FuNGI

A0A1E5RGS5

Protein Details

Accession

A0A1E5RGS5

Localization Confidence

High

Confidence Score

26.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
13-49	STSPAAVKKKRKAASPFIKRDHFRRQFLKSKMKNGVN	Hydrophilic
285-304	ARAKRGWAGKRKTRKLRLLD	Basic
576-612	EGTPKNKSPSKQRSGPKKVKKIKTSCKKYKNGVVLIK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
19-46	AVKKKRKAASPFIKRDHFRRQFLKSKMK
286-302	ARAKRGWAGKRKTRKLR
580-599	PKNKSPSKQRSGPKKVKKIK

Subcellular Location(s)

nucl 24, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MASSQSPPVXRPGSTSPAAVKKKRKAASPFIKRDHFRRQFLKSKMKNGVNGGVKKEEDPDAKANSLLKVKMDPYVKDEYDAIKKTERKDFPLQDANGNQEDEYDEYPLRAVDADAIMGIKNNIMKFQSKKPMIPEKNLHLPVRLHRKDTRNLQFQLTRAEIVQRQKEIAEYKKTMVEKESGKGGNKNEKTGNGKNEKGEDIFTTASGASITMSKPEASNAKNQTNAAATTGSSDAAQSNGDQPNAEEPVRKQEAGKVLYDGQETFEGEFEEGTIDPFADVAPDGGARAKRGWAGKRKTRKLRLLDENAKKLRFEEYYPWVLEDFDGYNTWVGSYEAGNSDQYVMFAVQKDGSFTMLPADKVYRFTARSQYATLTIEEAEKRFEKNKNVVPRWLMKHLDDIGTTTTRFDRTMRKLKAVDGMKKDGEDDDDDMDGLFGSRKDNSDNELDYDEEFQDDEEAPIIDGNEEENKESEQRLKKEMLQANAMGLRDAGSFPEDEEEEEDVEIDAEGKEVKKALRKTDLGALYDSDEEKNPYLSESDVEENKKEEEENSKSKEASMKADGDGSGKQATNGKSANEGTPKNKSPSKQRSGPKKVKKIKTSCKKYKNGVVLIKADPTILKNFPAGEWNPGKNEDSSVQQSSLKTEGAQAQQQQSLGTKEDRPLTEQDIIDIVSSGKITLKELIKELKRRITMDTENRERMRVYVKKLVKISDGFLELSK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.42
3	0.47
4	0.54
5	0.61
6	0.67
7	0.67
8	0.72
9	0.74
10	0.77
11	0.76
12	0.78
13	0.8
14	0.82
15	0.83
16	0.81
17	0.85
18	0.81
19	0.8
20	0.8
21	0.78
22	0.76
23	0.74
24	0.74
25	0.75
26	0.8
27	0.83
28	0.8
29	0.8
30	0.81
31	0.78
32	0.75
33	0.71
34	0.7
35	0.67
36	0.65
37	0.59
38	0.54
39	0.5
40	0.45
41	0.43
42	0.41
43	0.35
44	0.35
45	0.37
46	0.35
47	0.35
48	0.37
49	0.36
50	0.33
51	0.35
52	0.31
53	0.27
54	0.27
55	0.27
56	0.32
57	0.34
58	0.31
59	0.31
60	0.38
61	0.37
62	0.34
63	0.35
64	0.34
65	0.38
66	0.39
67	0.37
68	0.37
69	0.41
70	0.45
71	0.53
72	0.52
73	0.51
74	0.58
75	0.61
76	0.62
77	0.66
78	0.63
79	0.59
80	0.57
81	0.55
82	0.47
83	0.42
84	0.33
85	0.24
86	0.24
87	0.2
88	0.18
89	0.16
90	0.14
91	0.13
92	0.14
93	0.13
94	0.12
95	0.1
96	0.09
97	0.08
98	0.08
99	0.08
100	0.08
101	0.08
102	0.08
103	0.08
104	0.08
105	0.07
106	0.1
107	0.1
108	0.13
109	0.15
110	0.21
111	0.25
112	0.34
113	0.42
114	0.43
115	0.47
116	0.53
117	0.62
118	0.62
119	0.66
120	0.64
121	0.6
122	0.66
123	0.69
124	0.61
125	0.54
126	0.52
127	0.52
128	0.57
129	0.53
130	0.49
131	0.51
132	0.57
133	0.61
134	0.68
135	0.69
136	0.67
137	0.66
138	0.67
139	0.62
140	0.57
141	0.55
142	0.46
143	0.37
144	0.28
145	0.3
146	0.29
147	0.33
148	0.36
149	0.31
150	0.3
151	0.3
152	0.33
153	0.35
154	0.37
155	0.37
156	0.34
157	0.35
158	0.4
159	0.4
160	0.38
161	0.34
162	0.33
163	0.28
164	0.28
165	0.33
166	0.31
167	0.33
168	0.36
169	0.4
170	0.44
171	0.43
172	0.46
173	0.42
174	0.44
175	0.49
176	0.51
177	0.54
178	0.51
179	0.52
180	0.5
181	0.5
182	0.47
183	0.4
184	0.35
185	0.26
186	0.22
187	0.19
188	0.16
189	0.14
190	0.12
191	0.11
192	0.09
193	0.08
194	0.05
195	0.07
196	0.07
197	0.07
198	0.08
199	0.09
200	0.09
201	0.12
202	0.17
203	0.17
204	0.25
205	0.3
206	0.33
207	0.35
208	0.35
209	0.34
210	0.3
211	0.29
212	0.22
213	0.16
214	0.13
215	0.12
216	0.12
217	0.11
218	0.09
219	0.09
220	0.07
221	0.08
222	0.08
223	0.07
224	0.12
225	0.13
226	0.14
227	0.13
228	0.13
229	0.16
230	0.19
231	0.19
232	0.16
233	0.15
234	0.23
235	0.26
236	0.26
237	0.23
238	0.25
239	0.32
240	0.31
241	0.31
242	0.24
243	0.23
244	0.25
245	0.25
246	0.21
247	0.15
248	0.14
249	0.13
250	0.11
251	0.1
252	0.09
253	0.08
254	0.08
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.06
259	0.05
260	0.05
261	0.05
262	0.05
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.03
267	0.04
268	0.04
269	0.04
270	0.07
271	0.07
272	0.08
273	0.09
274	0.1
275	0.13
276	0.19
277	0.26
278	0.33
279	0.41
280	0.5
281	0.6
282	0.69
283	0.75
284	0.79
285	0.81
286	0.79
287	0.79
288	0.8
289	0.79
290	0.79
291	0.75
292	0.74
293	0.69
294	0.62
295	0.53
296	0.44
297	0.38
298	0.29
299	0.25
300	0.22
301	0.24
302	0.27
303	0.27
304	0.27
305	0.23
306	0.22
307	0.19
308	0.15
309	0.1
310	0.07
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.07
316	0.06
317	0.05
318	0.05
319	0.05
320	0.06
321	0.07
322	0.08
323	0.07
324	0.07
325	0.08
326	0.07
327	0.07
328	0.07
329	0.06
330	0.06
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.08
336	0.08
337	0.09
338	0.08
339	0.07
340	0.09
341	0.09
342	0.09
343	0.09
344	0.11
345	0.1
346	0.12
347	0.14
348	0.14
349	0.15
350	0.17
351	0.23
352	0.24
353	0.25
354	0.24
355	0.23
356	0.22
357	0.22
358	0.2
359	0.13
360	0.11
361	0.12
362	0.11
363	0.11
364	0.11
365	0.11
366	0.12
367	0.17
368	0.21
369	0.24
370	0.31
371	0.37
372	0.45
373	0.46
374	0.48
375	0.47
376	0.49
377	0.48
378	0.46
379	0.42
380	0.32
381	0.34
382	0.32
383	0.29
384	0.22
385	0.19
386	0.16
387	0.15
388	0.15
389	0.11
390	0.11
391	0.11
392	0.12
393	0.13
394	0.2
395	0.27
396	0.37
397	0.39
398	0.43
399	0.43
400	0.44
401	0.5
402	0.47
403	0.46
404	0.41
405	0.42
406	0.37
407	0.36
408	0.35
409	0.27
410	0.23
411	0.17
412	0.14
413	0.11
414	0.11
415	0.1
416	0.1
417	0.09
418	0.07
419	0.06
420	0.05
421	0.04
422	0.06
423	0.07
424	0.08
425	0.1
426	0.11
427	0.14
428	0.17
429	0.17
430	0.18
431	0.18
432	0.18
433	0.16
434	0.17
435	0.14
436	0.1
437	0.09
438	0.08
439	0.08
440	0.08
441	0.07
442	0.06
443	0.06
444	0.06
445	0.06
446	0.06
447	0.05
448	0.05
449	0.06
450	0.08
451	0.08
452	0.09
453	0.09
454	0.1
455	0.11
456	0.13
457	0.2
458	0.24
459	0.26
460	0.3
461	0.32
462	0.35
463	0.43
464	0.46
465	0.41
466	0.37
467	0.34
468	0.32
469	0.32
470	0.28
471	0.19
472	0.14
473	0.12
474	0.1
475	0.1
476	0.08
477	0.06
478	0.07
479	0.07
480	0.09
481	0.08
482	0.08
483	0.1
484	0.1
485	0.1
486	0.1
487	0.1
488	0.08
489	0.08
490	0.07
491	0.06
492	0.05
493	0.04
494	0.06
495	0.06
496	0.06
497	0.08
498	0.11
499	0.18
500	0.22
501	0.28
502	0.35
503	0.37
504	0.39
505	0.45
506	0.46
507	0.4
508	0.37
509	0.31
510	0.25
511	0.24
512	0.23
513	0.16
514	0.13
515	0.14
516	0.14
517	0.14
518	0.12
519	0.12
520	0.12
521	0.11
522	0.12
523	0.13
524	0.16
525	0.19
526	0.21
527	0.21
528	0.22
529	0.22
530	0.22
531	0.19
532	0.18
533	0.22
534	0.27
535	0.33
536	0.37
537	0.39
538	0.38
539	0.39
540	0.43
541	0.37
542	0.35
543	0.33
544	0.29
545	0.27
546	0.29
547	0.27
548	0.24
549	0.22
550	0.19
551	0.17
552	0.15
553	0.16
554	0.2
555	0.21
556	0.24
557	0.25
558	0.24
559	0.25
560	0.27
561	0.31
562	0.32
563	0.34
564	0.34
565	0.4
566	0.44
567	0.46
568	0.49
569	0.49
570	0.54
571	0.6
572	0.65
573	0.66
574	0.7
575	0.75
576	0.82
577	0.88
578	0.87
579	0.87
580	0.89
581	0.9
582	0.91
583	0.91
584	0.91
585	0.91
586	0.92
587	0.92
588	0.92
589	0.9
590	0.88
591	0.86
592	0.84
593	0.82
594	0.77
595	0.72
596	0.66
597	0.59
598	0.53
599	0.44
600	0.35
601	0.27
602	0.23
603	0.23
604	0.19
605	0.19
606	0.18
607	0.19
608	0.19
609	0.25
610	0.23
611	0.26
612	0.31
613	0.32
614	0.34
615	0.36
616	0.37
617	0.31
618	0.34
619	0.27
620	0.27
621	0.3
622	0.3
623	0.29
624	0.31
625	0.31
626	0.3
627	0.31
628	0.25
629	0.2
630	0.21
631	0.26
632	0.27
633	0.31
634	0.33
635	0.35
636	0.36
637	0.36
638	0.34
639	0.3
640	0.28
641	0.27
642	0.25
643	0.25
644	0.27
645	0.34
646	0.34
647	0.35
648	0.37
649	0.38
650	0.41
651	0.37
652	0.34
653	0.29
654	0.27
655	0.24
656	0.2
657	0.15
658	0.1
659	0.1
660	0.09
661	0.11
662	0.11
663	0.13
664	0.19
665	0.23
666	0.25
667	0.29
668	0.38
669	0.43
670	0.51
671	0.56
672	0.59
673	0.59
674	0.59
675	0.59
676	0.58
677	0.61
678	0.62
679	0.66
680	0.65
681	0.69
682	0.69
683	0.66
684	0.58
685	0.51
686	0.51
687	0.48
688	0.47
689	0.48
690	0.53
691	0.58
692	0.62
693	0.62
694	0.58
695	0.54
696	0.49
697	0.45
698	0.41

A0A1E5RGS5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer