Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4RJM6

Protein Details
Accession A0A1E4RJM6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
301-327SLSRNNTMSSKRRKNKRNSIRFDSSKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
312-316RRKNK
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031398  She3  
Gene Ontology GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0048309  P:endoplasmic reticulum inheritance  
GO:0051028  P:mRNA transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF17078  SHE3  
Amino Acid Sequences MDENNPMKKPTSKVIDSLHSQIDSLKNELDSIKISHDDYKKKYSIIAKKNDSFVDQLANAKHENDMINALLKRKERRITDLEDQYNELCSTNESLNLNNKNMKIRCENLQESSASSTAEFERLKIAYDALIASQVEYKKHYQKELNQLTVNFEDYKKQNLANFETLSNKLLSNDKDVDTLLDSLTNKRKTMDNLYVNKNKSILELLTKLAKTAKIHGQESKIILSNNVDIINQLKLKIPDLEIKIANHENIEIDLDEILNDTNETLSNSSFDEEATLISSPDPQKDDSNSNTPKQSQPIQSLSRNNTMSSKRRKNKRNSIRFDSSKSSNPDFSSINTPTQLNIPKRNSINLNSPNTTPRNSSFNQSFDSRTPTPPEEMHKYPNYNNNYNNNNYNNNNNFNNVGKVHNNLNHLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.56
3 0.54
4 0.54
5 0.5
6 0.41
7 0.37
8 0.35
9 0.35
10 0.31
11 0.3
12 0.27
13 0.23
14 0.24
15 0.25
16 0.22
17 0.19
18 0.18
19 0.19
20 0.19
21 0.21
22 0.27
23 0.35
24 0.41
25 0.45
26 0.52
27 0.51
28 0.5
29 0.54
30 0.56
31 0.59
32 0.6
33 0.64
34 0.65
35 0.66
36 0.71
37 0.66
38 0.58
39 0.5
40 0.42
41 0.37
42 0.29
43 0.29
44 0.25
45 0.26
46 0.25
47 0.23
48 0.22
49 0.2
50 0.19
51 0.16
52 0.16
53 0.15
54 0.19
55 0.2
56 0.23
57 0.25
58 0.3
59 0.35
60 0.41
61 0.47
62 0.46
63 0.52
64 0.56
65 0.58
66 0.62
67 0.65
68 0.62
69 0.56
70 0.53
71 0.46
72 0.41
73 0.34
74 0.25
75 0.16
76 0.13
77 0.14
78 0.13
79 0.16
80 0.15
81 0.17
82 0.25
83 0.29
84 0.31
85 0.33
86 0.35
87 0.4
88 0.41
89 0.43
90 0.41
91 0.4
92 0.43
93 0.47
94 0.48
95 0.42
96 0.43
97 0.38
98 0.34
99 0.33
100 0.26
101 0.18
102 0.15
103 0.14
104 0.12
105 0.17
106 0.15
107 0.13
108 0.16
109 0.15
110 0.17
111 0.16
112 0.15
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.08
117 0.09
118 0.07
119 0.08
120 0.11
121 0.12
122 0.12
123 0.15
124 0.2
125 0.26
126 0.29
127 0.35
128 0.38
129 0.44
130 0.54
131 0.58
132 0.58
133 0.53
134 0.5
135 0.48
136 0.42
137 0.37
138 0.27
139 0.2
140 0.2
141 0.19
142 0.23
143 0.21
144 0.22
145 0.23
146 0.25
147 0.3
148 0.29
149 0.29
150 0.25
151 0.27
152 0.26
153 0.25
154 0.21
155 0.16
156 0.14
157 0.17
158 0.17
159 0.19
160 0.2
161 0.19
162 0.19
163 0.19
164 0.18
165 0.15
166 0.15
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.13
171 0.21
172 0.22
173 0.21
174 0.22
175 0.25
176 0.26
177 0.32
178 0.37
179 0.38
180 0.42
181 0.49
182 0.54
183 0.53
184 0.5
185 0.44
186 0.35
187 0.27
188 0.23
189 0.16
190 0.13
191 0.13
192 0.13
193 0.16
194 0.15
195 0.15
196 0.15
197 0.16
198 0.14
199 0.17
200 0.22
201 0.23
202 0.25
203 0.28
204 0.29
205 0.29
206 0.3
207 0.27
208 0.23
209 0.18
210 0.17
211 0.15
212 0.13
213 0.12
214 0.11
215 0.1
216 0.08
217 0.09
218 0.11
219 0.1
220 0.1
221 0.12
222 0.12
223 0.13
224 0.15
225 0.15
226 0.19
227 0.21
228 0.23
229 0.22
230 0.22
231 0.24
232 0.24
233 0.22
234 0.17
235 0.15
236 0.12
237 0.1
238 0.11
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.05
252 0.06
253 0.06
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.07
259 0.08
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.06
265 0.07
266 0.11
267 0.12
268 0.14
269 0.16
270 0.16
271 0.19
272 0.23
273 0.28
274 0.28
275 0.36
276 0.38
277 0.39
278 0.41
279 0.41
280 0.41
281 0.41
282 0.43
283 0.39
284 0.41
285 0.45
286 0.47
287 0.5
288 0.55
289 0.54
290 0.55
291 0.5
292 0.45
293 0.45
294 0.46
295 0.49
296 0.53
297 0.59
298 0.61
299 0.71
300 0.8
301 0.84
302 0.88
303 0.9
304 0.9
305 0.89
306 0.89
307 0.89
308 0.84
309 0.78
310 0.73
311 0.67
312 0.63
313 0.6
314 0.54
315 0.48
316 0.44
317 0.42
318 0.36
319 0.35
320 0.35
321 0.31
322 0.3
323 0.28
324 0.27
325 0.24
326 0.3
327 0.35
328 0.34
329 0.4
330 0.42
331 0.48
332 0.5
333 0.55
334 0.54
335 0.5
336 0.54
337 0.54
338 0.56
339 0.52
340 0.51
341 0.53
342 0.51
343 0.49
344 0.43
345 0.37
346 0.37
347 0.36
348 0.42
349 0.4
350 0.4
351 0.41
352 0.39
353 0.4
354 0.36
355 0.42
356 0.38
357 0.37
358 0.4
359 0.39
360 0.41
361 0.41
362 0.45
363 0.45
364 0.47
365 0.51
366 0.51
367 0.54
368 0.56
369 0.61
370 0.61
371 0.61
372 0.64
373 0.65
374 0.64
375 0.64
376 0.66
377 0.62
378 0.61
379 0.57
380 0.59
381 0.57
382 0.57
383 0.53
384 0.48
385 0.46
386 0.41
387 0.43
388 0.35
389 0.34
390 0.3
391 0.32
392 0.37
393 0.39