FuNGI

A0A1E5RB41

Protein Details

Accession

A0A1E5RB41

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
79-109	EEEKLKAARHNEKNRYSKKLTNNGKRVPRYL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
45-70	APKAKPGLKFKPKVVVRKSKAEREAE
81-94	EKLKAARHNEKNRY

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, mito_nucl 12.166, cyto_nucl 11.333, mito 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MVGRLASLSSSGNGSSGGAKKPTGTGNDQNNNNGSLGQANGKDSAPKAKPGLKFKPKVVVRKSKAEREAEQLKNQQKLEEEKLKAARHNEKNRYSKKLTNNGKRVPRYLQNTTVVSSGPLAAGNFVSGGSGGPKGVSFGSSFSSGSTSGGSVISELMGNSKLTASILESKDGDDDDDSDSDTESRFKGKKHGTKEEGADEDAPIKSSNKRDGIIRINMSKEFKIHEILSDDENDDEDDDESGNEXNDLSITEEGKIKQELGKDGDGDVEMKNGEENDEGKDXGKKQDLSYLFPVRPIRVKHEDVELAKQELQDSYSLPNTREPTPGMVKQEDAEDXNQXGLRGVENQERALLRKRQLDLEQKVKAMHLDKDFHSVDEAESLEEKKMIVKDYLYLKRKLNKIHNQDRQFFALQLPPQLPFDNADEQNALQGQPNIQGNIGQLRVHKSGRITIKIGKVVMDVAKGSETSFIQDVVAVDTAEDENTVEHLGQIAGKMVVTPRF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.16
3	0.19
4	0.22
5	0.23
6	0.24
7	0.24
8	0.28
9	0.33
10	0.33
11	0.36
12	0.4
13	0.49
14	0.57
15	0.58
16	0.59
17	0.56
18	0.52
19	0.44
20	0.36
21	0.26
22	0.19
23	0.18
24	0.17
25	0.17
26	0.17
27	0.19
28	0.19
29	0.22
30	0.22
31	0.3
32	0.28
33	0.31
34	0.35
35	0.4
36	0.47
37	0.54
38	0.64
39	0.65
40	0.68
41	0.67
42	0.72
43	0.72
44	0.75
45	0.75
46	0.75
47	0.7
48	0.75
49	0.78
50	0.78
51	0.78
52	0.74
53	0.67
54	0.65
55	0.69
56	0.63
57	0.64
58	0.63
59	0.61
60	0.61
61	0.59
62	0.53
63	0.47
64	0.49
65	0.5
66	0.5
67	0.46
68	0.47
69	0.53
70	0.54
71	0.54
72	0.55
73	0.57
74	0.58
75	0.67
76	0.69
77	0.72
78	0.79
79	0.82
80	0.82
81	0.78
82	0.76
83	0.76
84	0.76
85	0.77
86	0.78
87	0.81
88	0.8
89	0.84
90	0.8
91	0.75
92	0.71
93	0.68
94	0.65
95	0.62
96	0.6
97	0.56
98	0.52
99	0.49
100	0.43
101	0.35
102	0.27
103	0.21
104	0.15
105	0.1
106	0.09
107	0.08
108	0.07
109	0.07
110	0.07
111	0.06
112	0.05
113	0.05
114	0.04
115	0.05
116	0.05
117	0.06
118	0.06
119	0.06
120	0.06
121	0.07
122	0.07
123	0.08
124	0.07
125	0.08
126	0.1
127	0.11
128	0.11
129	0.1
130	0.12
131	0.11
132	0.11
133	0.11
134	0.09
135	0.08
136	0.08
137	0.08
138	0.06
139	0.06
140	0.06
141	0.05
142	0.05
143	0.06
144	0.07
145	0.07
146	0.07
147	0.07
148	0.07
149	0.06
150	0.07
151	0.08
152	0.14
153	0.15
154	0.17
155	0.17
156	0.17
157	0.18
158	0.18
159	0.16
160	0.09
161	0.09
162	0.09
163	0.09
164	0.09
165	0.09
166	0.09
167	0.09
168	0.09
169	0.09
170	0.08
171	0.13
172	0.15
173	0.16
174	0.25
175	0.34
176	0.4
177	0.48
178	0.57
179	0.56
180	0.58
181	0.6
182	0.55
183	0.48
184	0.42
185	0.34
186	0.24
187	0.21
188	0.17
189	0.14
190	0.11
191	0.11
192	0.13
193	0.17
194	0.23
195	0.23
196	0.24
197	0.26
198	0.31
199	0.36
200	0.37
201	0.36
202	0.33
203	0.32
204	0.34
205	0.33
206	0.28
207	0.23
208	0.19
209	0.17
210	0.18
211	0.16
212	0.15
213	0.15
214	0.16
215	0.16
216	0.15
217	0.14
218	0.11
219	0.11
220	0.1
221	0.08
222	0.07
223	0.06
224	0.05
225	0.05
226	0.05
227	0.06
228	0.06
229	0.06
230	0.05
231	0.05
232	0.04
233	0.04
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.07
238	0.09
239	0.09
240	0.11
241	0.11
242	0.09
243	0.11
244	0.13
245	0.15
246	0.16
247	0.16
248	0.15
249	0.15
250	0.15
251	0.13
252	0.12
253	0.1
254	0.07
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.05
259	0.06
260	0.06
261	0.07
262	0.08
263	0.1
264	0.1
265	0.11
266	0.14
267	0.15
268	0.17
269	0.19
270	0.17
271	0.2
272	0.23
273	0.26
274	0.28
275	0.32
276	0.3
277	0.31
278	0.32
279	0.29
280	0.31
281	0.29
282	0.31
283	0.33
284	0.35
285	0.32
286	0.35
287	0.38
288	0.34
289	0.37
290	0.31
291	0.26
292	0.25
293	0.24
294	0.2
295	0.16
296	0.15
297	0.11
298	0.1
299	0.11
300	0.14
301	0.15
302	0.16
303	0.2
304	0.22
305	0.24
306	0.25
307	0.24
308	0.24
309	0.28
310	0.31
311	0.3
312	0.28
313	0.27
314	0.25
315	0.27
316	0.24
317	0.2
318	0.19
319	0.16
320	0.15
321	0.15
322	0.16
323	0.13
324	0.11
325	0.13
326	0.14
327	0.16
328	0.18
329	0.19
330	0.2
331	0.21
332	0.23
333	0.28
334	0.3
335	0.32
336	0.37
337	0.38
338	0.4
339	0.47
340	0.54
341	0.53
342	0.56
343	0.53
344	0.48
345	0.47
346	0.42
347	0.39
348	0.32
349	0.31
350	0.28
351	0.29
352	0.28
353	0.35
354	0.34
355	0.31
356	0.29
357	0.24
358	0.19
359	0.17
360	0.16
361	0.11
362	0.12
363	0.12
364	0.11
365	0.11
366	0.11
367	0.12
368	0.14
369	0.15
370	0.15
371	0.15
372	0.19
373	0.29
374	0.38
375	0.4
376	0.42
377	0.46
378	0.52
379	0.57
380	0.61
381	0.63
382	0.64
383	0.69
384	0.76
385	0.8
386	0.8
387	0.8
388	0.74
389	0.68
390	0.6
391	0.5
392	0.41
393	0.37
394	0.31
395	0.3
396	0.27
397	0.24
398	0.24
399	0.24
400	0.23
401	0.19
402	0.22
403	0.25
404	0.25
405	0.25
406	0.24
407	0.23
408	0.25
409	0.24
410	0.2
411	0.15
412	0.16
413	0.15
414	0.19
415	0.21
416	0.19
417	0.19
418	0.19
419	0.19
420	0.22
421	0.22
422	0.19
423	0.19
424	0.24
425	0.29
426	0.29
427	0.3
428	0.28
429	0.35
430	0.4
431	0.43
432	0.41
433	0.43
434	0.48
435	0.5
436	0.48
437	0.41
438	0.34
439	0.33
440	0.3
441	0.25
442	0.19
443	0.16
444	0.16
445	0.15
446	0.15
447	0.15
448	0.13
449	0.14
450	0.15
451	0.14
452	0.13
453	0.14
454	0.15
455	0.14
456	0.15
457	0.11
458	0.1
459	0.11
460	0.12
461	0.1
462	0.1
463	0.07
464	0.07
465	0.08
466	0.09
467	0.07
468	0.07
469	0.08
470	0.08
471	0.09
472	0.09
473	0.1
474	0.1
475	0.09
476	0.11

A0A1E5RB41

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer