Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E5RTQ6

Protein Details
Accession A0A1E5RTQ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
192-226QQKTLKLTDKGKKFKRTTKKMEKEVWKNRKWKTIFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
201-222KGKKFKRTTKKMEXKEVWKNRK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12.833, nucl 12.5, cyto 8, cyto_mito 5.165, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001388  Synaptobrevin-like  
IPR016444  Synaptobrevin/VAMP  
IPR042855  V_SNARE_CC  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00957  Synaptobrevin  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50892  V_SNARE  
CDD cd15843  R-SNARE  
Amino Acid Sequences MVEDRAEYHILYYGIFDFYESPLVSIFSEKGKGSSQYGSIIDKTIKDSNFIEKMINNKIDLKSLFLNHDEKMVIMNKVLIDYFVFIKKDNFEDKVFYEICISRNTVPRSLPMSILNNKQKIDYTALFGKSKEATQNTLLEFIDSFESEYNLEANNTSEHVVEIDNEMNEILAVMNDNINQVLIRDDRLDNLQQKTLKLTDKGKKFKRTTKKMEXKEVWKNRKWKTIFVGSVLLVVVLFITFERIFTN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.12
4 0.1
5 0.11
6 0.15
7 0.14
8 0.13
9 0.12
10 0.13
11 0.13
12 0.14
13 0.14
14 0.12
15 0.16
16 0.16
17 0.17
18 0.2
19 0.22
20 0.23
21 0.24
22 0.23
23 0.24
24 0.26
25 0.26
26 0.24
27 0.24
28 0.22
29 0.21
30 0.24
31 0.26
32 0.24
33 0.25
34 0.25
35 0.3
36 0.31
37 0.31
38 0.28
39 0.24
40 0.29
41 0.32
42 0.32
43 0.27
44 0.29
45 0.29
46 0.32
47 0.3
48 0.29
49 0.25
50 0.25
51 0.26
52 0.24
53 0.26
54 0.21
55 0.23
56 0.19
57 0.16
58 0.17
59 0.17
60 0.14
61 0.12
62 0.13
63 0.11
64 0.12
65 0.12
66 0.09
67 0.07
68 0.08
69 0.09
70 0.11
71 0.11
72 0.11
73 0.13
74 0.14
75 0.18
76 0.2
77 0.21
78 0.19
79 0.21
80 0.21
81 0.25
82 0.23
83 0.2
84 0.19
85 0.18
86 0.18
87 0.17
88 0.18
89 0.17
90 0.24
91 0.26
92 0.25
93 0.24
94 0.26
95 0.28
96 0.27
97 0.25
98 0.21
99 0.24
100 0.25
101 0.32
102 0.35
103 0.34
104 0.33
105 0.32
106 0.3
107 0.27
108 0.28
109 0.21
110 0.19
111 0.2
112 0.22
113 0.22
114 0.21
115 0.21
116 0.18
117 0.18
118 0.19
119 0.16
120 0.16
121 0.18
122 0.2
123 0.19
124 0.2
125 0.19
126 0.15
127 0.14
128 0.12
129 0.11
130 0.08
131 0.08
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.09
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.04
158 0.03
159 0.04
160 0.04
161 0.05
162 0.05
163 0.06
164 0.05
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.11
172 0.12
173 0.13
174 0.17
175 0.23
176 0.26
177 0.28
178 0.32
179 0.31
180 0.32
181 0.34
182 0.35
183 0.34
184 0.34
185 0.4
186 0.43
187 0.51
188 0.61
189 0.66
190 0.72
191 0.76
192 0.8
193 0.83
194 0.85
195 0.86
196 0.87
197 0.89
198 0.87
199 0.89
200 0.89
201 0.89
202 0.9
203 0.89
204 0.86
205 0.85
206 0.82
207 0.82
208 0.75
209 0.72
210 0.69
211 0.68
212 0.62
213 0.57
214 0.54
215 0.44
216 0.42
217 0.34
218 0.26
219 0.15
220 0.12
221 0.08
222 0.04
223 0.04
224 0.03
225 0.08
226 0.08