Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2B0E9

Protein Details
Accession H2B0E9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
479-508EEKNKKLKLSRISPKKRLSNYKQKNNLDAFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
476-496RKEEEKNKKLKLSRISPKKRL
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
Gene Ontology GO:0004536  F:DNA nuclease activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
KEGG kaf:KAFR_0J00310  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00867  XPG_I  
CDD cd09870  PIN_YEN1  
Amino Acid Sequences MGVPQIWELVKQTNSVERVTFKTIIPRVKVAVDAYHILFECGFFNESANYGKAYLNLISRLRELISLNAFFLLIFDGHVKPTKVRNAGYGGDYEPEFMNLIKSLLNLFHISYVTAIGEGEAYCCWVTKQLNDQLDYVWSNDSDVLLFGGMKVLKNYSRFVNDIGVTNVNGDTNEKNHENLITFVDYDELTRKHKMLNRERLLFYSVLLGADYNQGVKGLGKDKCLKIVQLTNPDFAMRFYNIFSNTRSNDSTKTSKYIKFQKDLFAYCQKNSVELFGRNYSKTLLSAERDNFEGWPAVEIVSYYFHPLLDTNFDKRLLCKEMFSNIKDSKIYEKIDFFELKTCLEQLKMPSITDFDKWFHSLVHEMFLVKFLVNEEGKMDFMKNKLLKITEEKVNYVNNNIKLAIPYWKVRYNTFLPGVSPSQKVSKNRSPSPTRSPSKRQIDIYEYKFSMWVPKVCIPPTHSLVRDFQRRQDEERKEEEKNKKLKLSRISPKKRLSNYKQKNNLDAFLKKHATPMKRELQSLKLQPAPPLQSIKRRLFVEADEEDEEQNDTEEEDSLMILEENIITNNPLSNRSPQKRPMGPFEKPTVSPLSKGIPLLKKQCSFKEDDNASEEPLVTVSDATVDPNVSLESSQQQQQPGNIYGELTSNAIDFTSEYLNDTESSSMNTGSDWEFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.31
3 0.32
4 0.3
5 0.33
6 0.37
7 0.37
8 0.31
9 0.38
10 0.43
11 0.47
12 0.48
13 0.46
14 0.43
15 0.42
16 0.43
17 0.35
18 0.32
19 0.28
20 0.27
21 0.25
22 0.25
23 0.24
24 0.22
25 0.2
26 0.17
27 0.15
28 0.14
29 0.14
30 0.11
31 0.12
32 0.13
33 0.14
34 0.17
35 0.16
36 0.15
37 0.15
38 0.16
39 0.16
40 0.18
41 0.19
42 0.19
43 0.24
44 0.25
45 0.26
46 0.26
47 0.26
48 0.25
49 0.24
50 0.22
51 0.23
52 0.26
53 0.24
54 0.23
55 0.22
56 0.21
57 0.18
58 0.17
59 0.13
60 0.07
61 0.07
62 0.1
63 0.1
64 0.13
65 0.17
66 0.18
67 0.21
68 0.28
69 0.36
70 0.39
71 0.39
72 0.42
73 0.43
74 0.44
75 0.42
76 0.37
77 0.29
78 0.26
79 0.24
80 0.21
81 0.16
82 0.14
83 0.13
84 0.11
85 0.11
86 0.1
87 0.1
88 0.09
89 0.09
90 0.1
91 0.1
92 0.13
93 0.12
94 0.12
95 0.13
96 0.13
97 0.13
98 0.12
99 0.12
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.06
104 0.07
105 0.06
106 0.07
107 0.06
108 0.07
109 0.07
110 0.08
111 0.08
112 0.12
113 0.14
114 0.17
115 0.26
116 0.32
117 0.37
118 0.39
119 0.39
120 0.35
121 0.36
122 0.33
123 0.26
124 0.19
125 0.14
126 0.13
127 0.13
128 0.12
129 0.09
130 0.08
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.08
136 0.09
137 0.09
138 0.1
139 0.13
140 0.16
141 0.19
142 0.21
143 0.22
144 0.25
145 0.26
146 0.27
147 0.28
148 0.26
149 0.25
150 0.26
151 0.23
152 0.19
153 0.19
154 0.17
155 0.12
156 0.11
157 0.12
158 0.11
159 0.11
160 0.16
161 0.16
162 0.17
163 0.18
164 0.19
165 0.18
166 0.18
167 0.19
168 0.15
169 0.14
170 0.13
171 0.13
172 0.12
173 0.11
174 0.14
175 0.14
176 0.16
177 0.18
178 0.19
179 0.24
180 0.28
181 0.37
182 0.44
183 0.53
184 0.57
185 0.61
186 0.61
187 0.57
188 0.56
189 0.46
190 0.35
191 0.27
192 0.2
193 0.14
194 0.12
195 0.1
196 0.08
197 0.09
198 0.09
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.1
205 0.15
206 0.17
207 0.22
208 0.28
209 0.28
210 0.34
211 0.35
212 0.33
213 0.3
214 0.36
215 0.36
216 0.4
217 0.41
218 0.36
219 0.35
220 0.35
221 0.31
222 0.24
223 0.22
224 0.12
225 0.11
226 0.11
227 0.14
228 0.16
229 0.18
230 0.19
231 0.22
232 0.22
233 0.25
234 0.27
235 0.25
236 0.26
237 0.3
238 0.33
239 0.29
240 0.33
241 0.35
242 0.36
243 0.42
244 0.49
245 0.5
246 0.49
247 0.5
248 0.51
249 0.51
250 0.49
251 0.48
252 0.46
253 0.42
254 0.38
255 0.41
256 0.34
257 0.32
258 0.29
259 0.27
260 0.22
261 0.22
262 0.25
263 0.24
264 0.26
265 0.24
266 0.25
267 0.23
268 0.19
269 0.18
270 0.17
271 0.15
272 0.15
273 0.2
274 0.21
275 0.2
276 0.21
277 0.21
278 0.18
279 0.15
280 0.14
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.07
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.08
295 0.08
296 0.12
297 0.14
298 0.15
299 0.16
300 0.17
301 0.17
302 0.18
303 0.21
304 0.21
305 0.19
306 0.18
307 0.18
308 0.23
309 0.27
310 0.27
311 0.29
312 0.26
313 0.27
314 0.26
315 0.26
316 0.24
317 0.25
318 0.26
319 0.21
320 0.22
321 0.21
322 0.24
323 0.24
324 0.2
325 0.19
326 0.17
327 0.16
328 0.15
329 0.14
330 0.12
331 0.11
332 0.13
333 0.1
334 0.15
335 0.15
336 0.15
337 0.15
338 0.16
339 0.17
340 0.17
341 0.17
342 0.12
343 0.13
344 0.14
345 0.14
346 0.13
347 0.12
348 0.14
349 0.12
350 0.13
351 0.11
352 0.11
353 0.1
354 0.11
355 0.11
356 0.08
357 0.07
358 0.06
359 0.1
360 0.1
361 0.1
362 0.1
363 0.1
364 0.1
365 0.11
366 0.11
367 0.08
368 0.09
369 0.17
370 0.17
371 0.17
372 0.19
373 0.2
374 0.21
375 0.26
376 0.29
377 0.28
378 0.28
379 0.28
380 0.28
381 0.3
382 0.28
383 0.26
384 0.27
385 0.23
386 0.23
387 0.22
388 0.2
389 0.18
390 0.18
391 0.2
392 0.17
393 0.19
394 0.21
395 0.26
396 0.27
397 0.28
398 0.32
399 0.3
400 0.32
401 0.32
402 0.28
403 0.23
404 0.25
405 0.27
406 0.25
407 0.23
408 0.19
409 0.22
410 0.27
411 0.31
412 0.37
413 0.42
414 0.47
415 0.52
416 0.6
417 0.61
418 0.62
419 0.67
420 0.69
421 0.68
422 0.68
423 0.7
424 0.71
425 0.73
426 0.72
427 0.65
428 0.6
429 0.6
430 0.6
431 0.57
432 0.52
433 0.44
434 0.38
435 0.36
436 0.31
437 0.3
438 0.26
439 0.24
440 0.23
441 0.28
442 0.32
443 0.33
444 0.36
445 0.33
446 0.35
447 0.37
448 0.37
449 0.33
450 0.32
451 0.37
452 0.4
453 0.46
454 0.42
455 0.44
456 0.49
457 0.5
458 0.55
459 0.59
460 0.6
461 0.56
462 0.62
463 0.6
464 0.56
465 0.63
466 0.65
467 0.64
468 0.65
469 0.64
470 0.64
471 0.65
472 0.67
473 0.67
474 0.68
475 0.69
476 0.72
477 0.77
478 0.78
479 0.82
480 0.83
481 0.82
482 0.83
483 0.82
484 0.83
485 0.84
486 0.85
487 0.86
488 0.81
489 0.81
490 0.73
491 0.68
492 0.62
493 0.56
494 0.49
495 0.47
496 0.46
497 0.38
498 0.41
499 0.43
500 0.42
501 0.43
502 0.48
503 0.5
504 0.5
505 0.53
506 0.51
507 0.5
508 0.54
509 0.52
510 0.49
511 0.46
512 0.44
513 0.44
514 0.47
515 0.45
516 0.4
517 0.42
518 0.41
519 0.44
520 0.52
521 0.54
522 0.54
523 0.51
524 0.5
525 0.45
526 0.42
527 0.4
528 0.33
529 0.31
530 0.27
531 0.27
532 0.24
533 0.22
534 0.21
535 0.14
536 0.13
537 0.09
538 0.07
539 0.07
540 0.07
541 0.07
542 0.07
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.06
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.05
551 0.06
552 0.06
553 0.06
554 0.07
555 0.1
556 0.11
557 0.14
558 0.17
559 0.25
560 0.35
561 0.41
562 0.49
563 0.54
564 0.63
565 0.67
566 0.69
567 0.71
568 0.69
569 0.68
570 0.66
571 0.66
572 0.61
573 0.53
574 0.52
575 0.5
576 0.43
577 0.39
578 0.36
579 0.33
580 0.3
581 0.32
582 0.36
583 0.35
584 0.41
585 0.48
586 0.53
587 0.55
588 0.58
589 0.63
590 0.6
591 0.59
592 0.58
593 0.6
594 0.55
595 0.52
596 0.52
597 0.46
598 0.42
599 0.37
600 0.31
601 0.21
602 0.18
603 0.14
604 0.1
605 0.08
606 0.07
607 0.08
608 0.08
609 0.09
610 0.1
611 0.1
612 0.09
613 0.1
614 0.11
615 0.09
616 0.09
617 0.1
618 0.13
619 0.16
620 0.22
621 0.24
622 0.28
623 0.3
624 0.33
625 0.37
626 0.37
627 0.36
628 0.31
629 0.28
630 0.25
631 0.24
632 0.22
633 0.17
634 0.13
635 0.1
636 0.1
637 0.09
638 0.09
639 0.07
640 0.09
641 0.11
642 0.11
643 0.13
644 0.14
645 0.15
646 0.15
647 0.16
648 0.15
649 0.13
650 0.16
651 0.15
652 0.15
653 0.14
654 0.13
655 0.15