Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E5RQS8

Protein Details
Accession A0A1E5RQS8    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-70VTNTLVKENSKKKYKFKFQDKLYTMYHydrophilic
314-351LLLKDKRIIKCKVKLKNKKTGKIRRKFRYRQVCESYKLHydrophilic
354-375CYMGPQCKFKHIRCRLCPKYLLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
321-342RIIKCKVKLKNKKTGKIRRKFR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 7, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045348  CPSF4/Yth1  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0098789  P:pre-mRNA cleavage required for polyadenylation  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MQTPSMNMPMMGQPLFPMMPMQGKVSKVTHIVQKPLSKKKLYNKVTNTLVKENSKKKYKFKFQDKLYTMYNFDPRVDIRACPFYNYKRPERHDPDWFLGNKGTNTEENAAKVSDANAANTNGEYGLNSVCPFGKHISGKSFNKLVCAHWLKGLCKKNDQCEYLHEFNLRKMPECSHYQEHGTCTGLLIGNEDSQIKRFYEADEKLDSLIKEDMTEEEKQEIIDKITEEKMLLAKNQIKRRKECLSQHMDKDNGYLISPYLGTAGGESSLGIGAQKDLSPELDFILSNKASGDYVINDRILNNYPALEEDXKMVQLLLKDKRIIKCKVKLKNKKTGKIRRKFRYRQVCESYKLGFCYMGPQCKFKHIRCRLCPKYLLGFCGQGDACKEGEHIGLLNFPIVKEKLRIKPDSDLLGKKSDAKEQARLLALINDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.16
4 0.14
5 0.12
6 0.16
7 0.18
8 0.22
9 0.23
10 0.24
11 0.29
12 0.29
13 0.31
14 0.3
15 0.33
16 0.38
17 0.38
18 0.43
19 0.46
20 0.52
21 0.58
22 0.65
23 0.68
24 0.66
25 0.69
26 0.73
27 0.77
28 0.78
29 0.79
30 0.76
31 0.76
32 0.78
33 0.77
34 0.72
35 0.68
36 0.66
37 0.63
38 0.65
39 0.65
40 0.66
41 0.69
42 0.71
43 0.74
44 0.79
45 0.82
46 0.84
47 0.86
48 0.87
49 0.85
50 0.89
51 0.83
52 0.77
53 0.7
54 0.62
55 0.54
56 0.49
57 0.46
58 0.37
59 0.33
60 0.31
61 0.28
62 0.3
63 0.29
64 0.25
65 0.24
66 0.31
67 0.31
68 0.32
69 0.37
70 0.39
71 0.47
72 0.53
73 0.57
74 0.58
75 0.64
76 0.71
77 0.74
78 0.73
79 0.73
80 0.72
81 0.67
82 0.65
83 0.59
84 0.51
85 0.45
86 0.41
87 0.32
88 0.27
89 0.26
90 0.2
91 0.22
92 0.23
93 0.21
94 0.19
95 0.2
96 0.18
97 0.16
98 0.15
99 0.13
100 0.16
101 0.15
102 0.15
103 0.17
104 0.17
105 0.17
106 0.17
107 0.16
108 0.1
109 0.1
110 0.08
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.09
118 0.11
119 0.12
120 0.17
121 0.19
122 0.21
123 0.28
124 0.36
125 0.38
126 0.41
127 0.44
128 0.38
129 0.4
130 0.38
131 0.32
132 0.33
133 0.35
134 0.32
135 0.31
136 0.35
137 0.33
138 0.4
139 0.46
140 0.39
141 0.44
142 0.47
143 0.51
144 0.54
145 0.54
146 0.47
147 0.46
148 0.51
149 0.45
150 0.43
151 0.38
152 0.31
153 0.32
154 0.36
155 0.3
156 0.24
157 0.22
158 0.23
159 0.23
160 0.27
161 0.3
162 0.3
163 0.31
164 0.32
165 0.32
166 0.31
167 0.29
168 0.25
169 0.19
170 0.15
171 0.14
172 0.12
173 0.1
174 0.1
175 0.09
176 0.08
177 0.09
178 0.1
179 0.08
180 0.09
181 0.11
182 0.09
183 0.1
184 0.1
185 0.12
186 0.19
187 0.2
188 0.22
189 0.22
190 0.22
191 0.21
192 0.23
193 0.2
194 0.14
195 0.14
196 0.11
197 0.09
198 0.1
199 0.1
200 0.11
201 0.12
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.11
207 0.11
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.1
212 0.11
213 0.11
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.14
220 0.19
221 0.25
222 0.34
223 0.41
224 0.44
225 0.48
226 0.55
227 0.56
228 0.59
229 0.6
230 0.61
231 0.63
232 0.63
233 0.63
234 0.61
235 0.55
236 0.47
237 0.41
238 0.33
239 0.24
240 0.18
241 0.13
242 0.09
243 0.08
244 0.08
245 0.07
246 0.06
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.05
261 0.05
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.08
266 0.08
267 0.09
268 0.09
269 0.08
270 0.09
271 0.14
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.11
276 0.1
277 0.11
278 0.11
279 0.08
280 0.12
281 0.14
282 0.14
283 0.14
284 0.14
285 0.16
286 0.18
287 0.16
288 0.14
289 0.12
290 0.12
291 0.13
292 0.16
293 0.14
294 0.11
295 0.12
296 0.13
297 0.13
298 0.12
299 0.11
300 0.1
301 0.17
302 0.2
303 0.22
304 0.25
305 0.31
306 0.37
307 0.45
308 0.52
309 0.53
310 0.58
311 0.64
312 0.7
313 0.75
314 0.8
315 0.81
316 0.84
317 0.85
318 0.85
319 0.87
320 0.88
321 0.88
322 0.87
323 0.9
324 0.89
325 0.91
326 0.91
327 0.9
328 0.91
329 0.88
330 0.88
331 0.87
332 0.82
333 0.75
334 0.7
335 0.63
336 0.55
337 0.48
338 0.39
339 0.3
340 0.23
341 0.28
342 0.29
343 0.34
344 0.33
345 0.36
346 0.36
347 0.46
348 0.54
349 0.52
350 0.58
351 0.59
352 0.68
353 0.74
354 0.84
355 0.81
356 0.81
357 0.79
358 0.73
359 0.73
360 0.65
361 0.59
362 0.5
363 0.46
364 0.38
365 0.4
366 0.34
367 0.25
368 0.25
369 0.23
370 0.2
371 0.17
372 0.18
373 0.13
374 0.14
375 0.13
376 0.12
377 0.1
378 0.12
379 0.12
380 0.13
381 0.12
382 0.12
383 0.17
384 0.17
385 0.19
386 0.23
387 0.32
388 0.38
389 0.46
390 0.51
391 0.49
392 0.56
393 0.59
394 0.61
395 0.59
396 0.57
397 0.52
398 0.52
399 0.49
400 0.48
401 0.46
402 0.46
403 0.48
404 0.47
405 0.51
406 0.5
407 0.55
408 0.51
409 0.49
410 0.42