FuNGI

H2AVN1

Protein Details

Accession

H2AVN1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
32-58	QDIWKNLNKIRKYNKKADSPLKNSRIF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 12, mito 3, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043954 Snu56_snRNP
Gene Ontology	GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
KEGG	kaf:KAFR_0E02790 -
Pfam	View protein in Pfam PF19097 Snu56_snRNP

Amino Acid Sequences

MNVNKRPQSNRGPLLVKRNRRTDDYNDFFESQDIWKNLNKIRKYNKKADSPLKNSRIFIRVAPNMDINNLKGCIEALTEYVDPQKLFLQRSKSPHLPSHIVLQNFSVLDGCLVLSVLLSLKDKGWGSKVNKDYYKIPRESIIGGSIYLPKNCILRDSSFQKRFNRHPGFQMSESKYNVISTFKEVRISLQKNSSLSHFIFGVASFLSTLAFGKGNKNMNRQFEIASNGFGKRQNAFLNEIPFVNEVLFDIDLLMKTNRTIVEESNKQLQEHVRTLHKFNEASVEATTDSIKPVTASQKSASNRTTSSSRYDNVNSIPSSRERTPLASASAQGNKPGYLTQEQIKDHCSATIKASTELVKTKSAYQIFKVYVKYPKQTYIEKIFERLDELRCKTNCNIVVLNLNNLYESEPWFKALDISKYTTVTQAPHPSTVRVVSIGGVSEYIVQALDLIAKMLDS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.72
2	0.74
3	0.74
4	0.72
5	0.76
6	0.73
7	0.73
8	0.74
9	0.72
10	0.73
11	0.69
12	0.66
13	0.61
14	0.58
15	0.51
16	0.45
17	0.38
18	0.29
19	0.31
20	0.26
21	0.24
22	0.27
23	0.33
24	0.38
25	0.45
26	0.48
27	0.5
28	0.6
29	0.68
30	0.73
31	0.77
32	0.8
33	0.81
34	0.85
35	0.86
36	0.86
37	0.83
38	0.86
39	0.84
40	0.79
41	0.71
42	0.66
43	0.59
44	0.5
45	0.46
46	0.44
47	0.41
48	0.4
49	0.4
50	0.38
51	0.35
52	0.36
53	0.33
54	0.26
55	0.24
56	0.21
57	0.19
58	0.16
59	0.16
60	0.13
61	0.13
62	0.12
63	0.09
64	0.12
65	0.12
66	0.12
67	0.15
68	0.17
69	0.15
70	0.16
71	0.2
72	0.21
73	0.25
74	0.29
75	0.33
76	0.37
77	0.44
78	0.51
79	0.53
80	0.54
81	0.56
82	0.58
83	0.55
84	0.49
85	0.52
86	0.49
87	0.43
88	0.38
89	0.33
90	0.29
91	0.24
92	0.23
93	0.14
94	0.09
95	0.09
96	0.08
97	0.07
98	0.04
99	0.04
100	0.04
101	0.03
102	0.04
103	0.04
104	0.06
105	0.07
106	0.08
107	0.08
108	0.12
109	0.13
110	0.14
111	0.17
112	0.24
113	0.28
114	0.36
115	0.41
116	0.45
117	0.48
118	0.5
119	0.54
120	0.55
121	0.6
122	0.53
123	0.48
124	0.43
125	0.42
126	0.41
127	0.34
128	0.26
129	0.18
130	0.16
131	0.16
132	0.19
133	0.18
134	0.17
135	0.16
136	0.15
137	0.17
138	0.17
139	0.18
140	0.16
141	0.18
142	0.24
143	0.3
144	0.38
145	0.44
146	0.5
147	0.55
148	0.59
149	0.62
150	0.67
151	0.68
152	0.61
153	0.6
154	0.6
155	0.58
156	0.55
157	0.57
158	0.5
159	0.47
160	0.46
161	0.4
162	0.33
163	0.28
164	0.26
165	0.19
166	0.16
167	0.17
168	0.21
169	0.2
170	0.22
171	0.22
172	0.24
173	0.32
174	0.33
175	0.31
176	0.31
177	0.33
178	0.31
179	0.32
180	0.3
181	0.25
182	0.22
183	0.2
184	0.15
185	0.13
186	0.12
187	0.11
188	0.1
189	0.06
190	0.06
191	0.05
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.05
197	0.06
198	0.06
199	0.09
200	0.14
201	0.21
202	0.25
203	0.32
204	0.36
205	0.39
206	0.41
207	0.4
208	0.36
209	0.3
210	0.31
211	0.24
212	0.21
213	0.18
214	0.16
215	0.17
216	0.17
217	0.17
218	0.13
219	0.16
220	0.16
221	0.17
222	0.21
223	0.21
224	0.22
225	0.21
226	0.21
227	0.19
228	0.17
229	0.15
230	0.11
231	0.08
232	0.06
233	0.06
234	0.06
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.06
240	0.06
241	0.05
242	0.06
243	0.08
244	0.08
245	0.1
246	0.11
247	0.12
248	0.19
249	0.22
250	0.24
251	0.3
252	0.3
253	0.28
254	0.29
255	0.31
256	0.29
257	0.28
258	0.29
259	0.29
260	0.3
261	0.32
262	0.34
263	0.35
264	0.3
265	0.27
266	0.3
267	0.24
268	0.23
269	0.21
270	0.18
271	0.14
272	0.14
273	0.15
274	0.09
275	0.09
276	0.08
277	0.07
278	0.07
279	0.1
280	0.16
281	0.17
282	0.2
283	0.2
284	0.27
285	0.3
286	0.35
287	0.34
288	0.3
289	0.28
290	0.29
291	0.31
292	0.26
293	0.29
294	0.28
295	0.28
296	0.29
297	0.3
298	0.3
299	0.29
300	0.31
301	0.26
302	0.24
303	0.25
304	0.23
305	0.27
306	0.25
307	0.27
308	0.24
309	0.26
310	0.28
311	0.28
312	0.29
313	0.24
314	0.25
315	0.26
316	0.3
317	0.27
318	0.26
319	0.25
320	0.21
321	0.21
322	0.2
323	0.2
324	0.16
325	0.18
326	0.21
327	0.26
328	0.28
329	0.28
330	0.3
331	0.28
332	0.26
333	0.26
334	0.25
335	0.2
336	0.22
337	0.26
338	0.25
339	0.24
340	0.26
341	0.24
342	0.24
343	0.28
344	0.26
345	0.25
346	0.24
347	0.27
348	0.32
349	0.35
350	0.35
351	0.33
352	0.38
353	0.37
354	0.4
355	0.4
356	0.37
357	0.41
358	0.44
359	0.47
360	0.44
361	0.48
362	0.49
363	0.51
364	0.54
365	0.54
366	0.57
367	0.52
368	0.53
369	0.47
370	0.42
371	0.42
372	0.38
373	0.35
374	0.36
375	0.38
376	0.42
377	0.41
378	0.45
379	0.43
380	0.47
381	0.45
382	0.42
383	0.4
384	0.33
385	0.41
386	0.37
387	0.39
388	0.32
389	0.28
390	0.23
391	0.22
392	0.22
393	0.15
394	0.18
395	0.19
396	0.18
397	0.2
398	0.21
399	0.2
400	0.24
401	0.27
402	0.3
403	0.29
404	0.33
405	0.34
406	0.36
407	0.36
408	0.35
409	0.32
410	0.28
411	0.31
412	0.36
413	0.36
414	0.4
415	0.41
416	0.4
417	0.41
418	0.4
419	0.34
420	0.26
421	0.24
422	0.18
423	0.18
424	0.16
425	0.14
426	0.11
427	0.1
428	0.1
429	0.1
430	0.09
431	0.08
432	0.07
433	0.06
434	0.06
435	0.08
436	0.06
437	0.07

H2AVN1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer