Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2B2B2

Protein Details
Accession H2B2B2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
266-290NSMASLTKKKKKTKHNQHITSHHTDHydrophilic
537-559AQKMGKSSRISRKYIKNDNPDTVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
274-277KKKK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044285  PWP1  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG kaf:KAFR_0L01520  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MISATGWVPRGYASEFPEKYELNDEEVARIEEMAKLNLGDDYSDEAANDEEQEQLNDDANDREENKEANVDGLKNQLEVDDDLKEYDLEHYEDSDNGKGQDISMFPGLANEDVKFHAGGEDSDPYITLPTQEEETEAKQELQVYPSDNLVLATRTEDEVSYLDVYVYDDGAGFHDSEIPTEQGDEADPDVARGLVRDSSLYVHHDLMLPAFPLCVEWLNYKPGSNDNDSLANFVAVGTFDPQIEIWNLDCVEKAFPDMILGEPVNNSMASLTKKKKKTKHNQHITSHHTDAVLSLSHNKHFRAVLASTSADHTVKLWDLNSGNAARSMASIHNNKNVSSSQWHHGNGSILLTGGYDSRIALTDVRISNENEMSKYWSVSNGEEVETVIFADENIILAGTDSGNIYSFDIRNNAGSKPVWTLKAHDAGISSLSVNNFIPGLMSTGAMGEKAVKLWKFPTGDSQADGSMKGPNMVLSRDFDVGNVLTTSFAPDIETAGVMVVGGVNKGLKLWDVFTNRTVRKSFTHELAGIQKLAREEAQKMGKSSRISRKYIKNDNPDTVVTVDDQGEDEEEREGEEEEEDWESE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.32
3 0.36
4 0.4
5 0.37
6 0.37
7 0.39
8 0.36
9 0.3
10 0.35
11 0.31
12 0.28
13 0.3
14 0.29
15 0.22
16 0.21
17 0.16
18 0.16
19 0.17
20 0.17
21 0.15
22 0.14
23 0.14
24 0.15
25 0.14
26 0.1
27 0.1
28 0.13
29 0.14
30 0.14
31 0.13
32 0.13
33 0.14
34 0.14
35 0.14
36 0.1
37 0.1
38 0.11
39 0.12
40 0.13
41 0.14
42 0.16
43 0.15
44 0.16
45 0.15
46 0.17
47 0.2
48 0.19
49 0.21
50 0.2
51 0.21
52 0.21
53 0.22
54 0.2
55 0.2
56 0.22
57 0.21
58 0.2
59 0.24
60 0.23
61 0.2
62 0.2
63 0.17
64 0.16
65 0.16
66 0.17
67 0.14
68 0.14
69 0.14
70 0.14
71 0.14
72 0.12
73 0.13
74 0.14
75 0.13
76 0.13
77 0.15
78 0.15
79 0.17
80 0.19
81 0.18
82 0.18
83 0.17
84 0.18
85 0.15
86 0.15
87 0.17
88 0.15
89 0.16
90 0.15
91 0.15
92 0.13
93 0.14
94 0.15
95 0.13
96 0.13
97 0.1
98 0.11
99 0.11
100 0.13
101 0.11
102 0.11
103 0.11
104 0.1
105 0.11
106 0.12
107 0.13
108 0.13
109 0.13
110 0.13
111 0.11
112 0.12
113 0.11
114 0.09
115 0.09
116 0.1
117 0.11
118 0.11
119 0.13
120 0.15
121 0.17
122 0.18
123 0.18
124 0.17
125 0.16
126 0.19
127 0.18
128 0.17
129 0.17
130 0.17
131 0.17
132 0.17
133 0.16
134 0.13
135 0.13
136 0.12
137 0.11
138 0.08
139 0.09
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.11
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.08
151 0.09
152 0.08
153 0.08
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.06
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.12
165 0.11
166 0.1
167 0.11
168 0.11
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.07
173 0.08
174 0.08
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.06
180 0.07
181 0.06
182 0.07
183 0.07
184 0.08
185 0.09
186 0.11
187 0.13
188 0.14
189 0.13
190 0.13
191 0.14
192 0.14
193 0.13
194 0.12
195 0.1
196 0.08
197 0.07
198 0.06
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.09
204 0.11
205 0.16
206 0.16
207 0.17
208 0.17
209 0.21
210 0.23
211 0.24
212 0.24
213 0.21
214 0.24
215 0.24
216 0.24
217 0.19
218 0.15
219 0.11
220 0.1
221 0.08
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.07
230 0.08
231 0.08
232 0.07
233 0.08
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.06
246 0.07
247 0.07
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.06
254 0.04
255 0.07
256 0.09
257 0.16
258 0.23
259 0.3
260 0.39
261 0.47
262 0.55
263 0.64
264 0.73
265 0.78
266 0.82
267 0.85
268 0.86
269 0.86
270 0.85
271 0.81
272 0.75
273 0.65
274 0.54
275 0.43
276 0.34
277 0.26
278 0.2
279 0.13
280 0.07
281 0.11
282 0.11
283 0.14
284 0.16
285 0.16
286 0.17
287 0.17
288 0.17
289 0.16
290 0.16
291 0.14
292 0.14
293 0.14
294 0.12
295 0.13
296 0.14
297 0.1
298 0.09
299 0.09
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.09
306 0.1
307 0.12
308 0.11
309 0.11
310 0.11
311 0.11
312 0.08
313 0.08
314 0.1
315 0.09
316 0.14
317 0.18
318 0.2
319 0.25
320 0.26
321 0.26
322 0.27
323 0.25
324 0.22
325 0.23
326 0.24
327 0.23
328 0.27
329 0.28
330 0.26
331 0.27
332 0.26
333 0.22
334 0.19
335 0.14
336 0.09
337 0.08
338 0.08
339 0.06
340 0.05
341 0.05
342 0.04
343 0.04
344 0.05
345 0.05
346 0.06
347 0.06
348 0.07
349 0.12
350 0.13
351 0.14
352 0.16
353 0.16
354 0.18
355 0.2
356 0.21
357 0.16
358 0.16
359 0.19
360 0.17
361 0.18
362 0.16
363 0.15
364 0.16
365 0.16
366 0.19
367 0.16
368 0.16
369 0.15
370 0.15
371 0.12
372 0.1
373 0.09
374 0.06
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.05
390 0.06
391 0.07
392 0.09
393 0.09
394 0.1
395 0.12
396 0.12
397 0.15
398 0.16
399 0.16
400 0.17
401 0.17
402 0.17
403 0.2
404 0.23
405 0.24
406 0.23
407 0.27
408 0.29
409 0.34
410 0.33
411 0.28
412 0.26
413 0.23
414 0.23
415 0.19
416 0.14
417 0.1
418 0.1
419 0.11
420 0.1
421 0.1
422 0.09
423 0.08
424 0.08
425 0.06
426 0.09
427 0.07
428 0.08
429 0.07
430 0.08
431 0.08
432 0.07
433 0.07
434 0.06
435 0.06
436 0.08
437 0.13
438 0.12
439 0.14
440 0.16
441 0.22
442 0.22
443 0.23
444 0.3
445 0.31
446 0.32
447 0.32
448 0.32
449 0.28
450 0.27
451 0.27
452 0.19
453 0.16
454 0.15
455 0.14
456 0.13
457 0.14
458 0.15
459 0.16
460 0.17
461 0.16
462 0.19
463 0.2
464 0.19
465 0.16
466 0.17
467 0.16
468 0.15
469 0.13
470 0.1
471 0.09
472 0.09
473 0.12
474 0.1
475 0.09
476 0.09
477 0.09
478 0.1
479 0.1
480 0.1
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.06
485 0.05
486 0.05
487 0.04
488 0.04
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.06
493 0.06
494 0.07
495 0.08
496 0.11
497 0.18
498 0.23
499 0.26
500 0.31
501 0.4
502 0.41
503 0.45
504 0.45
505 0.4
506 0.4
507 0.46
508 0.46
509 0.42
510 0.45
511 0.41
512 0.43
513 0.45
514 0.43
515 0.36
516 0.31
517 0.29
518 0.24
519 0.25
520 0.24
521 0.21
522 0.21
523 0.27
524 0.35
525 0.36
526 0.38
527 0.4
528 0.42
529 0.44
530 0.51
531 0.54
532 0.54
533 0.58
534 0.64
535 0.71
536 0.76
537 0.81
538 0.81
539 0.81
540 0.81
541 0.8
542 0.75
543 0.65
544 0.58
545 0.48
546 0.39
547 0.3
548 0.24
549 0.19
550 0.15
551 0.15
552 0.13
553 0.13
554 0.13
555 0.12
556 0.11
557 0.11
558 0.11
559 0.11
560 0.12
561 0.11
562 0.11
563 0.1
564 0.11