FuNGI

H2ATX7

Protein Details

Accession

H2ATX7

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
29-55	NHISPFIKRDRYKRNFLRTRQNGKTGN	Hydrophilic
554-573	REKSPSKKTTIKKENSPSVR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
288-299	RARRGNSKRKTR
543-563	KVKKENSEEKEREKSPSKKTT

Subcellular Location(s)

nucl 22, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	kaf:KAFR_0D01800 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSAPRRNAINRPNGIGGQPASAGGGSGINHISPFIKRDRYKRNFLRTRQNGKTGNGVSVKKEDPDLIEAREKQLLGVESSTGAAKVKREKEEEFNEFPLRAIEKEQLENMRTHLLKFQSKKKLVPSESFHLPVRLHRKDTRNLQFQLTRAEIVQRQKEISEYKKKQEQEKLGVPGVATPATTTSVTAATTAPPQPNLLTPSTAASTATTTPNVDANSISDGATTSATPAPTSDNATPIVTKLEEAGISEHPEKVGLVKYDGKEDNELLGYEPGTTDPLYDVAPDGGGRARRGNSKRKTRQLKVLDENAKKLRFEEFYPWVMEDFDGYNTWVGSYEAGNSDSYVLLSVEDDGSFTMIPADKVYKFTARNKYATLTIEEAEKRMDRKSGEVPRWLMKHLDNIGTTTTRYDRTKRRLKTVADQRGVGGDEEEHDDNSENELDYDEEFADDEEAPIIDGNEQENKESEQRIKKEMLQANVLGLRDDKEFPEEDEDDLFNEKKIDEEGERIKKALQKTELAALYSSDDELNPYLSESDIEHSEEGKNKVKKENSEEKEREKSPSKKTTIKKENSPSVRNLAPQLRVKSIKDCIIVLKGTKKILKTFPEGEWNPEQSKKRQRDIDATDRNTNTTVKVEIKQEDEISPAKEISQENTKTSIPIITEQDIIDAVGDGKVNVKEFGKAIRRSYPGPENKKLMFQLVKKLCRKVDHEHMELKN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.45
3	0.37
4	0.28
5	0.24
6	0.19
7	0.16
8	0.14
9	0.13
10	0.09
11	0.09
12	0.08
13	0.1
14	0.11
15	0.1
16	0.11
17	0.11
18	0.13
19	0.13
20	0.17
21	0.22
22	0.32
23	0.38
24	0.48
25	0.59
26	0.65
27	0.74
28	0.8
29	0.84
30	0.84
31	0.86
32	0.87
33	0.87
34	0.89
35	0.86
36	0.85
37	0.8
38	0.72
39	0.73
40	0.63
41	0.6
42	0.56
43	0.5
44	0.45
45	0.44
46	0.43
47	0.35
48	0.35
49	0.3
50	0.26
51	0.3
52	0.29
53	0.28
54	0.34
55	0.34
56	0.35
57	0.36
58	0.33
59	0.27
60	0.29
61	0.26
62	0.21
63	0.2
64	0.18
65	0.15
66	0.16
67	0.16
68	0.12
69	0.12
70	0.12
71	0.16
72	0.24
73	0.31
74	0.37
75	0.42
76	0.46
77	0.53
78	0.6
79	0.62
80	0.58
81	0.56
82	0.51
83	0.46
84	0.42
85	0.36
86	0.3
87	0.23
88	0.22
89	0.22
90	0.23
91	0.26
92	0.3
93	0.32
94	0.31
95	0.31
96	0.3
97	0.32
98	0.29
99	0.28
100	0.29
101	0.3
102	0.37
103	0.43
104	0.51
105	0.54
106	0.58
107	0.62
108	0.66
109	0.69
110	0.66
111	0.67
112	0.64
113	0.6
114	0.6
115	0.59
116	0.5
117	0.44
118	0.4
119	0.4
120	0.43
121	0.42
122	0.44
123	0.49
124	0.54
125	0.59
126	0.69
127	0.71
128	0.7
129	0.67
130	0.67
131	0.63
132	0.58
133	0.55
134	0.46
135	0.37
136	0.29
137	0.31
138	0.29
139	0.33
140	0.37
141	0.32
142	0.32
143	0.31
144	0.35
145	0.37
146	0.41
147	0.45
148	0.45
149	0.51
150	0.57
151	0.62
152	0.66
153	0.69
154	0.68
155	0.65
156	0.67
157	0.64
158	0.59
159	0.55
160	0.46
161	0.38
162	0.31
163	0.22
164	0.15
165	0.1
166	0.09
167	0.11
168	0.11
169	0.09
170	0.09
171	0.09
172	0.1
173	0.1
174	0.1
175	0.09
176	0.12
177	0.15
178	0.16
179	0.16
180	0.16
181	0.16
182	0.19
183	0.21
184	0.19
185	0.17
186	0.16
187	0.17
188	0.17
189	0.17
190	0.14
191	0.11
192	0.11
193	0.12
194	0.14
195	0.13
196	0.12
197	0.13
198	0.15
199	0.15
200	0.14
201	0.12
202	0.11
203	0.13
204	0.13
205	0.12
206	0.09
207	0.09
208	0.09
209	0.1
210	0.08
211	0.08
212	0.09
213	0.09
214	0.09
215	0.09
216	0.12
217	0.12
218	0.17
219	0.15
220	0.15
221	0.17
222	0.17
223	0.17
224	0.14
225	0.15
226	0.11
227	0.1
228	0.09
229	0.09
230	0.08
231	0.09
232	0.1
233	0.09
234	0.13
235	0.14
236	0.13
237	0.12
238	0.12
239	0.12
240	0.11
241	0.13
242	0.11
243	0.13
244	0.18
245	0.18
246	0.24
247	0.26
248	0.25
249	0.24
250	0.23
251	0.21
252	0.17
253	0.17
254	0.12
255	0.11
256	0.1
257	0.08
258	0.08
259	0.06
260	0.07
261	0.07
262	0.06
263	0.06
264	0.06
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.06
269	0.06
270	0.05
271	0.06
272	0.07
273	0.09
274	0.1
275	0.12
276	0.14
277	0.23
278	0.29
279	0.39
280	0.46
281	0.56
282	0.64
283	0.71
284	0.79
285	0.76
286	0.8
287	0.78
288	0.77
289	0.72
290	0.72
291	0.71
292	0.63
293	0.63
294	0.58
295	0.51
296	0.42
297	0.37
298	0.31
299	0.24
300	0.25
301	0.25
302	0.24
303	0.24
304	0.25
305	0.24
306	0.21
307	0.19
308	0.17
309	0.12
310	0.09
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.06
316	0.07
317	0.06
318	0.05
319	0.05
320	0.05
321	0.06
322	0.06
323	0.08
324	0.08
325	0.07
326	0.08
327	0.07
328	0.07
329	0.06
330	0.05
331	0.04
332	0.04
333	0.05
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.08
346	0.08
347	0.1
348	0.12
349	0.15
350	0.19
351	0.26
352	0.35
353	0.37
354	0.38
355	0.38
356	0.38
357	0.36
358	0.34
359	0.28
360	0.2
361	0.16
362	0.18
363	0.17
364	0.16
365	0.14
366	0.14
367	0.13
368	0.13
369	0.15
370	0.13
371	0.16
372	0.24
373	0.31
374	0.33
375	0.37
376	0.38
377	0.4
378	0.41
379	0.38
380	0.32
381	0.24
382	0.27
383	0.25
384	0.25
385	0.2
386	0.2
387	0.2
388	0.19
389	0.18
390	0.14
391	0.13
392	0.15
393	0.17
394	0.23
395	0.31
396	0.4
397	0.49
398	0.51
399	0.58
400	0.62
401	0.63
402	0.67
403	0.69
404	0.69
405	0.62
406	0.58
407	0.49
408	0.43
409	0.4
410	0.3
411	0.19
412	0.09
413	0.08
414	0.1
415	0.11
416	0.09
417	0.09
418	0.09
419	0.09
420	0.11
421	0.1
422	0.07
423	0.07
424	0.07
425	0.08
426	0.07
427	0.08
428	0.06
429	0.06
430	0.06
431	0.06
432	0.07
433	0.06
434	0.06
435	0.05
436	0.05
437	0.05
438	0.05
439	0.05
440	0.04
441	0.05
442	0.06
443	0.1
444	0.11
445	0.11
446	0.12
447	0.14
448	0.16
449	0.19
450	0.25
451	0.28
452	0.31
453	0.34
454	0.36
455	0.37
456	0.44
457	0.46
458	0.42
459	0.36
460	0.34
461	0.32
462	0.32
463	0.28
464	0.19
465	0.15
466	0.14
467	0.13
468	0.14
469	0.12
470	0.12
471	0.13
472	0.14
473	0.19
474	0.18
475	0.17
476	0.18
477	0.17
478	0.16
479	0.18
480	0.17
481	0.12
482	0.12
483	0.11
484	0.09
485	0.1
486	0.12
487	0.11
488	0.16
489	0.24
490	0.31
491	0.31
492	0.31
493	0.33
494	0.35
495	0.37
496	0.39
497	0.34
498	0.3
499	0.32
500	0.37
501	0.36
502	0.32
503	0.29
504	0.22
505	0.19
506	0.16
507	0.15
508	0.09
509	0.08
510	0.09
511	0.09
512	0.1
513	0.08
514	0.08
515	0.08
516	0.08
517	0.09
518	0.08
519	0.1
520	0.1
521	0.12
522	0.11
523	0.12
524	0.15
525	0.19
526	0.23
527	0.29
528	0.32
529	0.35
530	0.43
531	0.47
532	0.51
533	0.56
534	0.62
535	0.59
536	0.66
537	0.68
538	0.67
539	0.69
540	0.64
541	0.62
542	0.6
543	0.63
544	0.62
545	0.66
546	0.66
547	0.67
548	0.73
549	0.77
550	0.78
551	0.78
552	0.78
553	0.77
554	0.81
555	0.8
556	0.76
557	0.69
558	0.64
559	0.59
560	0.51
561	0.48
562	0.43
563	0.42
564	0.45
565	0.44
566	0.46
567	0.48
568	0.48
569	0.47
570	0.47
571	0.45
572	0.4
573	0.37
574	0.33
575	0.33
576	0.33
577	0.3
578	0.32
579	0.3
580	0.33
581	0.36
582	0.36
583	0.38
584	0.44
585	0.46
586	0.47
587	0.48
588	0.46
589	0.52
590	0.51
591	0.5
592	0.49
593	0.48
594	0.44
595	0.47
596	0.49
597	0.48
598	0.57
599	0.59
600	0.63
601	0.66
602	0.68
603	0.71
604	0.75
605	0.77
606	0.76
607	0.74
608	0.73
609	0.65
610	0.61
611	0.53
612	0.45
613	0.36
614	0.29
615	0.27
616	0.24
617	0.27
618	0.31
619	0.32
620	0.34
621	0.36
622	0.35
623	0.32
624	0.31
625	0.29
626	0.26
627	0.24
628	0.21
629	0.18
630	0.21
631	0.21
632	0.22
633	0.29
634	0.3
635	0.31
636	0.35
637	0.35
638	0.31
639	0.31
640	0.29
641	0.21
642	0.23
643	0.25
644	0.24
645	0.25
646	0.24
647	0.24
648	0.21
649	0.19
650	0.14
651	0.1
652	0.08
653	0.08
654	0.08
655	0.07
656	0.11
657	0.13
658	0.14
659	0.16
660	0.17
661	0.18
662	0.19
663	0.29
664	0.34
665	0.37
666	0.41
667	0.46
668	0.5
669	0.5
670	0.56
671	0.58
672	0.59
673	0.63
674	0.66
675	0.65
676	0.63
677	0.67
678	0.61
679	0.59
680	0.56
681	0.52
682	0.55
683	0.57
684	0.65
685	0.65
686	0.7
687	0.68
688	0.67
689	0.69
690	0.68
691	0.69
692	0.68
693	0.68

H2ATX7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer