Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E5RFF5

Protein Details
Accession A0A1E5RFF5    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
382-401SFNKCVKQIKLQKAQHKMNSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 13.833, cyto 7.5, cyto_mito 5.332
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019680  Mediator_Med1  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF10744  Med1  
Amino Acid Sequences MSSKDDFKNQLSEMIDLLQVYRPGKISKENVECLCQILGLETFIDNLSANAGTRLSIASKIIVIDIDFDNSSERSVKDAKLVLASNFDNFNYYNAENKTNILFNSLKSSQYSDLSIFTKNLKFLRLLDAYSNTSLDXDSDNNSGNGELMGKTQSGGTSPQNSLHTGRYSVSGGNTNGRISNSMNNSPADRSPFSKMRGNKQSSSFDLFRYYTNLEDYLSAFLSDFEPYLKITSNVNDIFGIYFMNKRTETVIMKLCIKEKTPSDNTPGVLQEFQYQNNKWICENPNKMIESLYLALEIIDPDLLFMEHLISSDLVLDPLPCSTYPAPTTSIDNVATSGSSTIQMTFTSTFHHYHTFNVSNENLEYLKDISKWALWFQNVLAPSFNKCVKQIKLQKAQHKMNXSGLHRLSGENRRPSLSIMKEEGIGELNMHELVKKNTPDEDVFMDDELPVAESLPYTACSDSLKLQSTQTNEKQGGKNSKEMIILSEDYVYDEYKGSVTFYDDDFSRWSEFSEESINL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.24
3 0.18
4 0.18
5 0.16
6 0.18
7 0.17
8 0.19
9 0.2
10 0.21
11 0.25
12 0.32
13 0.35
14 0.41
15 0.48
16 0.53
17 0.53
18 0.55
19 0.52
20 0.46
21 0.4
22 0.3
23 0.22
24 0.17
25 0.15
26 0.11
27 0.11
28 0.09
29 0.1
30 0.09
31 0.1
32 0.08
33 0.07
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.09
38 0.09
39 0.08
40 0.09
41 0.1
42 0.1
43 0.11
44 0.12
45 0.11
46 0.12
47 0.12
48 0.12
49 0.11
50 0.1
51 0.11
52 0.11
53 0.13
54 0.12
55 0.12
56 0.13
57 0.13
58 0.15
59 0.14
60 0.14
61 0.16
62 0.2
63 0.21
64 0.24
65 0.27
66 0.27
67 0.29
68 0.3
69 0.27
70 0.28
71 0.27
72 0.24
73 0.22
74 0.21
75 0.18
76 0.17
77 0.17
78 0.17
79 0.17
80 0.21
81 0.23
82 0.26
83 0.24
84 0.26
85 0.27
86 0.24
87 0.24
88 0.23
89 0.21
90 0.19
91 0.26
92 0.26
93 0.25
94 0.24
95 0.27
96 0.24
97 0.25
98 0.26
99 0.19
100 0.21
101 0.21
102 0.22
103 0.2
104 0.22
105 0.22
106 0.24
107 0.25
108 0.23
109 0.23
110 0.23
111 0.29
112 0.27
113 0.26
114 0.25
115 0.27
116 0.27
117 0.27
118 0.25
119 0.18
120 0.16
121 0.15
122 0.13
123 0.11
124 0.12
125 0.14
126 0.15
127 0.15
128 0.15
129 0.15
130 0.14
131 0.12
132 0.1
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.11
142 0.14
143 0.17
144 0.18
145 0.22
146 0.23
147 0.25
148 0.26
149 0.26
150 0.25
151 0.21
152 0.21
153 0.19
154 0.19
155 0.18
156 0.17
157 0.18
158 0.17
159 0.19
160 0.2
161 0.18
162 0.18
163 0.18
164 0.18
165 0.15
166 0.2
167 0.21
168 0.23
169 0.25
170 0.24
171 0.25
172 0.25
173 0.25
174 0.24
175 0.21
176 0.21
177 0.25
178 0.29
179 0.31
180 0.36
181 0.38
182 0.44
183 0.52
184 0.55
185 0.53
186 0.54
187 0.55
188 0.51
189 0.54
190 0.45
191 0.36
192 0.34
193 0.3
194 0.25
195 0.24
196 0.22
197 0.16
198 0.16
199 0.16
200 0.12
201 0.12
202 0.12
203 0.1
204 0.09
205 0.09
206 0.07
207 0.07
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.09
219 0.14
220 0.14
221 0.14
222 0.13
223 0.13
224 0.12
225 0.11
226 0.1
227 0.06
228 0.07
229 0.08
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.13
234 0.16
235 0.16
236 0.18
237 0.21
238 0.2
239 0.22
240 0.23
241 0.24
242 0.22
243 0.22
244 0.22
245 0.2
246 0.26
247 0.29
248 0.3
249 0.33
250 0.34
251 0.33
252 0.31
253 0.29
254 0.23
255 0.18
256 0.16
257 0.15
258 0.14
259 0.16
260 0.19
261 0.19
262 0.24
263 0.26
264 0.27
265 0.23
266 0.27
267 0.3
268 0.34
269 0.38
270 0.35
271 0.38
272 0.38
273 0.37
274 0.32
275 0.28
276 0.21
277 0.18
278 0.15
279 0.09
280 0.08
281 0.08
282 0.07
283 0.07
284 0.05
285 0.04
286 0.03
287 0.03
288 0.04
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.06
306 0.05
307 0.09
308 0.1
309 0.13
310 0.14
311 0.16
312 0.18
313 0.18
314 0.21
315 0.19
316 0.21
317 0.18
318 0.17
319 0.16
320 0.13
321 0.12
322 0.09
323 0.08
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.09
331 0.1
332 0.1
333 0.12
334 0.15
335 0.15
336 0.17
337 0.21
338 0.19
339 0.2
340 0.26
341 0.27
342 0.25
343 0.27
344 0.26
345 0.24
346 0.23
347 0.23
348 0.17
349 0.13
350 0.14
351 0.11
352 0.13
353 0.11
354 0.12
355 0.11
356 0.14
357 0.15
358 0.16
359 0.19
360 0.18
361 0.18
362 0.18
363 0.21
364 0.19
365 0.19
366 0.18
367 0.14
368 0.17
369 0.21
370 0.23
371 0.2
372 0.23
373 0.3
374 0.31
375 0.41
376 0.48
377 0.54
378 0.62
379 0.68
380 0.73
381 0.76
382 0.8
383 0.76
384 0.71
385 0.66
386 0.63
387 0.63
388 0.6
389 0.51
390 0.44
391 0.4
392 0.36
393 0.38
394 0.4
395 0.4
396 0.42
397 0.43
398 0.44
399 0.43
400 0.45
401 0.46
402 0.41
403 0.38
404 0.35
405 0.34
406 0.33
407 0.32
408 0.3
409 0.23
410 0.18
411 0.13
412 0.1
413 0.1
414 0.09
415 0.09
416 0.09
417 0.1
418 0.14
419 0.2
420 0.22
421 0.23
422 0.25
423 0.29
424 0.3
425 0.3
426 0.3
427 0.26
428 0.25
429 0.24
430 0.21
431 0.17
432 0.16
433 0.13
434 0.1
435 0.07
436 0.07
437 0.06
438 0.06
439 0.07
440 0.08
441 0.09
442 0.1
443 0.1
444 0.1
445 0.12
446 0.14
447 0.18
448 0.23
449 0.25
450 0.24
451 0.28
452 0.31
453 0.35
454 0.43
455 0.44
456 0.47
457 0.47
458 0.53
459 0.55
460 0.6
461 0.65
462 0.59
463 0.61
464 0.55
465 0.55
466 0.5
467 0.45
468 0.39
469 0.33
470 0.31
471 0.24
472 0.23
473 0.19
474 0.18
475 0.19
476 0.17
477 0.13
478 0.12
479 0.12
480 0.12
481 0.12
482 0.11
483 0.11
484 0.14
485 0.15
486 0.15
487 0.18
488 0.17
489 0.19
490 0.2
491 0.22
492 0.21
493 0.19
494 0.2
495 0.19
496 0.2
497 0.2