Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2AZT1

Protein Details
Accession H2AZT1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
178-203ITNTTPSIKKPRKPRQPRKSITQTNTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
186-196KKPRKPRQPRK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020998  Med3  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG kaf:KAFR_0I01000  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11593  Med3  
Amino Acid Sequences MQTPLSISEVLTLTVKLEELETKFATNENSKQSVLDLVNETRSLILPIRLQLNEFISLMANIDKMTETSNIDKYNHIRKSLLTLQNNIQTLSQNFVKLNPLFNTIPEYSTKHNSREFKPLESLSNDPFAKGSPRTTSSGSANNTITSATSITTNANNKISAATPSSNINTPASSSQNITNTTPSIKKPRKPRQPRKSITQTNTANKASKTTTPSAPTPVAAPMQTPGTMNPALPVQNFNTKTPINLGSPNGPQFSPPPQQGQINFNDITPANILNMNQSRSIPNNNNNANNEMFGNLDLSNLDLNNLNMDFI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.09
4 0.1
5 0.14
6 0.15
7 0.2
8 0.2
9 0.2
10 0.2
11 0.22
12 0.25
13 0.26
14 0.3
15 0.32
16 0.34
17 0.34
18 0.34
19 0.33
20 0.34
21 0.29
22 0.27
23 0.24
24 0.23
25 0.25
26 0.25
27 0.24
28 0.19
29 0.18
30 0.17
31 0.14
32 0.16
33 0.16
34 0.18
35 0.23
36 0.22
37 0.23
38 0.23
39 0.24
40 0.23
41 0.2
42 0.18
43 0.14
44 0.13
45 0.13
46 0.11
47 0.09
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.07
52 0.09
53 0.1
54 0.12
55 0.16
56 0.2
57 0.23
58 0.24
59 0.27
60 0.31
61 0.39
62 0.4
63 0.38
64 0.35
65 0.33
66 0.4
67 0.45
68 0.48
69 0.42
70 0.41
71 0.43
72 0.48
73 0.48
74 0.4
75 0.31
76 0.25
77 0.23
78 0.23
79 0.2
80 0.17
81 0.16
82 0.17
83 0.22
84 0.21
85 0.24
86 0.21
87 0.25
88 0.23
89 0.24
90 0.28
91 0.22
92 0.23
93 0.21
94 0.22
95 0.2
96 0.28
97 0.31
98 0.3
99 0.36
100 0.41
101 0.42
102 0.49
103 0.48
104 0.43
105 0.44
106 0.41
107 0.38
108 0.35
109 0.34
110 0.26
111 0.29
112 0.26
113 0.22
114 0.21
115 0.18
116 0.18
117 0.17
118 0.18
119 0.15
120 0.18
121 0.21
122 0.23
123 0.25
124 0.24
125 0.29
126 0.28
127 0.27
128 0.25
129 0.22
130 0.2
131 0.18
132 0.15
133 0.1
134 0.08
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.1
140 0.12
141 0.14
142 0.14
143 0.14
144 0.14
145 0.14
146 0.13
147 0.12
148 0.12
149 0.11
150 0.11
151 0.12
152 0.13
153 0.14
154 0.14
155 0.14
156 0.11
157 0.12
158 0.13
159 0.14
160 0.13
161 0.14
162 0.15
163 0.18
164 0.2
165 0.19
166 0.18
167 0.17
168 0.19
169 0.2
170 0.21
171 0.28
172 0.33
173 0.38
174 0.48
175 0.58
176 0.67
177 0.76
178 0.84
179 0.84
180 0.89
181 0.89
182 0.88
183 0.88
184 0.86
185 0.78
186 0.77
187 0.73
188 0.68
189 0.68
190 0.61
191 0.53
192 0.43
193 0.43
194 0.35
195 0.33
196 0.32
197 0.3
198 0.31
199 0.32
200 0.34
201 0.35
202 0.33
203 0.29
204 0.25
205 0.23
206 0.2
207 0.16
208 0.15
209 0.12
210 0.12
211 0.12
212 0.12
213 0.1
214 0.13
215 0.14
216 0.13
217 0.13
218 0.13
219 0.14
220 0.15
221 0.17
222 0.15
223 0.23
224 0.26
225 0.26
226 0.29
227 0.28
228 0.28
229 0.3
230 0.3
231 0.24
232 0.25
233 0.26
234 0.26
235 0.3
236 0.32
237 0.3
238 0.27
239 0.25
240 0.25
241 0.29
242 0.31
243 0.29
244 0.32
245 0.33
246 0.39
247 0.41
248 0.43
249 0.4
250 0.39
251 0.36
252 0.31
253 0.31
254 0.26
255 0.24
256 0.2
257 0.17
258 0.13
259 0.14
260 0.14
261 0.19
262 0.24
263 0.24
264 0.24
265 0.25
266 0.28
267 0.3
268 0.39
269 0.39
270 0.43
271 0.51
272 0.56
273 0.61
274 0.6
275 0.6
276 0.52
277 0.45
278 0.38
279 0.29
280 0.23
281 0.16
282 0.15
283 0.11
284 0.11
285 0.09
286 0.1
287 0.11
288 0.1
289 0.11
290 0.1
291 0.11
292 0.14