FuNGI

A0A1E5RDY9

Protein Details

Accession

A0A1E5RDY9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
108-137	ELHLNKLNRTRKFKRIRKRQQLRNLIRNVD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
116-126	RTRKFKRIRKR

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 10.5, mito 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000690 Matrin/U1-C_Znf_C2H2 IPR003604 Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2 IPR013085 U1-CZ_Znf_C2H2 IPR017340 U1_snRNP-C IPR036236 Znf_C2H2_sf
Gene Ontology	GO:0005685 C:U1 snRNP GO:0003723 F:RNA binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
Pfam	View protein in Pfam PF06220 zf-U1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50171 ZF_MATRIN

Amino Acid Sequences

MARFYCDYCRSYLTHDKRSVLKAHITGKHHIRLVKDYYRNKYVEQWKRTGILNKRKVIRDHTNRNLALAKPKNNTRLNVDKNSSTFPKRLELQDIAPNYKFEKLSKDELHLNKLNRTRKFKRIRKRQQLRNLIRNVDPFNHESILRERRLRNFGDLSNVNGIENGLSILNHLYKYSPGYNKVFISTNRFDNAEYSGLKPLTSSVAKASNIYGKGKGNKNKTFKGKANTSSKASKDSKQSSVSMKQLQMTSRNTIFHDDVNTLGFMKNSNKDRKKYTMNFLKPPKVVVNKRLNLNTDSNSVNKAITGTAPGREFLFKQNNLFYKVFLRSILPKRKFLQIFHGKRSNVGNKKNNKGLELRRSRFQNKSVAADNNKNLTPSRFSNGRPTALNLHSTASGTGPAKPPSRFNQSSTGTSRFAPSTQRTTTYASTSNNSRYNPQPPHTTTQRFARSGPTRGAFRNGAKSXNPKSYRKY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.57
3	0.59
4	0.62
5	0.66
6	0.64
7	0.58
8	0.56
9	0.53
10	0.56
11	0.59
12	0.57
13	0.59
14	0.61
15	0.62
16	0.59
17	0.55
18	0.5
19	0.5
20	0.54
21	0.56
22	0.58
23	0.6
24	0.64
25	0.68
26	0.67
27	0.61
28	0.63
29	0.64
30	0.65
31	0.63
32	0.61
33	0.57
34	0.58
35	0.62
36	0.61
37	0.61
38	0.61
39	0.64
40	0.65
41	0.69
42	0.73
43	0.72
44	0.72
45	0.73
46	0.73
47	0.74
48	0.76
49	0.78
50	0.71
51	0.69
52	0.64
53	0.56
54	0.55
55	0.52
56	0.51
57	0.48
58	0.55
59	0.61
60	0.62
61	0.63
62	0.6
63	0.63
64	0.64
65	0.65
66	0.62
67	0.57
68	0.54
69	0.56
70	0.54
71	0.48
72	0.43
73	0.37
74	0.39
75	0.39
76	0.4
77	0.41
78	0.38
79	0.38
80	0.41
81	0.42
82	0.41
83	0.37
84	0.35
85	0.3
86	0.32
87	0.29
88	0.24
89	0.28
90	0.28
91	0.36
92	0.38
93	0.4
94	0.44
95	0.46
96	0.52
97	0.51
98	0.48
99	0.47
100	0.52
101	0.56
102	0.56
103	0.62
104	0.62
105	0.66
106	0.75
107	0.77
108	0.8
109	0.84
110	0.87
111	0.89
112	0.93
113	0.92
114	0.92
115	0.94
116	0.92
117	0.9
118	0.85
119	0.78
120	0.7
121	0.64
122	0.56
123	0.48
124	0.42
125	0.34
126	0.31
127	0.28
128	0.25
129	0.23
130	0.27
131	0.31
132	0.31
133	0.35
134	0.36
135	0.42
136	0.47
137	0.47
138	0.45
139	0.42
140	0.39
141	0.4
142	0.37
143	0.33
144	0.3
145	0.28
146	0.23
147	0.19
148	0.18
149	0.11
150	0.1
151	0.08
152	0.04
153	0.04
154	0.05
155	0.06
156	0.07
157	0.07
158	0.07
159	0.07
160	0.08
161	0.12
162	0.17
163	0.19
164	0.23
165	0.26
166	0.29
167	0.29
168	0.3
169	0.3
170	0.26
171	0.31
172	0.29
173	0.28
174	0.27
175	0.27
176	0.25
177	0.22
178	0.23
179	0.18
180	0.16
181	0.15
182	0.17
183	0.16
184	0.16
185	0.15
186	0.13
187	0.14
188	0.13
189	0.12
190	0.11
191	0.15
192	0.16
193	0.16
194	0.17
195	0.17
196	0.19
197	0.2
198	0.2
199	0.2
200	0.26
201	0.33
202	0.39
203	0.44
204	0.5
205	0.55
206	0.59
207	0.63
208	0.64
209	0.62
210	0.62
211	0.6
212	0.6
213	0.61
214	0.57
215	0.54
216	0.51
217	0.47
218	0.48
219	0.44
220	0.41
221	0.41
222	0.42
223	0.43
224	0.4
225	0.42
226	0.39
227	0.41
228	0.41
229	0.36
230	0.33
231	0.31
232	0.3
233	0.29
234	0.3
235	0.28
236	0.27
237	0.25
238	0.25
239	0.24
240	0.25
241	0.24
242	0.2
243	0.19
244	0.15
245	0.14
246	0.13
247	0.12
248	0.1
249	0.09
250	0.08
251	0.08
252	0.11
253	0.16
254	0.23
255	0.33
256	0.39
257	0.42
258	0.48
259	0.53
260	0.6
261	0.59
262	0.62
263	0.63
264	0.63
265	0.68
266	0.69
267	0.69
268	0.59
269	0.56
270	0.52
271	0.51
272	0.49
273	0.5
274	0.54
275	0.51
276	0.55
277	0.56
278	0.53
279	0.47
280	0.46
281	0.39
282	0.31
283	0.28
284	0.25
285	0.23
286	0.21
287	0.17
288	0.13
289	0.12
290	0.09
291	0.08
292	0.11
293	0.11
294	0.13
295	0.13
296	0.14
297	0.14
298	0.15
299	0.16
300	0.2
301	0.27
302	0.26
303	0.28
304	0.34
305	0.36
306	0.41
307	0.4
308	0.33
309	0.3
310	0.31
311	0.29
312	0.24
313	0.23
314	0.26
315	0.36
316	0.45
317	0.44
318	0.47
319	0.49
320	0.57
321	0.58
322	0.51
323	0.53
324	0.53
325	0.56
326	0.58
327	0.63
328	0.54
329	0.54
330	0.6
331	0.59
332	0.57
333	0.6
334	0.61
335	0.63
336	0.7
337	0.74
338	0.67
339	0.61
340	0.6
341	0.59
342	0.61
343	0.63
344	0.59
345	0.59
346	0.65
347	0.68
348	0.66
349	0.62
350	0.6
351	0.53
352	0.54
353	0.53
354	0.53
355	0.53
356	0.54
357	0.53
358	0.48
359	0.45
360	0.42
361	0.38
362	0.33
363	0.32
364	0.28
365	0.31
366	0.31
367	0.33
368	0.42
369	0.45
370	0.45
371	0.41
372	0.42
373	0.43
374	0.4
375	0.41
376	0.31
377	0.28
378	0.26
379	0.25
380	0.22
381	0.15
382	0.17
383	0.15
384	0.18
385	0.21
386	0.26
387	0.31
388	0.32
389	0.38
390	0.4
391	0.49
392	0.49
393	0.48
394	0.52
395	0.51
396	0.56
397	0.56
398	0.53
399	0.45
400	0.42
401	0.42
402	0.34
403	0.31
404	0.33
405	0.33
406	0.36
407	0.37
408	0.4
409	0.4
410	0.43
411	0.44
412	0.41
413	0.41
414	0.37
415	0.38
416	0.4
417	0.45
418	0.45
419	0.44
420	0.44
421	0.45
422	0.52
423	0.56
424	0.55
425	0.57
426	0.57
427	0.64
428	0.68
429	0.69
430	0.64
431	0.66
432	0.7
433	0.62
434	0.58
435	0.6
436	0.57
437	0.56
438	0.58
439	0.54
440	0.5
441	0.51
442	0.56
443	0.52
444	0.51
445	0.56
446	0.51
447	0.54
448	0.58
449	0.61
450	0.65
451	0.69

A0A1E5RDY9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer