Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E5RFB1

Protein Details
Accession A0A1E5RFB1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
309-340EQREASKLERREKKYQLKLKEMRKKTRAQEYTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
316-352LERREKKYQLKLKEMRKKTRAQEYTQKMKMKKFGAKH
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009061  DNA-bd_dom_put_sf  
IPR000465  XPA  
IPR022656  XPA_C  
IPR037129  XPA_sf  
IPR022652  Znf_XPA_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF05181  XPA_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00752  XPA_1  
Amino Acid Sequences MNLNAEQKASIEANRKRALERLQKRGISIPSSSKLHETSSKVTKPSIQGGTEHSKGNAANSTQATKVVESTAVSGPNDSPQQPSSSTHIESHPQNRDASSVETKKQYIRPSIRKKDYIEYDFSTMENSYGGFINNDRSLYGSGYSSIDNAEKTFEQWQAEQRSKNDLFNGPSSSTEPGDAVENGTQLVREFKHLGPDIISDLSALPKCEECHVNVEFDTILLQHFKIKICKRCTVEHPEKYSLLTKTECKSDYLLTEPELEDHKLFHRLEKANPHSGTFARMQLFLRKEVEEFAFEKWGGQDGLDKEWEQREASKLERREKKYQLKLKEMRKKTRAQEYTQKMKMKKFGAKHIHEFSAPLKMKKKSDDGYDVVKRRCIGCGMEVEELDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.5
3 0.48
4 0.53
5 0.57
6 0.58
7 0.61
8 0.62
9 0.66
10 0.66
11 0.66
12 0.67
13 0.61
14 0.54
15 0.5
16 0.47
17 0.44
18 0.45
19 0.44
20 0.41
21 0.37
22 0.38
23 0.4
24 0.38
25 0.39
26 0.46
27 0.49
28 0.47
29 0.47
30 0.48
31 0.46
32 0.49
33 0.47
34 0.39
35 0.36
36 0.41
37 0.46
38 0.43
39 0.4
40 0.32
41 0.29
42 0.28
43 0.29
44 0.27
45 0.2
46 0.23
47 0.24
48 0.26
49 0.24
50 0.26
51 0.25
52 0.2
53 0.2
54 0.16
55 0.15
56 0.13
57 0.16
58 0.16
59 0.17
60 0.17
61 0.17
62 0.16
63 0.19
64 0.22
65 0.19
66 0.2
67 0.19
68 0.21
69 0.22
70 0.25
71 0.26
72 0.28
73 0.29
74 0.28
75 0.29
76 0.32
77 0.36
78 0.41
79 0.43
80 0.41
81 0.4
82 0.38
83 0.37
84 0.34
85 0.33
86 0.34
87 0.31
88 0.32
89 0.34
90 0.36
91 0.39
92 0.43
93 0.43
94 0.44
95 0.5
96 0.57
97 0.65
98 0.74
99 0.76
100 0.77
101 0.75
102 0.73
103 0.72
104 0.65
105 0.59
106 0.51
107 0.46
108 0.41
109 0.37
110 0.29
111 0.21
112 0.17
113 0.12
114 0.09
115 0.07
116 0.07
117 0.08
118 0.07
119 0.07
120 0.11
121 0.12
122 0.12
123 0.11
124 0.12
125 0.12
126 0.13
127 0.13
128 0.09
129 0.1
130 0.11
131 0.11
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.1
138 0.09
139 0.1
140 0.13
141 0.14
142 0.15
143 0.16
144 0.23
145 0.27
146 0.31
147 0.33
148 0.31
149 0.37
150 0.37
151 0.37
152 0.34
153 0.31
154 0.29
155 0.28
156 0.29
157 0.21
158 0.21
159 0.21
160 0.19
161 0.16
162 0.14
163 0.12
164 0.09
165 0.1
166 0.09
167 0.09
168 0.08
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.05
174 0.08
175 0.07
176 0.09
177 0.12
178 0.12
179 0.18
180 0.19
181 0.19
182 0.17
183 0.18
184 0.16
185 0.13
186 0.13
187 0.07
188 0.07
189 0.09
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.11
196 0.13
197 0.12
198 0.16
199 0.16
200 0.17
201 0.16
202 0.16
203 0.13
204 0.12
205 0.11
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.06
210 0.07
211 0.1
212 0.12
213 0.2
214 0.26
215 0.34
216 0.39
217 0.46
218 0.47
219 0.5
220 0.55
221 0.58
222 0.61
223 0.6
224 0.61
225 0.57
226 0.54
227 0.51
228 0.49
229 0.4
230 0.32
231 0.28
232 0.26
233 0.25
234 0.29
235 0.28
236 0.25
237 0.25
238 0.24
239 0.23
240 0.22
241 0.21
242 0.17
243 0.19
244 0.17
245 0.17
246 0.17
247 0.17
248 0.13
249 0.13
250 0.14
251 0.19
252 0.19
253 0.21
254 0.27
255 0.29
256 0.34
257 0.43
258 0.47
259 0.49
260 0.49
261 0.47
262 0.41
263 0.39
264 0.38
265 0.3
266 0.28
267 0.21
268 0.22
269 0.23
270 0.27
271 0.29
272 0.28
273 0.28
274 0.25
275 0.24
276 0.25
277 0.25
278 0.21
279 0.2
280 0.18
281 0.19
282 0.18
283 0.18
284 0.15
285 0.16
286 0.13
287 0.12
288 0.16
289 0.15
290 0.18
291 0.19
292 0.19
293 0.2
294 0.22
295 0.24
296 0.19
297 0.2
298 0.22
299 0.23
300 0.29
301 0.34
302 0.39
303 0.48
304 0.56
305 0.61
306 0.66
307 0.73
308 0.78
309 0.81
310 0.82
311 0.81
312 0.82
313 0.83
314 0.85
315 0.85
316 0.85
317 0.85
318 0.84
319 0.84
320 0.81
321 0.84
322 0.8
323 0.77
324 0.77
325 0.76
326 0.79
327 0.78
328 0.77
329 0.71
330 0.71
331 0.71
332 0.68
333 0.67
334 0.63
335 0.66
336 0.69
337 0.72
338 0.73
339 0.72
340 0.66
341 0.59
342 0.54
343 0.45
344 0.46
345 0.42
346 0.4
347 0.42
348 0.45
349 0.5
350 0.55
351 0.62
352 0.57
353 0.61
354 0.62
355 0.59
356 0.62
357 0.66
358 0.67
359 0.61
360 0.6
361 0.54
362 0.48
363 0.46
364 0.4
365 0.34
366 0.31
367 0.35
368 0.35
369 0.36