Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E5RV69

Protein Details
Accession A0A1E5RV69    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
223-247ALDKLTKQKERRKRLEEKKRLSVTKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
220-253KEKQALDKLTKQKERRKRLEEKKRLSVTKEKLKK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 11.5, mito 6, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043954  Snu56_snRNP  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19097  Snu56_snRNP  
Amino Acid Sequences MNKHQLPIGGKKRRLEETSHSVQLKKVKLNARLPFKNNCNILIELPSKAYHLPQYEKYIQKIEDTSYIFVNKKTSXNELISLLTGFYKDEKYIKCNLVLDNYHSDFTKPFHRYNKIKIVKSLMSELILSPRYDIYNLKIGKNNIDSIISLIHAIKFTKRKTDFLDDFKRLFKSAETADNADNYSKTVELELSYKSSNVQSILKDLLKSHKKQAINTIKLKEKQALDKLTKQKERRKRLEEKKRLSVTKEKLKKPVIVATQKPETLPETSIEEKSITVEKSTPHVEQKPAQNTASEPEEETLTEEELDKHALLTITKNMTALTTLKKTKPYKIVKIFIRLPIKKYSTTIINELISSNKTSANIVIVSYINLQDTKVFFKNELKMKALGDSTEREFKVLAIGGGINDVLITLXDIRKNMMLKMTR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.63
3 0.61
4 0.6
5 0.61
6 0.63
7 0.59
8 0.53
9 0.53
10 0.54
11 0.52
12 0.49
13 0.5
14 0.5
15 0.57
16 0.65
17 0.69
18 0.72
19 0.74
20 0.73
21 0.74
22 0.73
23 0.71
24 0.64
25 0.58
26 0.52
27 0.45
28 0.42
29 0.39
30 0.34
31 0.27
32 0.27
33 0.25
34 0.22
35 0.21
36 0.22
37 0.21
38 0.25
39 0.3
40 0.33
41 0.41
42 0.48
43 0.51
44 0.52
45 0.52
46 0.47
47 0.46
48 0.43
49 0.37
50 0.35
51 0.33
52 0.31
53 0.28
54 0.31
55 0.28
56 0.28
57 0.3
58 0.26
59 0.26
60 0.3
61 0.3
62 0.28
63 0.28
64 0.29
65 0.25
66 0.23
67 0.22
68 0.16
69 0.14
70 0.12
71 0.11
72 0.11
73 0.11
74 0.12
75 0.18
76 0.2
77 0.24
78 0.31
79 0.33
80 0.34
81 0.36
82 0.36
83 0.36
84 0.35
85 0.35
86 0.35
87 0.35
88 0.32
89 0.29
90 0.28
91 0.23
92 0.23
93 0.28
94 0.26
95 0.3
96 0.38
97 0.47
98 0.52
99 0.59
100 0.68
101 0.67
102 0.66
103 0.64
104 0.62
105 0.56
106 0.52
107 0.47
108 0.37
109 0.29
110 0.26
111 0.22
112 0.2
113 0.19
114 0.16
115 0.14
116 0.14
117 0.14
118 0.14
119 0.15
120 0.14
121 0.2
122 0.22
123 0.24
124 0.27
125 0.28
126 0.32
127 0.33
128 0.31
129 0.24
130 0.23
131 0.2
132 0.16
133 0.16
134 0.11
135 0.1
136 0.09
137 0.08
138 0.09
139 0.09
140 0.13
141 0.19
142 0.21
143 0.3
144 0.32
145 0.34
146 0.39
147 0.48
148 0.48
149 0.51
150 0.58
151 0.52
152 0.51
153 0.5
154 0.46
155 0.37
156 0.32
157 0.24
158 0.19
159 0.17
160 0.21
161 0.21
162 0.22
163 0.22
164 0.22
165 0.22
166 0.19
167 0.17
168 0.11
169 0.1
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.09
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.12
185 0.11
186 0.13
187 0.16
188 0.16
189 0.15
190 0.16
191 0.23
192 0.27
193 0.29
194 0.33
195 0.36
196 0.37
197 0.38
198 0.48
199 0.49
200 0.5
201 0.53
202 0.52
203 0.51
204 0.52
205 0.52
206 0.46
207 0.38
208 0.37
209 0.38
210 0.39
211 0.37
212 0.43
213 0.5
214 0.53
215 0.59
216 0.61
217 0.64
218 0.68
219 0.75
220 0.76
221 0.77
222 0.8
223 0.83
224 0.87
225 0.88
226 0.86
227 0.85
228 0.82
229 0.76
230 0.7
231 0.68
232 0.65
233 0.65
234 0.66
235 0.61
236 0.62
237 0.63
238 0.61
239 0.54
240 0.53
241 0.51
242 0.5
243 0.48
244 0.46
245 0.45
246 0.42
247 0.39
248 0.34
249 0.27
250 0.22
251 0.2
252 0.15
253 0.17
254 0.19
255 0.19
256 0.18
257 0.17
258 0.15
259 0.16
260 0.18
261 0.13
262 0.12
263 0.13
264 0.14
265 0.17
266 0.2
267 0.21
268 0.24
269 0.27
270 0.3
271 0.34
272 0.41
273 0.44
274 0.44
275 0.42
276 0.37
277 0.34
278 0.33
279 0.31
280 0.23
281 0.18
282 0.15
283 0.15
284 0.14
285 0.15
286 0.13
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.11
293 0.09
294 0.08
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.11
299 0.16
300 0.16
301 0.17
302 0.17
303 0.15
304 0.15
305 0.16
306 0.17
307 0.17
308 0.22
309 0.27
310 0.3
311 0.39
312 0.43
313 0.49
314 0.56
315 0.6
316 0.64
317 0.68
318 0.74
319 0.7
320 0.75
321 0.72
322 0.7
323 0.71
324 0.63
325 0.58
326 0.58
327 0.56
328 0.5
329 0.47
330 0.43
331 0.4
332 0.4
333 0.4
334 0.35
335 0.32
336 0.3
337 0.29
338 0.28
339 0.22
340 0.2
341 0.17
342 0.15
343 0.15
344 0.16
345 0.16
346 0.16
347 0.15
348 0.13
349 0.14
350 0.13
351 0.13
352 0.14
353 0.14
354 0.12
355 0.12
356 0.12
357 0.13
358 0.15
359 0.2
360 0.22
361 0.23
362 0.24
363 0.31
364 0.39
365 0.44
366 0.48
367 0.45
368 0.44
369 0.43
370 0.45
371 0.39
372 0.33
373 0.28
374 0.28
375 0.29
376 0.34
377 0.34
378 0.3
379 0.29
380 0.27
381 0.28
382 0.25
383 0.2
384 0.13
385 0.14
386 0.13
387 0.13
388 0.13
389 0.08
390 0.06
391 0.06
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.08
396 0.11
397 0.13
398 0.14
399 0.16
400 0.18
401 0.19