Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2B1J7

Protein Details
Accession H2B1J7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-100FAGISKSSIRRRKRKMRDNLKPRMDDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
82-92SIRRRKRKMRD
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028160  Slx9-like  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG kaf:KAFR_0K01430  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF15341  SLX9  
Amino Acid Sequences MVAKKRNTLRNKVSSKINSHSILENLQNDIDVQLPEDPKAFLHQPKETKREKQLNKQSAFISRVQEKSMGMDPSFAGISKSSIRRRKRKMRDNLKPRMDDLLVSLEREDDLRDITQNTGEHADDEETRKRNRANVTKVVSRNEPGSVLTRRNEPSIRNKKGAKTLQIKETERFNQVLKNQLFQTNTFGALREVIKMQKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.72
3 0.67
4 0.64
5 0.56
6 0.52
7 0.5
8 0.42
9 0.38
10 0.36
11 0.32
12 0.26
13 0.23
14 0.21
15 0.18
16 0.17
17 0.15
18 0.1
19 0.1
20 0.12
21 0.13
22 0.13
23 0.14
24 0.14
25 0.12
26 0.17
27 0.2
28 0.21
29 0.26
30 0.33
31 0.41
32 0.48
33 0.56
34 0.58
35 0.61
36 0.67
37 0.71
38 0.73
39 0.75
40 0.78
41 0.79
42 0.75
43 0.71
44 0.63
45 0.58
46 0.53
47 0.45
48 0.39
49 0.35
50 0.34
51 0.31
52 0.3
53 0.24
54 0.24
55 0.25
56 0.22
57 0.17
58 0.17
59 0.15
60 0.15
61 0.15
62 0.12
63 0.08
64 0.07
65 0.08
66 0.12
67 0.18
68 0.25
69 0.34
70 0.43
71 0.53
72 0.62
73 0.72
74 0.79
75 0.82
76 0.85
77 0.88
78 0.9
79 0.9
80 0.9
81 0.86
82 0.76
83 0.67
84 0.59
85 0.48
86 0.37
87 0.28
88 0.24
89 0.17
90 0.16
91 0.15
92 0.11
93 0.11
94 0.11
95 0.1
96 0.05
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.08
101 0.08
102 0.11
103 0.1
104 0.11
105 0.12
106 0.11
107 0.11
108 0.11
109 0.12
110 0.11
111 0.14
112 0.19
113 0.21
114 0.23
115 0.26
116 0.26
117 0.31
118 0.38
119 0.44
120 0.46
121 0.51
122 0.55
123 0.6
124 0.62
125 0.6
126 0.53
127 0.46
128 0.39
129 0.32
130 0.27
131 0.2
132 0.23
133 0.23
134 0.24
135 0.24
136 0.29
137 0.3
138 0.34
139 0.35
140 0.35
141 0.42
142 0.49
143 0.54
144 0.55
145 0.58
146 0.59
147 0.66
148 0.68
149 0.66
150 0.65
151 0.64
152 0.65
153 0.69
154 0.66
155 0.6
156 0.6
157 0.55
158 0.49
159 0.46
160 0.39
161 0.37
162 0.37
163 0.44
164 0.37
165 0.38
166 0.37
167 0.4
168 0.41
169 0.35
170 0.38
171 0.3
172 0.31
173 0.27
174 0.25
175 0.21
176 0.22
177 0.21
178 0.18
179 0.19