Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4RI04

Protein Details
Accession A0A1E4RI04    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
222-248SAKANRPAQNTKSNKRKTRITKPKKKIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
227-248RPAQNTKSNKRKTRITKPKKKI
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034158  SF3B4_RRM1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12334  RRM1_SF3B4  
Amino Acid Sequences MASVFRKTDDSEKNAQATLYVGNLDPQVNEPLLYELFTQFGPIKSINLPKDRLLKTHQGFGFVEFRTGKDAEYTLNVLSGIRLFGKMLNLRKNDQSRSGITSNQKVGATTGPTTTSSNDIGAKLFIKNLNPLIDEKYLEDTFSKFGNLVAPPLLVRDDTGNSKKYAFLSYDDFASSDEVIAKMNNSILMNSKISISYAFKEDSNGNKKVRHGDEAERLLAESAKANRPAQNTKSNKRKTRITKPKKKI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.44
3 0.35
4 0.29
5 0.23
6 0.16
7 0.13
8 0.1
9 0.11
10 0.13
11 0.13
12 0.12
13 0.13
14 0.15
15 0.14
16 0.14
17 0.13
18 0.14
19 0.14
20 0.15
21 0.13
22 0.11
23 0.12
24 0.11
25 0.13
26 0.12
27 0.13
28 0.15
29 0.14
30 0.16
31 0.19
32 0.27
33 0.31
34 0.34
35 0.36
36 0.38
37 0.47
38 0.47
39 0.46
40 0.45
41 0.49
42 0.45
43 0.51
44 0.47
45 0.41
46 0.4
47 0.39
48 0.39
49 0.29
50 0.31
51 0.22
52 0.22
53 0.22
54 0.22
55 0.19
56 0.15
57 0.15
58 0.12
59 0.14
60 0.15
61 0.11
62 0.11
63 0.11
64 0.09
65 0.09
66 0.08
67 0.07
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.07
72 0.12
73 0.16
74 0.22
75 0.28
76 0.3
77 0.33
78 0.4
79 0.44
80 0.42
81 0.42
82 0.4
83 0.35
84 0.39
85 0.38
86 0.36
87 0.34
88 0.36
89 0.32
90 0.31
91 0.28
92 0.23
93 0.22
94 0.18
95 0.17
96 0.13
97 0.12
98 0.11
99 0.12
100 0.13
101 0.13
102 0.13
103 0.12
104 0.12
105 0.12
106 0.12
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.08
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.11
115 0.12
116 0.13
117 0.13
118 0.14
119 0.16
120 0.15
121 0.15
122 0.14
123 0.17
124 0.16
125 0.15
126 0.15
127 0.12
128 0.12
129 0.12
130 0.11
131 0.07
132 0.07
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.1
140 0.1
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.09
145 0.15
146 0.18
147 0.2
148 0.2
149 0.2
150 0.22
151 0.22
152 0.22
153 0.18
154 0.17
155 0.2
156 0.2
157 0.2
158 0.19
159 0.17
160 0.15
161 0.15
162 0.13
163 0.08
164 0.08
165 0.07
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.07
170 0.07
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.13
175 0.15
176 0.16
177 0.16
178 0.16
179 0.14
180 0.14
181 0.16
182 0.15
183 0.14
184 0.16
185 0.17
186 0.16
187 0.19
188 0.22
189 0.29
190 0.34
191 0.38
192 0.38
193 0.41
194 0.44
195 0.51
196 0.51
197 0.47
198 0.45
199 0.47
200 0.52
201 0.53
202 0.51
203 0.42
204 0.38
205 0.33
206 0.28
207 0.21
208 0.18
209 0.18
210 0.23
211 0.28
212 0.31
213 0.35
214 0.41
215 0.48
216 0.5
217 0.55
218 0.59
219 0.65
220 0.73
221 0.78
222 0.81
223 0.8
224 0.84
225 0.84
226 0.86
227 0.87
228 0.88