Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2B1U0

Protein Details
Accession H2B1U0    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-47KAQGFSKKKGSERKSTTKRITDNTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-37KGKAQGFSKKKGSERK
Subcellular Location(s) mito 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR019368  Ribosomal_S23/S29_mit  
IPR017082  Ribosomal_S23_mit_fun  
Gene Ontology GO:0005763  C:mitochondrial small ribosomal subunit  
GO:0032543  P:mitochondrial translation  
KEGG kaf:KAFR_0K02350  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10236  DAP3  
Amino Acid Sequences MFKLQSRNISLSAITRAAVPGKGKAQGFSKKKGSERKSTTKRITDNTLYKKWINTVHTAKFNRNAPVMSLPKYTPNDMDSCVGKVVKFSEQQCKSLHHLGSFKKDQFNELFNAPISLIRHESANLQESITKSKSKRIIITGEPGIGKTTLLSHIHANALGLNSIVINISYPQLFLNGRNDFFLDEESKLYIQPMYLKKFIRKILKANDEKILASVKLSDSYTFSRTTMKGATNITLHRGSSTLFDLLSSSVNANVRGKQYQAIMKELYGQPNIPICFTIDNFSSILTQPFSEYRDVENKNIYALDLQIGKTIMDLVSGEVPFLNPKSCLVMAISGVDRTNRTLPVALGKLPEDPYVTRYHYEPNFAKIMKKGMVEEFEVTKMGKDEVRTLLRFYSDAKIILKRELQTKTLENLSEEKYFLSGNGNPRELLKSIVLTHK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.19
3 0.19
4 0.2
5 0.22
6 0.21
7 0.22
8 0.25
9 0.3
10 0.3
11 0.32
12 0.38
13 0.44
14 0.49
15 0.52
16 0.57
17 0.59
18 0.66
19 0.73
20 0.72
21 0.73
22 0.76
23 0.79
24 0.8
25 0.84
26 0.85
27 0.83
28 0.83
29 0.78
30 0.77
31 0.75
32 0.75
33 0.73
34 0.7
35 0.66
36 0.61
37 0.58
38 0.54
39 0.52
40 0.46
41 0.46
42 0.48
43 0.5
44 0.57
45 0.59
46 0.59
47 0.59
48 0.6
49 0.56
50 0.5
51 0.44
52 0.38
53 0.43
54 0.42
55 0.38
56 0.37
57 0.33
58 0.38
59 0.4
60 0.39
61 0.33
62 0.31
63 0.3
64 0.29
65 0.31
66 0.24
67 0.23
68 0.23
69 0.22
70 0.18
71 0.18
72 0.18
73 0.21
74 0.25
75 0.28
76 0.36
77 0.38
78 0.42
79 0.43
80 0.44
81 0.45
82 0.47
83 0.45
84 0.39
85 0.42
86 0.43
87 0.5
88 0.52
89 0.5
90 0.49
91 0.47
92 0.47
93 0.44
94 0.43
95 0.37
96 0.31
97 0.28
98 0.22
99 0.22
100 0.17
101 0.17
102 0.15
103 0.14
104 0.15
105 0.13
106 0.14
107 0.14
108 0.16
109 0.16
110 0.19
111 0.17
112 0.15
113 0.17
114 0.18
115 0.23
116 0.23
117 0.26
118 0.24
119 0.31
120 0.37
121 0.4
122 0.43
123 0.42
124 0.46
125 0.43
126 0.48
127 0.42
128 0.38
129 0.33
130 0.29
131 0.25
132 0.19
133 0.16
134 0.1
135 0.1
136 0.11
137 0.12
138 0.13
139 0.13
140 0.15
141 0.15
142 0.15
143 0.14
144 0.11
145 0.1
146 0.09
147 0.07
148 0.06
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.03
153 0.03
154 0.04
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.08
160 0.09
161 0.1
162 0.16
163 0.18
164 0.18
165 0.19
166 0.19
167 0.17
168 0.17
169 0.17
170 0.12
171 0.1
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.09
178 0.07
179 0.13
180 0.18
181 0.21
182 0.26
183 0.28
184 0.31
185 0.36
186 0.42
187 0.44
188 0.42
189 0.45
190 0.49
191 0.58
192 0.58
193 0.55
194 0.52
195 0.44
196 0.4
197 0.34
198 0.27
199 0.17
200 0.13
201 0.11
202 0.08
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.1
207 0.12
208 0.14
209 0.14
210 0.14
211 0.15
212 0.16
213 0.17
214 0.18
215 0.17
216 0.18
217 0.18
218 0.19
219 0.18
220 0.18
221 0.2
222 0.18
223 0.16
224 0.14
225 0.13
226 0.12
227 0.11
228 0.12
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.09
234 0.09
235 0.07
236 0.06
237 0.08
238 0.09
239 0.11
240 0.12
241 0.14
242 0.16
243 0.16
244 0.17
245 0.16
246 0.19
247 0.21
248 0.21
249 0.22
250 0.2
251 0.19
252 0.24
253 0.23
254 0.23
255 0.2
256 0.19
257 0.17
258 0.21
259 0.21
260 0.16
261 0.15
262 0.13
263 0.13
264 0.14
265 0.15
266 0.11
267 0.12
268 0.12
269 0.12
270 0.12
271 0.11
272 0.12
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.11
277 0.13
278 0.13
279 0.14
280 0.16
281 0.24
282 0.26
283 0.27
284 0.29
285 0.27
286 0.26
287 0.25
288 0.22
289 0.14
290 0.12
291 0.12
292 0.1
293 0.11
294 0.11
295 0.11
296 0.11
297 0.1
298 0.11
299 0.08
300 0.07
301 0.07
302 0.06
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.08
307 0.09
308 0.1
309 0.11
310 0.11
311 0.09
312 0.09
313 0.13
314 0.13
315 0.14
316 0.13
317 0.14
318 0.13
319 0.15
320 0.15
321 0.12
322 0.12
323 0.13
324 0.13
325 0.15
326 0.17
327 0.16
328 0.17
329 0.17
330 0.17
331 0.23
332 0.24
333 0.22
334 0.21
335 0.21
336 0.23
337 0.23
338 0.23
339 0.19
340 0.18
341 0.19
342 0.22
343 0.24
344 0.22
345 0.22
346 0.29
347 0.29
348 0.36
349 0.35
350 0.35
351 0.38
352 0.38
353 0.4
354 0.35
355 0.39
356 0.34
357 0.34
358 0.32
359 0.3
360 0.32
361 0.31
362 0.31
363 0.27
364 0.24
365 0.24
366 0.21
367 0.18
368 0.16
369 0.16
370 0.15
371 0.15
372 0.19
373 0.25
374 0.32
375 0.32
376 0.33
377 0.33
378 0.32
379 0.32
380 0.3
381 0.28
382 0.24
383 0.26
384 0.27
385 0.31
386 0.31
387 0.36
388 0.38
389 0.37
390 0.42
391 0.43
392 0.42
393 0.42
394 0.44
395 0.43
396 0.43
397 0.41
398 0.35
399 0.36
400 0.38
401 0.34
402 0.3
403 0.26
404 0.22
405 0.21
406 0.19
407 0.2
408 0.2
409 0.27
410 0.34
411 0.35
412 0.34
413 0.36
414 0.39
415 0.35
416 0.33
417 0.27
418 0.24