FuNGI

A0A1E5S1T3

Protein Details

Accession

A0A1E5S1T3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
50-77	QSWRVRFQEKKVKDKKLAKQERKAEPVQ	Hydrophilic
441-464	WMLKQGEYKQKKIQEKRRAMAEEI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
59-72	KKVKDKKLAKQERK

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 13.333, cyto 7, cyto_pero 4.833

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MDMMGDIVERDPLESFADIEIKENDVSPSFSDATNNSTGFPVLSDKKTLQSWRVRFQEKKVKDKKLAKQERKAEPVQEEKKNFDNEDMSEAERIHLENINLMMSMSSEQIENERQEIMDNMSPKVLEKLIKRFSSTGSRSKNKDEDTSLPLFTDIDTNKYWVGGTNTMTDLPKLDDNKVNDILNIKNNDKXDKRKIRFEEPEVIEIEEEXNIEYPEVENEDDFVTDDYQLLQKMKDTDSKELLKDVHFVTKKQMEEYEPLSIDDAEFEKKLKEKYFPDLPTEVDKMRWMEPIDDDSNITNNKVIDTVADLRFDFKGNLCAPQKEVDSTKDGLHHHADNPDLKGYTLEELQNYALSTYPGQKCIALQTLGRIMYKVKAERYYQLIPEIDQEQFEKLNGDITPIIEQIYGMLWAWIKHLKIVEIIESNLGNKNMSIKNYATEAMWMLKQGEYKQKKIQEKRRAMAEEI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.13
3	0.13
4	0.17
5	0.16
6	0.18
7	0.18
8	0.18
9	0.18
10	0.18
11	0.18
12	0.16
13	0.18
14	0.16
15	0.2
16	0.19
17	0.19
18	0.2
19	0.19
20	0.23
21	0.26
22	0.25
23	0.21
24	0.2
25	0.2
26	0.18
27	0.18
28	0.19
29	0.21
30	0.22
31	0.26
32	0.26
33	0.3
34	0.36
35	0.4
36	0.42
37	0.46
38	0.51
39	0.57
40	0.64
41	0.69
42	0.67
43	0.73
44	0.75
45	0.73
46	0.77
47	0.78
48	0.78
49	0.8
50	0.85
51	0.85
52	0.85
53	0.88
54	0.87
55	0.88
56	0.88
57	0.87
58	0.84
59	0.79
60	0.73
61	0.68
62	0.69
63	0.67
64	0.66
65	0.6
66	0.56
67	0.59
68	0.58
69	0.52
70	0.45
71	0.4
72	0.32
73	0.33
74	0.31
75	0.25
76	0.22
77	0.22
78	0.19
79	0.16
80	0.15
81	0.13
82	0.14
83	0.13
84	0.13
85	0.14
86	0.13
87	0.12
88	0.12
89	0.1
90	0.08
91	0.08
92	0.07
93	0.07
94	0.06
95	0.07
96	0.1
97	0.13
98	0.14
99	0.14
100	0.14
101	0.13
102	0.14
103	0.15
104	0.16
105	0.16
106	0.16
107	0.16
108	0.16
109	0.16
110	0.16
111	0.17
112	0.15
113	0.17
114	0.2
115	0.29
116	0.36
117	0.38
118	0.39
119	0.38
120	0.4
121	0.45
122	0.45
123	0.45
124	0.47
125	0.52
126	0.53
127	0.58
128	0.61
129	0.55
130	0.54
131	0.5
132	0.45
133	0.44
134	0.44
135	0.37
136	0.3
137	0.27
138	0.23
139	0.18
140	0.19
141	0.13
142	0.14
143	0.14
144	0.15
145	0.15
146	0.15
147	0.15
148	0.12
149	0.15
150	0.14
151	0.15
152	0.16
153	0.16
154	0.18
155	0.18
156	0.16
157	0.13
158	0.13
159	0.15
160	0.15
161	0.17
162	0.2
163	0.22
164	0.27
165	0.29
166	0.27
167	0.24
168	0.24
169	0.24
170	0.24
171	0.26
172	0.22
173	0.24
174	0.29
175	0.35
176	0.39
177	0.45
178	0.49
179	0.54
180	0.61
181	0.62
182	0.64
183	0.66
184	0.65
185	0.67
186	0.6
187	0.53
188	0.46
189	0.41
190	0.33
191	0.24
192	0.2
193	0.1
194	0.07
195	0.05
196	0.05
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.04
201	0.05
202	0.05
203	0.05
204	0.05
205	0.06
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.06
211	0.06
212	0.06
213	0.06
214	0.07
215	0.08
216	0.07
217	0.08
218	0.1
219	0.12
220	0.17
221	0.19
222	0.21
223	0.26
224	0.28
225	0.27
226	0.27
227	0.26
228	0.21
229	0.21
230	0.18
231	0.21
232	0.2
233	0.2
234	0.23
235	0.27
236	0.27
237	0.26
238	0.27
239	0.21
240	0.23
241	0.24
242	0.22
243	0.18
244	0.17
245	0.17
246	0.15
247	0.12
248	0.11
249	0.1
250	0.08
251	0.08
252	0.08
253	0.09
254	0.12
255	0.16
256	0.17
257	0.22
258	0.24
259	0.3
260	0.38
261	0.39
262	0.4
263	0.38
264	0.37
265	0.35
266	0.35
267	0.29
268	0.21
269	0.21
270	0.19
271	0.19
272	0.2
273	0.17
274	0.16
275	0.17
276	0.21
277	0.2
278	0.18
279	0.18
280	0.15
281	0.18
282	0.17
283	0.16
284	0.12
285	0.11
286	0.11
287	0.11
288	0.1
289	0.07
290	0.1
291	0.15
292	0.15
293	0.16
294	0.16
295	0.17
296	0.18
297	0.18
298	0.16
299	0.11
300	0.17
301	0.16
302	0.23
303	0.24
304	0.25
305	0.26
306	0.28
307	0.28
308	0.25
309	0.26
310	0.22
311	0.24
312	0.24
313	0.24
314	0.25
315	0.25
316	0.26
317	0.27
318	0.27
319	0.25
320	0.26
321	0.27
322	0.26
323	0.26
324	0.25
325	0.22
326	0.2
327	0.18
328	0.17
329	0.15
330	0.15
331	0.14
332	0.12
333	0.14
334	0.14
335	0.14
336	0.13
337	0.11
338	0.09
339	0.09
340	0.1
341	0.17
342	0.19
343	0.2
344	0.21
345	0.21
346	0.21
347	0.25
348	0.27
349	0.21
350	0.19
351	0.2
352	0.24
353	0.26
354	0.25
355	0.21
356	0.18
357	0.21
358	0.26
359	0.27
360	0.28
361	0.31
362	0.34
363	0.38
364	0.43
365	0.43
366	0.39
367	0.4
368	0.35
369	0.31
370	0.31
371	0.29
372	0.23
373	0.2
374	0.19
375	0.16
376	0.16
377	0.16
378	0.14
379	0.11
380	0.15
381	0.13
382	0.15
383	0.14
384	0.15
385	0.16
386	0.15
387	0.16
388	0.12
389	0.12
390	0.09
391	0.09
392	0.09
393	0.07
394	0.08
395	0.08
396	0.08
397	0.12
398	0.15
399	0.15
400	0.17
401	0.19
402	0.19
403	0.21
404	0.23
405	0.24
406	0.22
407	0.23
408	0.22
409	0.21
410	0.22
411	0.23
412	0.22
413	0.17
414	0.16
415	0.22
416	0.24
417	0.26
418	0.29
419	0.26
420	0.28
421	0.3
422	0.3
423	0.23
424	0.21
425	0.21
426	0.19
427	0.19
428	0.18
429	0.17
430	0.18
431	0.21
432	0.25
433	0.34
434	0.37
435	0.43
436	0.51
437	0.59
438	0.67
439	0.75
440	0.8
441	0.8
442	0.84
443	0.84
444	0.85

A0A1E5S1T3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer