FuNGI

A0A1E5R7P3

Protein Details

Accession

A0A1E5R7P3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-27	MDPYQRNSNYRQQQQQHRYNRGYDRFR	Hydrophilic
178-198	SSEFKKAKKFIRNSKSPLKEN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 11.5, mito 6, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043954 Snu56_snRNP
Gene Ontology	GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF19097 Snu56_snRNP

Amino Acid Sequences

MDPYQRNSNYRQQQQQHRYNRGYDRFRGNVRGAPRGRGTVATRGRGTSVYTGRTSGRVDNLPSRFNNQSNPGPSYSSNGNNTDLRSSTYRTETNLGGVSNVVAGTRTIGANRISSSTANSTSSYVGKNDFSNKKGNTSHQPADLRASTRFDTNTNKRPNSALLSSTGSSHNRDESHNSSEFKKAKKFIRNSKSPLKENDEQIVLHESDNYNFLKELKLNQQSSAYTTPSTTNIKHLVEDFKNEVKNKQLIQSHQTLLKNSNVFLRVRDQEAFEETYKKYHKDKEWLKKNIPKCQVGFHKLSKSVFYIQLYQFTSVDFLLALFYLFDVTNSQHVSIHIAVHESTELQSIKAPINDTNAMGFQITLTKQLLSACTYPGFVGYNLHFNNPSLIFTNSKALSCLFQTFGNHSWKFDGNINIIKDKFRKTVTIQSYDFEATLSNQQYFYSNSKLLQPISQNKITSEFWDKLHRLSHKDVIKQIKTVTTKTTPLVXKKTKTAPTTIASQNIQTEKPLSVQQGLSVQTQPQASRFQSVSDSTTSRLSPSPQPTKSRFQNPTSPAPQRSTQVLSQEKIVELCLRIINDSVRQLDVMSAKSKSSYAIVKAFVKIPRYMYSDLPELSKXCQKVSYESNCNVIILSYINYHQSFAWFRELNLPWIDQLGESESKILTIGGVNGSCKLALDLIRKDIERRKEA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.83
2	0.87
3	0.87
4	0.87
5	0.83
6	0.81
7	0.82
8	0.81
9	0.78
10	0.75
11	0.74
12	0.71
13	0.7
14	0.69
15	0.62
16	0.58
17	0.55
18	0.57
19	0.51
20	0.5
21	0.48
22	0.45
23	0.43
24	0.43
25	0.42
26	0.42
27	0.47
28	0.47
29	0.45
30	0.43
31	0.43
32	0.38
33	0.37
34	0.35
35	0.33
36	0.32
37	0.31
38	0.32
39	0.32
40	0.34
41	0.34
42	0.3
43	0.31
44	0.31
45	0.34
46	0.4
47	0.43
48	0.45
49	0.44
50	0.46
51	0.46
52	0.44
53	0.46
54	0.44
55	0.48
56	0.48
57	0.5
58	0.46
59	0.44
60	0.42
61	0.4
62	0.38
63	0.37
64	0.36
65	0.35
66	0.37
67	0.36
68	0.37
69	0.36
70	0.31
71	0.29
72	0.27
73	0.28
74	0.29
75	0.32
76	0.32
77	0.32
78	0.34
79	0.31
80	0.31
81	0.29
82	0.25
83	0.2
84	0.18
85	0.15
86	0.12
87	0.11
88	0.08
89	0.06
90	0.06
91	0.07
92	0.08
93	0.09
94	0.08
95	0.12
96	0.14
97	0.15
98	0.16
99	0.17
100	0.17
101	0.17
102	0.2
103	0.21
104	0.22
105	0.22
106	0.22
107	0.21
108	0.21
109	0.23
110	0.22
111	0.19
112	0.19
113	0.2
114	0.22
115	0.3
116	0.33
117	0.33
118	0.4
119	0.4
120	0.45
121	0.47
122	0.51
123	0.51
124	0.53
125	0.55
126	0.53
127	0.55
128	0.49
129	0.5
130	0.47
131	0.4
132	0.34
133	0.35
134	0.28
135	0.29
136	0.29
137	0.26
138	0.33
139	0.39
140	0.46
141	0.52
142	0.52
143	0.51
144	0.52
145	0.52
146	0.48
147	0.42
148	0.34
149	0.27
150	0.29
151	0.28
152	0.28
153	0.28
154	0.24
155	0.24
156	0.24
157	0.25
158	0.23
159	0.25
160	0.3
161	0.3
162	0.34
163	0.36
164	0.36
165	0.34
166	0.41
167	0.44
168	0.43
169	0.45
170	0.47
171	0.51
172	0.59
173	0.66
174	0.68
175	0.73
176	0.77
177	0.77
178	0.81
179	0.8
180	0.76
181	0.73
182	0.7
183	0.65
184	0.6
185	0.56
186	0.47
187	0.39
188	0.35
189	0.32
190	0.25
191	0.19
192	0.18
193	0.15
194	0.14
195	0.17
196	0.15
197	0.12
198	0.12
199	0.12
200	0.12
201	0.13
202	0.17
203	0.23
204	0.31
205	0.31
206	0.32
207	0.35
208	0.33
209	0.36
210	0.34
211	0.26
212	0.18
213	0.19
214	0.19
215	0.2
216	0.23
217	0.19
218	0.21
219	0.24
220	0.24
221	0.24
222	0.25
223	0.29
224	0.26
225	0.29
226	0.28
227	0.28
228	0.32
229	0.32
230	0.32
231	0.3
232	0.33
233	0.31
234	0.33
235	0.33
236	0.32
237	0.35
238	0.39
239	0.35
240	0.37
241	0.37
242	0.33
243	0.31
244	0.32
245	0.28
246	0.24
247	0.26
248	0.23
249	0.22
250	0.21
251	0.25
252	0.22
253	0.24
254	0.24
255	0.21
256	0.2
257	0.22
258	0.24
259	0.19
260	0.21
261	0.18
262	0.23
263	0.24
264	0.26
265	0.28
266	0.33
267	0.38
268	0.44
269	0.54
270	0.59
271	0.67
272	0.72
273	0.75
274	0.75
275	0.76
276	0.75
277	0.72
278	0.66
279	0.56
280	0.56
281	0.56
282	0.53
283	0.52
284	0.47
285	0.45
286	0.44
287	0.43
288	0.37
289	0.32
290	0.3
291	0.27
292	0.24
293	0.25
294	0.22
295	0.26
296	0.26
297	0.24
298	0.21
299	0.18
300	0.18
301	0.12
302	0.12
303	0.06
304	0.05
305	0.04
306	0.04
307	0.04
308	0.03
309	0.03
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.05
314	0.06
315	0.08
316	0.08
317	0.09
318	0.09
319	0.09
320	0.11
321	0.11
322	0.11
323	0.09
324	0.09
325	0.09
326	0.08
327	0.08
328	0.06
329	0.06
330	0.08
331	0.08
332	0.07
333	0.08
334	0.09
335	0.11
336	0.11
337	0.12
338	0.11
339	0.14
340	0.15
341	0.14
342	0.13
343	0.12
344	0.11
345	0.1
346	0.09
347	0.05
348	0.07
349	0.07
350	0.08
351	0.08
352	0.08
353	0.09
354	0.1
355	0.11
356	0.11
357	0.11
358	0.11
359	0.11
360	0.11
361	0.1
362	0.1
363	0.1
364	0.08
365	0.09
366	0.09
367	0.15
368	0.15
369	0.16
370	0.16
371	0.15
372	0.17
373	0.15
374	0.16
375	0.11
376	0.12
377	0.13
378	0.13
379	0.18
380	0.16
381	0.16
382	0.16
383	0.14
384	0.14
385	0.13
386	0.14
387	0.1
388	0.11
389	0.12
390	0.14
391	0.18
392	0.25
393	0.24
394	0.24
395	0.25
396	0.25
397	0.26
398	0.26
399	0.25
400	0.2
401	0.25
402	0.25
403	0.26
404	0.26
405	0.27
406	0.27
407	0.28
408	0.28
409	0.25
410	0.28
411	0.29
412	0.38
413	0.4
414	0.44
415	0.4
416	0.37
417	0.38
418	0.35
419	0.3
420	0.21
421	0.15
422	0.1
423	0.14
424	0.15
425	0.13
426	0.13
427	0.13
428	0.15
429	0.17
430	0.19
431	0.18
432	0.18
433	0.18
434	0.22
435	0.24
436	0.23
437	0.24
438	0.27
439	0.31
440	0.36
441	0.39
442	0.35
443	0.34
444	0.37
445	0.34
446	0.31
447	0.3
448	0.26
449	0.24
450	0.31
451	0.31
452	0.3
453	0.35
454	0.36
455	0.35
456	0.38
457	0.44
458	0.42
459	0.45
460	0.49
461	0.52
462	0.5
463	0.47
464	0.43
465	0.43
466	0.4
467	0.38
468	0.37
469	0.31
470	0.32
471	0.32
472	0.4
473	0.37
474	0.41
475	0.48
476	0.45
477	0.47
478	0.51
479	0.58
480	0.52
481	0.51
482	0.47
483	0.4
484	0.45
485	0.42
486	0.4
487	0.31
488	0.3
489	0.31
490	0.3
491	0.28
492	0.22
493	0.21
494	0.17
495	0.18
496	0.2
497	0.18
498	0.18
499	0.18
500	0.19
501	0.21
502	0.22
503	0.22
504	0.2
505	0.19
506	0.19
507	0.21
508	0.2
509	0.18
510	0.22
511	0.21
512	0.24
513	0.24
514	0.22
515	0.24
516	0.25
517	0.25
518	0.23
519	0.23
520	0.2
521	0.22
522	0.21
523	0.2
524	0.2
525	0.21
526	0.26
527	0.34
528	0.42
529	0.46
530	0.53
531	0.56
532	0.64
533	0.68
534	0.71
535	0.68
536	0.65
537	0.68
538	0.66
539	0.7
540	0.68
541	0.67
542	0.61
543	0.58
544	0.56
545	0.49
546	0.48
547	0.43
548	0.38
549	0.4
550	0.42
551	0.38
552	0.38
553	0.37
554	0.33
555	0.29
556	0.27
557	0.21
558	0.16
559	0.18
560	0.17
561	0.16
562	0.16
563	0.17
564	0.18
565	0.2
566	0.22
567	0.21
568	0.2
569	0.19
570	0.18
571	0.2
572	0.2
573	0.19
574	0.19
575	0.18
576	0.18
577	0.19
578	0.19
579	0.17
580	0.19
581	0.21
582	0.22
583	0.25
584	0.29
585	0.31
586	0.33
587	0.37
588	0.37
589	0.36
590	0.34
591	0.33
592	0.34
593	0.37
594	0.37
595	0.35
596	0.36
597	0.37
598	0.35
599	0.34
600	0.3
601	0.28
602	0.3
603	0.33
604	0.29
605	0.27
606	0.3
607	0.32
608	0.4
609	0.45
610	0.51
611	0.48
612	0.52
613	0.5
614	0.46
615	0.4
616	0.31
617	0.23
618	0.14
619	0.14
620	0.11
621	0.12
622	0.17
623	0.17
624	0.18
625	0.18
626	0.21
627	0.23
628	0.24
629	0.31
630	0.27
631	0.27
632	0.36
633	0.38
634	0.37
635	0.37
636	0.35
637	0.26
638	0.27
639	0.26
640	0.17
641	0.17
642	0.17
643	0.16
644	0.15
645	0.16
646	0.15
647	0.15
648	0.15
649	0.13
650	0.09
651	0.08
652	0.1
653	0.12
654	0.14
655	0.14
656	0.16
657	0.17
658	0.16
659	0.15
660	0.14
661	0.13
662	0.18
663	0.24
664	0.27
665	0.32
666	0.36
667	0.37
668	0.43
669	0.48

A0A1E5R7P3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer