 0.49
336 0.49
337 0.48
338 0.49
339 0.49
340 0.49
341 0.5
342 0.53
343 0.54
344 0.53
345 0.56
346 0.5
347 0.45
348 0.44
349 0.41
350 0.43
351 0.44
352 0.45
353 0.42
354 0.42
355 0.41
356 0.41