Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2B0I4

Protein Details
Accession H2B0I4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
350-381KGYPVLTPEKTKKAKKPKNKGTRYPGAQNNDKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
359-370KTKKAKKPKNKG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.333, nucl 12.5, cyto 12, mito_nucl 7.166, cyto_pero 7.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002305  aa-tRNA-synth_Ic  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR002307  Tyr-tRNA-ligase  
IPR023617  Tyr-tRNA-ligase_arc/euk-type  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004831  F:tyrosine-tRNA ligase activity  
GO:0006437  P:tyrosyl-tRNA aminoacylation  
KEGG kaf:KAFR_0J00660  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00579  tRNA-synt_1b  
CDD cd00805  TyrRS_core  
Amino Acid Sequences MTNIDPQEAYSLITKNLQEVLNPQIIKNVLEVEKRPLKLYWGTAPTGKPHCGYFVPMTKLAHFLKAGCEVTVLVADLHAFLDNMKASLDVVQYRAKYYELTIKAILKSINVPVDKLKFVVGSSYQTSSNYTMDIFRMANVCSQNDAKRAGADVVKQVANPLLSGLIYPLMQALDEEYLGVDVQFGGVDQRKIFVLAEENLEKLGYKKRAHLMNPMVPGLGQGGKMSASDPNSKIDLLEEPKQVKKKINSAFCSPGNVEENGLLSFVEYVVAPIQELKHGNGFFEFHIDRPEKFGGPITFKSFDELKQAFKDEKLSPPDLKTGVSDAINVLLAPIREAFQNSPEYQEAQAKGYPVLTPEKTKKAKKPKNKGTRYPGAQNNDKAVNDAVEKLDATKIEDK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.21
3 0.26
4 0.24
5 0.22
6 0.23
7 0.27
8 0.29
9 0.3
10 0.27
11 0.28
12 0.28
13 0.28
14 0.26
15 0.26
16 0.24
17 0.28
18 0.3
19 0.34
20 0.4
21 0.41
22 0.42
23 0.37
24 0.37
25 0.38
26 0.41
27 0.4
28 0.37
29 0.38
30 0.4
31 0.42
32 0.44
33 0.44
34 0.42
35 0.35
36 0.31
37 0.33
38 0.3
39 0.33
40 0.32
41 0.35
42 0.37
43 0.39
44 0.4
45 0.37
46 0.42
47 0.38
48 0.35
49 0.28
50 0.24
51 0.24
52 0.28
53 0.28
54 0.22
55 0.21
56 0.17
57 0.17
58 0.17
59 0.14
60 0.07
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.05
67 0.05
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.1
75 0.13
76 0.11
77 0.14
78 0.17
79 0.18
80 0.19
81 0.2
82 0.18
83 0.17
84 0.18
85 0.24
86 0.22
87 0.25
88 0.26
89 0.28
90 0.28
91 0.3
92 0.28
93 0.2
94 0.2
95 0.2
96 0.23
97 0.2
98 0.21
99 0.23
100 0.25
101 0.25
102 0.23
103 0.21
104 0.15
105 0.15
106 0.17
107 0.14
108 0.14
109 0.16
110 0.17
111 0.17
112 0.17
113 0.19
114 0.19
115 0.17
116 0.15
117 0.13
118 0.12
119 0.12
120 0.14
121 0.11
122 0.1
123 0.11
124 0.11
125 0.14
126 0.15
127 0.15
128 0.15
129 0.18
130 0.19
131 0.21
132 0.22
133 0.19
134 0.18
135 0.18
136 0.18
137 0.17
138 0.16
139 0.16
140 0.17
141 0.17
142 0.16
143 0.16
144 0.15
145 0.13
146 0.12
147 0.09
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.03
168 0.02
169 0.03
170 0.02
171 0.02
172 0.04
173 0.06
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.07
181 0.09
182 0.09
183 0.12
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.11
188 0.1
189 0.09
190 0.14
191 0.18
192 0.19
193 0.23
194 0.29
195 0.34
196 0.36
197 0.43
198 0.43
199 0.41
200 0.42
201 0.38
202 0.32
203 0.27
204 0.25
205 0.18
206 0.13
207 0.08
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.08
214 0.1
215 0.14
216 0.15
217 0.17
218 0.18
219 0.18
220 0.17
221 0.16
222 0.17
223 0.17
224 0.21
225 0.23
226 0.25
227 0.29
228 0.34
229 0.36
230 0.38
231 0.39
232 0.43
233 0.47
234 0.53
235 0.53
236 0.53
237 0.56
238 0.5
239 0.49
240 0.4
241 0.36
242 0.3
243 0.26
244 0.21
245 0.16
246 0.16
247 0.13
248 0.12
249 0.08
250 0.06
251 0.06
252 0.05
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.07
261 0.1
262 0.11
263 0.12
264 0.17
265 0.17
266 0.17
267 0.17
268 0.18
269 0.15
270 0.19
271 0.18
272 0.13
273 0.2
274 0.22
275 0.21
276 0.24
277 0.27
278 0.22
279 0.22
280 0.28
281 0.25
282 0.28
283 0.31
284 0.32
285 0.32
286 0.31
287 0.34
288 0.3
289 0.27
290 0.3
291 0.29
292 0.27
293 0.27
294 0.31
295 0.29
296 0.28
297 0.33
298 0.28
299 0.34
300 0.36
301 0.38
302 0.38
303 0.39
304 0.42
305 0.37
306 0.35
307 0.29
308 0.25
309 0.23
310 0.2
311 0.19
312 0.14
313 0.14
314 0.13
315 0.12
316 0.09
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.09
321 0.08
322 0.09
323 0.12
324 0.13
325 0.16
326 0.21
327 0.21
328 0.25
329 0.26
330 0.27
331 0.26
332 0.31
333 0.29
334 0.26
335 0.27
336 0.24
337 0.24
338 0.23
339 0.21
340 0.18
341 0.23
342 0.23
343 0.3
344 0.36
345 0.45
346 0.53
347 0.61
348 0.69
349 0.73
350 0.81
351 0.84
352 0.89
353 0.9
354 0.92
355 0.94
356 0.94
357 0.92
358 0.92
359 0.89
360 0.87
361 0.84
362 0.82
363 0.79
364 0.73
365 0.69
366 0.63
367 0.56
368 0.49
369 0.42
370 0.36
371 0.29
372 0.27
373 0.23
374 0.19
375 0.19
376 0.18
377 0.19
378 0.17