Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2AMS1

Protein Details
Accession H2AMS1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MSYYNRYKNRKRGGNYEGGNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003173  PC4_C  
IPR009044  ssDNA-bd_transcriptional_reg  
IPR045125  Sub1/Tcp4-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003713  F:transcription coactivator activity  
GO:0060261  P:positive regulation of transcription initiation by RNA polymerase II  
KEGG kaf:KAFR_0A02330  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02229  PC4  
Amino Acid Sequences MSYYNRYKNRKRGGNYEGGNEASSLSPHGLPSSDVIFDLGKNKRVTVRQFRNINLIDIREYYMDQSTGEMKPGKKGISLTEDLYDELLKHRLNIDEALRRFGSKRPRTKTVRIQSDGEEDTESHELEGDNDDGRTKKQKIAPPTLLPHEENAANAKREANATLVIPGARKQEVKTESEPVAVQEEEITQKDMESSDDEESKSFEEEMNKLLDESSEEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.73
3 0.67
4 0.6
5 0.51
6 0.44
7 0.35
8 0.28
9 0.18
10 0.16
11 0.12
12 0.11
13 0.1
14 0.1
15 0.11
16 0.11
17 0.11
18 0.13
19 0.13
20 0.12
21 0.11
22 0.12
23 0.12
24 0.12
25 0.19
26 0.2
27 0.25
28 0.25
29 0.27
30 0.31
31 0.37
32 0.46
33 0.49
34 0.56
35 0.59
36 0.63
37 0.64
38 0.66
39 0.61
40 0.55
41 0.46
42 0.37
43 0.3
44 0.25
45 0.25
46 0.17
47 0.16
48 0.14
49 0.13
50 0.12
51 0.1
52 0.1
53 0.12
54 0.12
55 0.15
56 0.17
57 0.16
58 0.2
59 0.23
60 0.22
61 0.21
62 0.22
63 0.22
64 0.24
65 0.25
66 0.23
67 0.21
68 0.21
69 0.19
70 0.19
71 0.16
72 0.1
73 0.09
74 0.11
75 0.1
76 0.1
77 0.11
78 0.11
79 0.13
80 0.15
81 0.17
82 0.21
83 0.22
84 0.25
85 0.23
86 0.23
87 0.23
88 0.25
89 0.32
90 0.34
91 0.43
92 0.45
93 0.54
94 0.6
95 0.67
96 0.72
97 0.71
98 0.71
99 0.65
100 0.61
101 0.53
102 0.51
103 0.44
104 0.34
105 0.25
106 0.16
107 0.15
108 0.14
109 0.13
110 0.08
111 0.08
112 0.07
113 0.07
114 0.09
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.08
119 0.08
120 0.1
121 0.17
122 0.17
123 0.22
124 0.29
125 0.34
126 0.41
127 0.49
128 0.53
129 0.52
130 0.54
131 0.53
132 0.5
133 0.45
134 0.38
135 0.31
136 0.26
137 0.21
138 0.22
139 0.2
140 0.18
141 0.18
142 0.18
143 0.17
144 0.17
145 0.18
146 0.15
147 0.13
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.11
153 0.13
154 0.14
155 0.15
156 0.17
157 0.17
158 0.25
159 0.28
160 0.32
161 0.33
162 0.35
163 0.33
164 0.34
165 0.33
166 0.26
167 0.26
168 0.2
169 0.17
170 0.13
171 0.13
172 0.14
173 0.15
174 0.16
175 0.13
176 0.13
177 0.14
178 0.13
179 0.13
180 0.14
181 0.15
182 0.17
183 0.19
184 0.2
185 0.19
186 0.21
187 0.2
188 0.19
189 0.16
190 0.16
191 0.17
192 0.18
193 0.2
194 0.22
195 0.2
196 0.19
197 0.19
198 0.16