Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E5S0K1

Protein Details
Accession A0A1E5S0K1    Localization Confidence High Confidence Score 22.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MSGKKEKPAAKPKKVIPGFTHydrophilic
31-59LKEAPKKTFNEARKEKKRLLQNNKKFSGNHydrophilic
486-511QGQYVNKKKTYSKTNKQGNKKGETNSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-14KKEKPAAKPKK
42-48ARKEKKR
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
Amino Acid Sequences MSGKKEKPAAKPKKVIPGFTPVVEGTSHTSLKEAPKKTFNEARKEKKRLLQNNKKFSGNSNNFKTDSEVTGNRDLKERKLVKWSANEDESNNDLYQSLEDLSVTHEKFDQFEANRKQFQIESNYDESFYNVQIDKNNQDYKKKMDAAIKLESEILKDPSMNLKTGNQHIDEERGLVDMKEDVDEESKYSQVVLNEKYPEPIVTTPSPILKKTFSGAQLLKSIQKPQSPISPSGIGRDISPGNDVNFNKSTVLKPRNGKKIISKLHLKGKDETVKELQAFSKSFQIPERLNKSSKVELQDSKSFFDSELNPIALSSDLTVETSKDYKIFDYFKNIPHDKSIPKSFASQVVFNNQSTKKYKQILNNSSYFKRRLSKYKSSFYQPYPNMDGHPSFFAPMNAVPRNGSFSMNAAPPQMVQMPMFLPPQASMPDQSPNSQLNSRSGSFNMTPQFNAQAGMYMPPVNYYVQMPMMPMPVMMGNAPSPNKKFQGQYVNKKKTYSKTNKQGNKKGETNSSSRENKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.75
3 0.67
4 0.66
5 0.59
6 0.5
7 0.47
8 0.35
9 0.32
10 0.27
11 0.25
12 0.21
13 0.23
14 0.22
15 0.19
16 0.2
17 0.23
18 0.32
19 0.4
20 0.4
21 0.41
22 0.49
23 0.53
24 0.6
25 0.65
26 0.63
27 0.65
28 0.71
29 0.75
30 0.78
31 0.82
32 0.81
33 0.8
34 0.83
35 0.82
36 0.84
37 0.84
38 0.84
39 0.87
40 0.84
41 0.8
42 0.7
43 0.66
44 0.66
45 0.64
46 0.63
47 0.59
48 0.6
49 0.57
50 0.57
51 0.55
52 0.46
53 0.41
54 0.37
55 0.34
56 0.33
57 0.42
58 0.44
59 0.4
60 0.46
61 0.44
62 0.42
63 0.48
64 0.48
65 0.43
66 0.49
67 0.53
68 0.52
69 0.59
70 0.6
71 0.57
72 0.57
73 0.55
74 0.46
75 0.45
76 0.41
77 0.35
78 0.29
79 0.22
80 0.17
81 0.16
82 0.15
83 0.12
84 0.11
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.12
89 0.18
90 0.17
91 0.17
92 0.18
93 0.19
94 0.2
95 0.22
96 0.25
97 0.21
98 0.31
99 0.39
100 0.43
101 0.46
102 0.46
103 0.45
104 0.4
105 0.43
106 0.41
107 0.36
108 0.36
109 0.36
110 0.36
111 0.35
112 0.33
113 0.3
114 0.23
115 0.2
116 0.17
117 0.15
118 0.16
119 0.18
120 0.22
121 0.23
122 0.29
123 0.36
124 0.35
125 0.41
126 0.43
127 0.46
128 0.51
129 0.5
130 0.48
131 0.47
132 0.5
133 0.49
134 0.51
135 0.45
136 0.37
137 0.36
138 0.31
139 0.26
140 0.22
141 0.19
142 0.14
143 0.13
144 0.14
145 0.2
146 0.21
147 0.2
148 0.19
149 0.21
150 0.25
151 0.3
152 0.32
153 0.26
154 0.26
155 0.26
156 0.28
157 0.24
158 0.2
159 0.16
160 0.13
161 0.12
162 0.1
163 0.1
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.09
170 0.09
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.09
175 0.09
176 0.1
177 0.11
178 0.15
179 0.16
180 0.19
181 0.22
182 0.22
183 0.23
184 0.21
185 0.2
186 0.18
187 0.16
188 0.17
189 0.15
190 0.17
191 0.17
192 0.21
193 0.22
194 0.21
195 0.22
196 0.19
197 0.19
198 0.18
199 0.21
200 0.18
201 0.22
202 0.22
203 0.22
204 0.24
205 0.24
206 0.27
207 0.24
208 0.28
209 0.25
210 0.27
211 0.27
212 0.26
213 0.32
214 0.31
215 0.32
216 0.3
217 0.31
218 0.29
219 0.29
220 0.29
221 0.22
222 0.19
223 0.19
224 0.16
225 0.12
226 0.14
227 0.12
228 0.11
229 0.17
230 0.17
231 0.18
232 0.19
233 0.19
234 0.18
235 0.19
236 0.2
237 0.23
238 0.27
239 0.28
240 0.34
241 0.41
242 0.5
243 0.51
244 0.51
245 0.5
246 0.55
247 0.55
248 0.54
249 0.53
250 0.48
251 0.54
252 0.57
253 0.52
254 0.45
255 0.46
256 0.47
257 0.41
258 0.4
259 0.34
260 0.31
261 0.29
262 0.28
263 0.22
264 0.19
265 0.19
266 0.16
267 0.2
268 0.19
269 0.2
270 0.2
271 0.24
272 0.23
273 0.3
274 0.36
275 0.33
276 0.34
277 0.35
278 0.37
279 0.37
280 0.38
281 0.35
282 0.33
283 0.33
284 0.37
285 0.41
286 0.38
287 0.35
288 0.32
289 0.28
290 0.24
291 0.22
292 0.19
293 0.16
294 0.17
295 0.16
296 0.15
297 0.14
298 0.14
299 0.11
300 0.1
301 0.07
302 0.05
303 0.05
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.08
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.1
312 0.1
313 0.14
314 0.18
315 0.17
316 0.24
317 0.27
318 0.32
319 0.4
320 0.4
321 0.37
322 0.38
323 0.41
324 0.37
325 0.41
326 0.4
327 0.34
328 0.34
329 0.36
330 0.33
331 0.35
332 0.34
333 0.3
334 0.26
335 0.3
336 0.32
337 0.29
338 0.34
339 0.29
340 0.32
341 0.35
342 0.37
343 0.37
344 0.41
345 0.47
346 0.49
347 0.59
348 0.61
349 0.62
350 0.64
351 0.62
352 0.6
353 0.59
354 0.53
355 0.47
356 0.45
357 0.45
358 0.49
359 0.53
360 0.6
361 0.63
362 0.7
363 0.7
364 0.71
365 0.72
366 0.66
367 0.68
368 0.59
369 0.57
370 0.52
371 0.48
372 0.42
373 0.39
374 0.35
375 0.27
376 0.27
377 0.21
378 0.18
379 0.18
380 0.16
381 0.15
382 0.16
383 0.21
384 0.2
385 0.2
386 0.2
387 0.2
388 0.25
389 0.24
390 0.23
391 0.17
392 0.17
393 0.2
394 0.21
395 0.21
396 0.17
397 0.16
398 0.14
399 0.16
400 0.16
401 0.13
402 0.12
403 0.13
404 0.12
405 0.15
406 0.15
407 0.13
408 0.12
409 0.11
410 0.13
411 0.14
412 0.15
413 0.14
414 0.15
415 0.22
416 0.23
417 0.24
418 0.26
419 0.26
420 0.29
421 0.31
422 0.32
423 0.3
424 0.34
425 0.34
426 0.32
427 0.3
428 0.32
429 0.29
430 0.33
431 0.33
432 0.29
433 0.28
434 0.28
435 0.31
436 0.25
437 0.25
438 0.19
439 0.16
440 0.15
441 0.16
442 0.15
443 0.13
444 0.13
445 0.13
446 0.14
447 0.13
448 0.13
449 0.13
450 0.14
451 0.14
452 0.15
453 0.15
454 0.15
455 0.16
456 0.15
457 0.14
458 0.12
459 0.11
460 0.12
461 0.1
462 0.1
463 0.1
464 0.15
465 0.19
466 0.24
467 0.27
468 0.32
469 0.36
470 0.39
471 0.41
472 0.44
473 0.52
474 0.56
475 0.64
476 0.7
477 0.76
478 0.75
479 0.76
480 0.76
481 0.73
482 0.74
483 0.74
484 0.74
485 0.74
486 0.82
487 0.87
488 0.9
489 0.91
490 0.88
491 0.86
492 0.82
493 0.78
494 0.77
495 0.73
496 0.68
497 0.65
498 0.65