Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2APG6

Protein Details
Accession H2APG6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
532-556QEEIDRCRKFVKNQRNKYKNYIEAVHydrophilic
612-632VNWNNSIKERVRQIRKRKDKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
623-632RQIRKRKDKE
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 10.833, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000195  Rab-GAP-TBC_dom  
IPR035969  Rab-GAP_TBC_sf  
KEGG kaf:KAFR_0A08320  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00566  RabGAP-TBC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50086  TBC_RABGAP  
Amino Acid Sequences MTKARTDSHFHDAEVLEDLYDSKPRKLGFPVKSPSVPNFHGVLKSNNYNSSVPLFNASAVDRLQADPGYSQGGSSANSLNGDDDANLSVIDMYGGDFDSPRKEQTMKKMDTLASGKGTDHNTDRISSNTVASTIETPIRKNVGSFDRYGFRKQTTYISEGEYDIWWTEYSQYCVRRKGKWELLLEKSGLSYAGDSPTRFPARSEKLKRYVRKGIPAEWRGNAWWYFAKGDEILNKNKGLYDKLLSRIDQIKVQKNREKLYPDLEIIERDLHRTFPDNIHFQRESFQDGESTMIKSLRRVLVAFSLFNPKIGYCQSMNFLSGLLLLFLDEEKAFWMLVIITSRYLPGVHNVNLEGVNVDQGVLMLCVKEYLPEIWSYIKPFYKTQNSNRVTMVSFSSNSSMHSKGTTKNEFLYKLPPVTLCTASWFMSCFVGVTPIETTLRIWDCMFYEESNFLFKASLGILKMSEQTLNKGKLHSTSLNHHNQLRSRKVSQDESDMELFQALQTFPKKLLNPNDLFEKIIFKRRITFNNLDQEEIDRCRKFVKNQRNKYKNYIEAVDSSQYSNGRASKYDDTGHNNGNNTNTFNTSTPISDTMIQDVLSSEGYGFKKGISGVNWNNSIKERVRQIRKRKDKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.25
3 0.17
4 0.16
5 0.17
6 0.13
7 0.19
8 0.21
9 0.19
10 0.23
11 0.24
12 0.28
13 0.36
14 0.45
15 0.46
16 0.54
17 0.58
18 0.61
19 0.64
20 0.64
21 0.6
22 0.57
23 0.52
24 0.45
25 0.41
26 0.37
27 0.37
28 0.36
29 0.37
30 0.37
31 0.41
32 0.42
33 0.42
34 0.44
35 0.39
36 0.39
37 0.37
38 0.32
39 0.26
40 0.26
41 0.23
42 0.2
43 0.21
44 0.19
45 0.18
46 0.16
47 0.17
48 0.15
49 0.15
50 0.16
51 0.15
52 0.15
53 0.13
54 0.14
55 0.15
56 0.14
57 0.13
58 0.12
59 0.13
60 0.13
61 0.15
62 0.16
63 0.13
64 0.14
65 0.15
66 0.14
67 0.13
68 0.13
69 0.11
70 0.1
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.08
75 0.07
76 0.07
77 0.06
78 0.05
79 0.04
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.06
84 0.08
85 0.13
86 0.14
87 0.16
88 0.19
89 0.23
90 0.28
91 0.38
92 0.48
93 0.46
94 0.48
95 0.51
96 0.49
97 0.51
98 0.48
99 0.41
100 0.33
101 0.31
102 0.28
103 0.27
104 0.29
105 0.26
106 0.26
107 0.27
108 0.26
109 0.27
110 0.28
111 0.25
112 0.27
113 0.24
114 0.23
115 0.19
116 0.18
117 0.16
118 0.16
119 0.15
120 0.13
121 0.17
122 0.17
123 0.18
124 0.21
125 0.23
126 0.22
127 0.21
128 0.26
129 0.28
130 0.3
131 0.31
132 0.31
133 0.35
134 0.38
135 0.42
136 0.39
137 0.34
138 0.34
139 0.33
140 0.37
141 0.34
142 0.35
143 0.32
144 0.31
145 0.29
146 0.28
147 0.27
148 0.2
149 0.16
150 0.13
151 0.12
152 0.1
153 0.09
154 0.12
155 0.13
156 0.17
157 0.21
158 0.29
159 0.32
160 0.41
161 0.45
162 0.48
163 0.52
164 0.58
165 0.61
166 0.61
167 0.64
168 0.62
169 0.63
170 0.6
171 0.54
172 0.44
173 0.35
174 0.28
175 0.21
176 0.13
177 0.09
178 0.08
179 0.11
180 0.12
181 0.12
182 0.14
183 0.21
184 0.23
185 0.22
186 0.23
187 0.28
188 0.35
189 0.45
190 0.51
191 0.53
192 0.6
193 0.69
194 0.74
195 0.73
196 0.75
197 0.7
198 0.71
199 0.66
200 0.64
201 0.65
202 0.64
203 0.6
204 0.5
205 0.46
206 0.37
207 0.37
208 0.29
209 0.22
210 0.18
211 0.16
212 0.16
213 0.15
214 0.15
215 0.13
216 0.14
217 0.18
218 0.21
219 0.23
220 0.25
221 0.24
222 0.23
223 0.25
224 0.24
225 0.2
226 0.19
227 0.19
228 0.2
229 0.25
230 0.27
231 0.26
232 0.28
233 0.3
234 0.29
235 0.3
236 0.33
237 0.36
238 0.41
239 0.49
240 0.5
241 0.51
242 0.52
243 0.52
244 0.51
245 0.44
246 0.41
247 0.37
248 0.32
249 0.29
250 0.27
251 0.22
252 0.19
253 0.2
254 0.15
255 0.14
256 0.14
257 0.13
258 0.13
259 0.16
260 0.17
261 0.17
262 0.21
263 0.25
264 0.26
265 0.32
266 0.31
267 0.28
268 0.3
269 0.27
270 0.26
271 0.2
272 0.2
273 0.14
274 0.13
275 0.15
276 0.12
277 0.12
278 0.1
279 0.11
280 0.11
281 0.11
282 0.15
283 0.15
284 0.15
285 0.14
286 0.14
287 0.17
288 0.18
289 0.18
290 0.15
291 0.2
292 0.19
293 0.19
294 0.19
295 0.14
296 0.15
297 0.15
298 0.16
299 0.1
300 0.11
301 0.13
302 0.13
303 0.14
304 0.12
305 0.11
306 0.08
307 0.08
308 0.07
309 0.05
310 0.04
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.04
315 0.03
316 0.03
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.05
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.06
332 0.09
333 0.12
334 0.13
335 0.14
336 0.14
337 0.15
338 0.14
339 0.14
340 0.11
341 0.07
342 0.06
343 0.05
344 0.05
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.03
351 0.03
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.05
356 0.06
357 0.06
358 0.07
359 0.08
360 0.11
361 0.12
362 0.13
363 0.16
364 0.18
365 0.19
366 0.21
367 0.28
368 0.34
369 0.41
370 0.47
371 0.54
372 0.54
373 0.54
374 0.52
375 0.47
376 0.38
377 0.32
378 0.26
379 0.18
380 0.16
381 0.15
382 0.16
383 0.14
384 0.16
385 0.17
386 0.16
387 0.14
388 0.16
389 0.18
390 0.21
391 0.3
392 0.31
393 0.3
394 0.33
395 0.36
396 0.35
397 0.34
398 0.33
399 0.28
400 0.25
401 0.25
402 0.22
403 0.21
404 0.22
405 0.22
406 0.17
407 0.18
408 0.19
409 0.18
410 0.18
411 0.17
412 0.14
413 0.13
414 0.13
415 0.09
416 0.07
417 0.1
418 0.09
419 0.09
420 0.09
421 0.1
422 0.11
423 0.11
424 0.11
425 0.13
426 0.14
427 0.14
428 0.14
429 0.13
430 0.14
431 0.16
432 0.17
433 0.13
434 0.13
435 0.14
436 0.14
437 0.15
438 0.14
439 0.12
440 0.11
441 0.1
442 0.1
443 0.09
444 0.11
445 0.09
446 0.1
447 0.1
448 0.11
449 0.12
450 0.12
451 0.14
452 0.13
453 0.17
454 0.24
455 0.28
456 0.28
457 0.29
458 0.29
459 0.29
460 0.34
461 0.34
462 0.31
463 0.34
464 0.42
465 0.48
466 0.51
467 0.51
468 0.5
469 0.51
470 0.56
471 0.57
472 0.54
473 0.5
474 0.53
475 0.55
476 0.57
477 0.53
478 0.52
479 0.47
480 0.45
481 0.43
482 0.37
483 0.31
484 0.24
485 0.21
486 0.13
487 0.13
488 0.08
489 0.11
490 0.13
491 0.15
492 0.16
493 0.22
494 0.25
495 0.3
496 0.39
497 0.44
498 0.45
499 0.46
500 0.51
501 0.46
502 0.45
503 0.38
504 0.37
505 0.31
506 0.37
507 0.38
508 0.33
509 0.4
510 0.45
511 0.51
512 0.52
513 0.56
514 0.54
515 0.61
516 0.61
517 0.54
518 0.48
519 0.44
520 0.4
521 0.38
522 0.37
523 0.27
524 0.27
525 0.32
526 0.37
527 0.43
528 0.5
529 0.56
530 0.6
531 0.71
532 0.82
533 0.85
534 0.86
535 0.86
536 0.85
537 0.81
538 0.75
539 0.67
540 0.59
541 0.53
542 0.51
543 0.44
544 0.36
545 0.29
546 0.27
547 0.24
548 0.22
549 0.23
550 0.23
551 0.22
552 0.23
553 0.28
554 0.3
555 0.34
556 0.37
557 0.38
558 0.42
559 0.45
560 0.5
561 0.48
562 0.44
563 0.42
564 0.42
565 0.39
566 0.34
567 0.31
568 0.28
569 0.27
570 0.26
571 0.26
572 0.23
573 0.22
574 0.22
575 0.22
576 0.22
577 0.22
578 0.23
579 0.24
580 0.23
581 0.21
582 0.18
583 0.17
584 0.16
585 0.13
586 0.12
587 0.09
588 0.14
589 0.15
590 0.17
591 0.16
592 0.15
593 0.17
594 0.19
595 0.23
596 0.2
597 0.28
598 0.34
599 0.42
600 0.48
601 0.46
602 0.47
603 0.46
604 0.49
605 0.43
606 0.43
607 0.46
608 0.5
609 0.6
610 0.68
611 0.76
612 0.81