FuNGI

A0A1E5S102

Protein Details

Accession

A0A1E5S102

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-77	RGKPDTQGKRLVKKVKKIASPFIRTDYVRRQYLKTKNKFKRDSNKKKLNKDEKETKVVL	Hydrophilic
533-567	KSDTEKLKSPDKKVRKPRKVKTTVRKHKNNVIVIK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
26-36	GKRLVKKVKKI
52-67	KTKNKFKRDSNKKKLN
272-288	VRRGGWFGKRKTRQLKK
542-564	KLKSPDKKVRKPRKVKTTVRKHK

Subcellular Location(s)

nucl 26.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSSNTNGANALAQPRIEIRGKPDTQGKRLVKKVKKIASPFIRTDYVRRQYLKTKNKFKRDSNKKKLNKDXEKETKVVLNNSDDEYDEFPLRAIKFDEIANVKTNILKFQTNKVINVEKDFHLPVRLHRKDTRNLQFQLTRAEIVQRQKEIIEYKKKLQEEESKLQQKRXTTQEGDADSDRTSENTDSNNNFVPLGKSMIQKMMENQNPSTTASPSSTPADEVDSASLRPSEAGKVIYDGKEGFINSELNMDNEENXNADVFDDVAPDGGARVRRGGWFGKRKTRQLKKYDEHAKKLRFEEFYPWVLEDFDGYNTWVGTYEAGNSDHYVMFSVEKDGSFTMLPCDKVYRFTARSQFATLTIEEAEKRFEKKRQSVPRWLMKHLDDIGTTTTRYDRTLRKLKGVDGDNHDNQDDEGNVFKRETSDNEIDFDDDFQDDEEAPIMDGNDQENKETEQRMKKEMLQANAMGLRDHEDIIDELDAEDNGEVEDKSIKNTLKKTDMGVLYDSDDEEENPYLSKSDIEXEEKEKEEQNKVKAEEKSDTEKLKSPDKKVRKPRKVKTTVRKHKNNVIVIKTQPDILKKFPLGEWYPKPEEDSKLNISPSKQSSLAVSNKTASPTPEDSLTEELREEDIINIISANPGKLTLKDLIKELKQKVVMNADNKAKMKVLIKQLVKLNNGFLELASXNKVE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.24
3	0.26
4	0.26
5	0.28
6	0.37
7	0.38
8	0.42
9	0.5
10	0.52
11	0.54
12	0.63
13	0.64
14	0.63
15	0.71
16	0.77
17	0.76
18	0.78
19	0.83
20	0.81
21	0.82
22	0.79
23	0.8
24	0.8
25	0.79
26	0.72
27	0.68
28	0.65
29	0.57
30	0.58
31	0.58
32	0.56
33	0.56
34	0.55
35	0.55
36	0.59
37	0.68
38	0.71
39	0.71
40	0.75
41	0.77
42	0.85
43	0.89
44	0.89
45	0.9
46	0.91
47	0.92
48	0.92
49	0.92
50	0.91
51	0.92
52	0.93
53	0.93
54	0.91
55	0.9
56	0.89
57	0.86
58	0.84
59	0.77
60	0.69
61	0.65
62	0.59
63	0.53
64	0.46
65	0.41
66	0.35
67	0.33
68	0.31
69	0.25
70	0.24
71	0.23
72	0.19
73	0.17
74	0.15
75	0.19
76	0.19
77	0.18
78	0.18
79	0.17
80	0.18
81	0.18
82	0.25
83	0.23
84	0.25
85	0.26
86	0.25
87	0.24
88	0.26
89	0.27
90	0.24
91	0.24
92	0.27
93	0.26
94	0.33
95	0.42
96	0.42
97	0.43
98	0.45
99	0.49
100	0.44
101	0.47
102	0.43
103	0.35
104	0.36
105	0.35
106	0.31
107	0.29
108	0.28
109	0.31
110	0.39
111	0.41
112	0.44
113	0.5
114	0.56
115	0.6
116	0.7
117	0.71
118	0.69
119	0.67
120	0.67
121	0.63
122	0.58
123	0.55
124	0.47
125	0.37
126	0.29
127	0.31
128	0.3
129	0.34
130	0.37
131	0.32
132	0.31
133	0.3
134	0.34
135	0.36
136	0.4
137	0.43
138	0.42
139	0.48
140	0.54
141	0.55
142	0.53
143	0.54
144	0.55
145	0.53
146	0.57
147	0.59
148	0.62
149	0.63
150	0.65
151	0.62
152	0.57
153	0.52
154	0.51
155	0.46
156	0.38
157	0.42
158	0.4
159	0.41
160	0.38
161	0.35
162	0.28
163	0.24
164	0.23
165	0.17
166	0.17
167	0.13
168	0.13
169	0.15
170	0.2
171	0.2
172	0.23
173	0.24
174	0.22
175	0.21
176	0.2
177	0.19
178	0.15
179	0.17
180	0.18
181	0.17
182	0.18
183	0.23
184	0.23
185	0.22
186	0.25
187	0.31
188	0.31
189	0.33
190	0.32
191	0.3
192	0.3
193	0.31
194	0.28
195	0.2
196	0.18
197	0.17
198	0.17
199	0.17
200	0.18
201	0.17
202	0.16
203	0.15
204	0.16
205	0.15
206	0.14
207	0.14
208	0.12
209	0.12
210	0.12
211	0.11
212	0.09
213	0.09
214	0.09
215	0.09
216	0.1
217	0.11
218	0.1
219	0.12
220	0.15
221	0.15
222	0.15
223	0.14
224	0.13
225	0.13
226	0.13
227	0.12
228	0.11
229	0.11
230	0.1
231	0.12
232	0.12
233	0.1
234	0.12
235	0.12
236	0.1
237	0.1
238	0.1
239	0.07
240	0.07
241	0.07
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.04
246	0.05
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.04
251	0.04
252	0.06
253	0.08
254	0.07
255	0.09
256	0.1
257	0.11
258	0.14
259	0.19
260	0.26
261	0.34
262	0.4
263	0.49
264	0.54
265	0.62
266	0.7
267	0.75
268	0.75
269	0.75
270	0.79
271	0.74
272	0.78
273	0.8
274	0.76
275	0.74
276	0.73
277	0.69
278	0.63
279	0.61
280	0.56
281	0.47
282	0.42
283	0.4
284	0.36
285	0.32
286	0.28
287	0.25
288	0.21
289	0.19
290	0.17
291	0.12
292	0.09
293	0.08
294	0.07
295	0.07
296	0.07
297	0.07
298	0.07
299	0.06
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.06
304	0.07
305	0.08
306	0.08
307	0.08
308	0.1
309	0.09
310	0.09
311	0.09
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.08
316	0.08
317	0.07
318	0.08
319	0.07
320	0.08
321	0.07
322	0.07
323	0.08
324	0.1
325	0.1
326	0.1
327	0.13
328	0.12
329	0.14
330	0.17
331	0.2
332	0.21
333	0.25
334	0.31
335	0.31
336	0.32
337	0.31
338	0.29
339	0.24
340	0.23
341	0.19
342	0.13
343	0.11
344	0.1
345	0.09
346	0.09
347	0.11
348	0.1
349	0.14
350	0.16
351	0.21
352	0.28
353	0.36
354	0.46
355	0.54
356	0.6
357	0.67
358	0.71
359	0.75
360	0.71
361	0.65
362	0.59
363	0.49
364	0.47
365	0.38
366	0.31
367	0.22
368	0.19
369	0.19
370	0.16
371	0.15
372	0.11
373	0.11
374	0.11
375	0.12
376	0.16
377	0.19
378	0.27
379	0.37
380	0.38
381	0.43
382	0.45
383	0.45
384	0.48
385	0.46
386	0.43
387	0.4
388	0.45
389	0.39
390	0.39
391	0.36
392	0.29
393	0.25
394	0.21
395	0.14
396	0.08
397	0.1
398	0.1
399	0.11
400	0.11
401	0.11
402	0.12
403	0.13
404	0.15
405	0.19
406	0.22
407	0.22
408	0.24
409	0.24
410	0.23
411	0.22
412	0.19
413	0.12
414	0.08
415	0.08
416	0.06
417	0.07
418	0.06
419	0.06
420	0.06
421	0.05
422	0.05
423	0.06
424	0.05
425	0.05
426	0.06
427	0.07
428	0.11
429	0.11
430	0.12
431	0.13
432	0.14
433	0.17
434	0.19
435	0.25
436	0.28
437	0.31
438	0.35
439	0.36
440	0.38
441	0.45
442	0.46
443	0.42
444	0.37
445	0.34
446	0.32
447	0.32
448	0.28
449	0.19
450	0.15
451	0.15
452	0.13
453	0.13
454	0.11
455	0.1
456	0.1
457	0.11
458	0.11
459	0.07
460	0.06
461	0.06
462	0.06
463	0.06
464	0.05
465	0.04
466	0.04
467	0.05
468	0.05
469	0.05
470	0.09
471	0.09
472	0.11
473	0.16
474	0.19
475	0.23
476	0.28
477	0.33
478	0.34
479	0.36
480	0.36
481	0.38
482	0.38
483	0.34
484	0.31
485	0.26
486	0.22
487	0.21
488	0.19
489	0.13
490	0.11
491	0.1
492	0.11
493	0.11
494	0.09
495	0.09
496	0.1
497	0.09
498	0.09
499	0.1
500	0.09
501	0.13
502	0.16
503	0.2
504	0.25
505	0.27
506	0.3
507	0.33
508	0.34
509	0.33
510	0.38
511	0.39
512	0.4
513	0.44
514	0.43
515	0.47
516	0.48
517	0.48
518	0.45
519	0.44
520	0.46
521	0.45
522	0.46
523	0.41
524	0.45
525	0.44
526	0.49
527	0.51
528	0.52
529	0.57
530	0.64
531	0.72
532	0.77
533	0.85
534	0.86
535	0.9
536	0.92
537	0.93
538	0.93
539	0.93
540	0.93
541	0.93
542	0.93
543	0.93
544	0.93
545	0.89
546	0.87
547	0.85
548	0.82
549	0.79
550	0.73
551	0.68
552	0.6
553	0.57
554	0.49
555	0.43
556	0.38
557	0.36
558	0.34
559	0.32
560	0.36
561	0.33
562	0.35
563	0.32
564	0.37
565	0.36
566	0.41
567	0.44
568	0.45
569	0.48
570	0.46
571	0.5
572	0.46
573	0.46
574	0.42
575	0.42
576	0.4
577	0.41
578	0.43
579	0.42
580	0.39
581	0.42
582	0.41
583	0.4
584	0.34
585	0.3
586	0.31
587	0.36
588	0.4
589	0.37
590	0.35
591	0.33
592	0.34
593	0.36
594	0.34
595	0.28
596	0.28
597	0.28
598	0.28
599	0.29
600	0.28
601	0.28
602	0.32
603	0.31
604	0.25
605	0.22
606	0.21
607	0.19
608	0.18
609	0.16
610	0.11
611	0.12
612	0.12
613	0.11
614	0.1
615	0.09
616	0.12
617	0.12
618	0.12
619	0.1
620	0.12
621	0.13
622	0.14
623	0.18
624	0.22
625	0.26
626	0.27
627	0.31
628	0.37
629	0.42
630	0.49
631	0.48
632	0.49
633	0.5
634	0.51
635	0.52
636	0.55
637	0.55
638	0.5
639	0.55
640	0.55
641	0.57
642	0.55
643	0.51
644	0.43
645	0.42
646	0.42
647	0.42
648	0.45
649	0.47
650	0.48
651	0.53
652	0.58
653	0.6
654	0.59
655	0.54
656	0.48
657	0.41
658	0.39
659	0.33
660	0.26
661	0.25
662	0.22

A0A1E5S102

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer