Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2B172

Protein Details
Accession H2B172    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
89-110DLKKLNKNKKLIKKLSKKYNAFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
94-104NKNKKLIKKLS
Subcellular Location(s) nucl 20, mito_nucl 12.333, cyto_nucl 11.833, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002143  Ribosomal_L1  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
IPR023673  Ribosomal_L1_CS  
Gene Ontology GO:0015934  C:large ribosomal subunit  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
KEGG kaf:KAFR_0K00170  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01199  RIBOSOMAL_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MSKITSSQVREHVKELLKYSNETKKRNFLETVELQVGLKNYDPQRDKRFSGNLRLPVCPRPNMSICIFGDAFDVDRAKSVGVDAMSVDDLKKLNKNKKLIKKLSKKYNAFVASEVLIKQVPRLLGPQLSKAGKFPTPVSHNDDLYGKVTDVRSTIKFQLKKVLCLAVAVGNVEMDEDTLVNQILMSVNFLVSLLKKNWQNVGSLVIKSTMGPAYRLY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.48
3 0.47
4 0.41
5 0.43
6 0.48
7 0.5
8 0.53
9 0.54
10 0.57
11 0.59
12 0.61
13 0.62
14 0.58
15 0.5
16 0.51
17 0.48
18 0.48
19 0.39
20 0.35
21 0.3
22 0.28
23 0.26
24 0.18
25 0.16
26 0.17
27 0.18
28 0.26
29 0.31
30 0.37
31 0.45
32 0.5
33 0.51
34 0.51
35 0.58
36 0.54
37 0.6
38 0.6
39 0.59
40 0.56
41 0.57
42 0.53
43 0.52
44 0.51
45 0.45
46 0.4
47 0.38
48 0.38
49 0.38
50 0.37
51 0.35
52 0.32
53 0.32
54 0.29
55 0.24
56 0.22
57 0.18
58 0.17
59 0.12
60 0.12
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.06
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.06
76 0.07
77 0.08
78 0.13
79 0.2
80 0.28
81 0.34
82 0.43
83 0.51
84 0.6
85 0.69
86 0.74
87 0.77
88 0.8
89 0.82
90 0.84
91 0.85
92 0.77
93 0.69
94 0.67
95 0.59
96 0.49
97 0.41
98 0.31
99 0.22
100 0.2
101 0.18
102 0.11
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.1
111 0.14
112 0.15
113 0.17
114 0.2
115 0.21
116 0.21
117 0.21
118 0.22
119 0.2
120 0.2
121 0.2
122 0.22
123 0.24
124 0.28
125 0.34
126 0.34
127 0.32
128 0.32
129 0.31
130 0.26
131 0.24
132 0.21
133 0.14
134 0.14
135 0.14
136 0.13
137 0.14
138 0.16
139 0.16
140 0.19
141 0.26
142 0.31
143 0.34
144 0.34
145 0.43
146 0.41
147 0.42
148 0.41
149 0.38
150 0.29
151 0.27
152 0.27
153 0.19
154 0.18
155 0.15
156 0.12
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.07
171 0.07
172 0.08
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.14
180 0.14
181 0.2
182 0.24
183 0.27
184 0.34
185 0.34
186 0.35
187 0.31
188 0.36
189 0.33
190 0.3
191 0.28
192 0.23
193 0.22
194 0.2
195 0.21
196 0.18
197 0.16