Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2ATI1

Protein Details
Accession H2ATI1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
90-129NGSNNGRKTNNKPNNKSNNNSQRRKKQQQPIKKQHQSDSTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG kaf:KAFR_0D00340  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
CDD cd07323  LAM  
Amino Acid Sequences MSVVTENTQPAVQEQKEEKKPITLTPAPLPTNSPWKTVNTEIPVTSISIKDLDSSKKKVRAPSPFIKTTASTKWAPIKASIVVSGNNNRNGSNNGRKTNNKPNNKSNNNSQRRKKQQQPIKKQHQSDSTTKDSEKSEERSELSGHEDENKAQQDDSSDTQLQRQNNKAQRRFNNNRPNSPLGHNTNNNQNGFQRRRYHNNKNEFHPRSNHRNRFQPQQMAQLQSKFYPFQPAMMAVNNIARQLEYYLSPENLTNDNYLRSKLSNEGYVPLSLLAKFYRVVNMSFGGDANVILAALREIVFNENATVEVSIGTLTKLKQDEVKETEEEKKVEQEQEPQEQDPVESPLDKYFIRSKQWEQWIPETVETEISIENTLNGDALDEFMIKVIPVPQRPQQTQSPDQEQEIEQEKVEEEQSEESAATEATD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.43
3 0.51
4 0.55
5 0.54
6 0.53
7 0.55
8 0.52
9 0.53
10 0.49
11 0.46
12 0.48
13 0.55
14 0.49
15 0.48
16 0.47
17 0.42
18 0.47
19 0.44
20 0.4
21 0.35
22 0.37
23 0.42
24 0.42
25 0.46
26 0.41
27 0.43
28 0.39
29 0.38
30 0.35
31 0.31
32 0.28
33 0.2
34 0.16
35 0.14
36 0.14
37 0.15
38 0.19
39 0.26
40 0.31
41 0.38
42 0.44
43 0.51
44 0.55
45 0.61
46 0.66
47 0.68
48 0.7
49 0.73
50 0.73
51 0.7
52 0.68
53 0.62
54 0.55
55 0.5
56 0.47
57 0.41
58 0.34
59 0.35
60 0.41
61 0.42
62 0.41
63 0.37
64 0.35
65 0.33
66 0.33
67 0.3
68 0.23
69 0.22
70 0.25
71 0.3
72 0.33
73 0.35
74 0.35
75 0.32
76 0.33
77 0.35
78 0.39
79 0.42
80 0.44
81 0.45
82 0.51
83 0.57
84 0.62
85 0.69
86 0.71
87 0.71
88 0.71
89 0.76
90 0.81
91 0.82
92 0.8
93 0.79
94 0.8
95 0.8
96 0.82
97 0.81
98 0.81
99 0.84
100 0.89
101 0.88
102 0.87
103 0.87
104 0.88
105 0.9
106 0.9
107 0.91
108 0.89
109 0.84
110 0.81
111 0.79
112 0.74
113 0.7
114 0.66
115 0.6
116 0.55
117 0.5
118 0.47
119 0.39
120 0.37
121 0.35
122 0.33
123 0.3
124 0.3
125 0.31
126 0.3
127 0.29
128 0.26
129 0.25
130 0.22
131 0.18
132 0.19
133 0.18
134 0.17
135 0.22
136 0.23
137 0.19
138 0.18
139 0.18
140 0.16
141 0.19
142 0.2
143 0.2
144 0.2
145 0.2
146 0.25
147 0.29
148 0.3
149 0.32
150 0.36
151 0.4
152 0.45
153 0.55
154 0.57
155 0.62
156 0.66
157 0.71
158 0.74
159 0.76
160 0.79
161 0.75
162 0.74
163 0.71
164 0.66
165 0.59
166 0.54
167 0.51
168 0.45
169 0.45
170 0.42
171 0.38
172 0.43
173 0.45
174 0.42
175 0.36
176 0.34
177 0.36
178 0.38
179 0.43
180 0.43
181 0.43
182 0.52
183 0.6
184 0.68
185 0.68
186 0.74
187 0.72
188 0.7
189 0.76
190 0.7
191 0.65
192 0.61
193 0.59
194 0.59
195 0.66
196 0.68
197 0.61
198 0.66
199 0.66
200 0.67
201 0.66
202 0.63
203 0.54
204 0.54
205 0.53
206 0.47
207 0.46
208 0.39
209 0.34
210 0.27
211 0.27
212 0.19
213 0.16
214 0.19
215 0.17
216 0.16
217 0.16
218 0.16
219 0.16
220 0.16
221 0.16
222 0.1
223 0.13
224 0.12
225 0.11
226 0.09
227 0.08
228 0.07
229 0.08
230 0.09
231 0.07
232 0.09
233 0.1
234 0.11
235 0.11
236 0.12
237 0.13
238 0.14
239 0.14
240 0.13
241 0.13
242 0.15
243 0.16
244 0.16
245 0.15
246 0.14
247 0.15
248 0.18
249 0.18
250 0.18
251 0.18
252 0.2
253 0.2
254 0.19
255 0.18
256 0.14
257 0.13
258 0.1
259 0.11
260 0.08
261 0.08
262 0.09
263 0.09
264 0.12
265 0.13
266 0.13
267 0.14
268 0.15
269 0.15
270 0.14
271 0.14
272 0.11
273 0.09
274 0.08
275 0.07
276 0.05
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.03
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.05
285 0.07
286 0.07
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.07
300 0.07
301 0.12
302 0.13
303 0.14
304 0.19
305 0.22
306 0.29
307 0.31
308 0.35
309 0.33
310 0.35
311 0.41
312 0.4
313 0.39
314 0.33
315 0.34
316 0.34
317 0.35
318 0.34
319 0.36
320 0.38
321 0.44
322 0.46
323 0.42
324 0.39
325 0.35
326 0.33
327 0.26
328 0.24
329 0.17
330 0.15
331 0.15
332 0.16
333 0.18
334 0.18
335 0.2
336 0.25
337 0.29
338 0.34
339 0.39
340 0.43
341 0.49
342 0.59
343 0.62
344 0.59
345 0.6
346 0.6
347 0.57
348 0.53
349 0.45
350 0.36
351 0.31
352 0.25
353 0.21
354 0.15
355 0.13
356 0.12
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.09
361 0.08
362 0.07
363 0.07
364 0.06
365 0.08
366 0.08
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.08
371 0.07
372 0.08
373 0.13
374 0.18
375 0.22
376 0.28
377 0.34
378 0.43
379 0.47
380 0.51
381 0.54
382 0.56
383 0.61
384 0.64
385 0.66
386 0.59
387 0.58
388 0.56
389 0.48
390 0.45
391 0.42
392 0.35
393 0.26
394 0.25
395 0.24
396 0.22
397 0.23
398 0.18
399 0.14
400 0.15
401 0.16
402 0.16
403 0.15
404 0.14
405 0.13