Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QYD6

Protein Details
Accession C4QYD6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
193-212EQCFLQRSRRKPNCIICGRDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-12RVVKGKKR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039971  CWC24-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005684  C:U2-type spliceosomal complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000349  P:generation of catalytic spliceosome for first transesterification step  
GO:0034247  P:snoRNA splicing  
KEGG ppa:PAS_chr1-4_0411  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13920  zf-C3HC4_3  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16539  RING-HC_RNF113A_B  
Amino Acid Sequences MFKKRVVKGKKRHIGEGELASIQDNEGSIAVVKVHKKRAPVEADDKAPITLPQRNTVTEIGGDAPREEHSVNNFAKFITPSANKPMSKSATNINSTTTIDFQPDVCKDYKQTGYCGYGDTCKFLHLRDDFKQGWKLDREWENVQKKKHNTLKGVKEIQMFNEDELKDIPFKCIICKGDYKSPVKTSCNHYFCEQCFLQRSRRKPNCIICGRDTLGVALPAKKLSQFLAKIHNNESNKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.68
3 0.61
4 0.53
5 0.44
6 0.39
7 0.32
8 0.26
9 0.2
10 0.14
11 0.1
12 0.07
13 0.06
14 0.07
15 0.06
16 0.06
17 0.08
18 0.12
19 0.18
20 0.23
21 0.32
22 0.34
23 0.38
24 0.42
25 0.5
26 0.52
27 0.53
28 0.55
29 0.52
30 0.53
31 0.5
32 0.46
33 0.38
34 0.32
35 0.27
36 0.23
37 0.23
38 0.22
39 0.27
40 0.29
41 0.3
42 0.32
43 0.31
44 0.28
45 0.22
46 0.21
47 0.16
48 0.15
49 0.14
50 0.11
51 0.11
52 0.11
53 0.13
54 0.12
55 0.12
56 0.14
57 0.21
58 0.21
59 0.22
60 0.21
61 0.19
62 0.21
63 0.19
64 0.17
65 0.17
66 0.18
67 0.19
68 0.26
69 0.33
70 0.31
71 0.32
72 0.38
73 0.35
74 0.34
75 0.33
76 0.32
77 0.32
78 0.34
79 0.33
80 0.28
81 0.26
82 0.26
83 0.25
84 0.2
85 0.14
86 0.13
87 0.13
88 0.11
89 0.13
90 0.13
91 0.15
92 0.14
93 0.14
94 0.15
95 0.19
96 0.24
97 0.21
98 0.22
99 0.22
100 0.24
101 0.24
102 0.24
103 0.19
104 0.18
105 0.17
106 0.17
107 0.14
108 0.14
109 0.14
110 0.13
111 0.18
112 0.16
113 0.21
114 0.22
115 0.29
116 0.28
117 0.31
118 0.36
119 0.31
120 0.33
121 0.31
122 0.29
123 0.29
124 0.33
125 0.35
126 0.34
127 0.43
128 0.48
129 0.5
130 0.53
131 0.54
132 0.53
133 0.58
134 0.61
135 0.59
136 0.58
137 0.62
138 0.66
139 0.67
140 0.68
141 0.61
142 0.58
143 0.51
144 0.45
145 0.4
146 0.32
147 0.24
148 0.25
149 0.22
150 0.19
151 0.19
152 0.18
153 0.17
154 0.17
155 0.17
156 0.15
157 0.15
158 0.16
159 0.22
160 0.22
161 0.23
162 0.29
163 0.32
164 0.38
165 0.45
166 0.47
167 0.47
168 0.52
169 0.54
170 0.51
171 0.51
172 0.51
173 0.54
174 0.53
175 0.5
176 0.46
177 0.46
178 0.45
179 0.47
180 0.39
181 0.33
182 0.38
183 0.39
184 0.46
185 0.48
186 0.55
187 0.59
188 0.67
189 0.71
190 0.73
191 0.79
192 0.79
193 0.8
194 0.78
195 0.71
196 0.69
197 0.63
198 0.56
199 0.46
200 0.37
201 0.3
202 0.27
203 0.25
204 0.2
205 0.19
206 0.19
207 0.19
208 0.19
209 0.19
210 0.18
211 0.25
212 0.27
213 0.3
214 0.39
215 0.44
216 0.47
217 0.51
218 0.56