Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4RF42

Protein Details
Accession A0A1E4RF42    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
222-243TCGYSLRPRRNNHLNNNHPNSLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR030843  PAN2  
IPR028881  PAN2_UCH_dom  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR028889  USP_dom  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0031251  C:PAN complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004535  F:poly(A)-specific ribonuclease activity  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
Pfam View protein in Pfam  
PF00929  RNase_T  
PF13423  UCH_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50235  USP_3  
CDD cd06143  PAN2_exo  
Amino Acid Sequences VSRIALSAPTKPPNQSINTINKDQTSNQITSLEFDTSTNLLWCGDSNGYTRSFTPQPALTSPFPSTHSIQLIPYTKFKSSINHPINQLLNHQRGILSLSSNNINFNNRRGLCQLSLNAESINNDNFKNLKCMTFNCHSINDLVISGNNSLSKVSLLKPTVLESFDYTGDLSFINNLSKFLTLGKSNGTVEIFDPLDNKVVKSFHGHNGLLSDLDVSGNYIATCGYSLRPRRNNHLNNNHPNSLNNPPSPDYMVDPLVNIYDLRMMRPLPPIPFSAGASFARFHPKLPNIIIISSSTGQLQFVDIYDQSNVYLYQANLSNPLQHHHPRGSLAAAISSPASSSCLSNMNISENGEYLVFNDGFSNVHLWSLLNNPNKNFLNFPSSLDQPDIVMQSPSLNPLPVDSNVPLNSIGMPYYKEFLLSNYPTDLVFQKELAKLPIKIDPSLFEISEQIALEPHVEQQQQQPQPLHIPKFMAFDKLKYSIKGRNTYQKYESLKNSKLSNGGKKTTTTTIMPKFLSERGPIASPIPSVNNSTANLLTKTVSNTSHDPDKSSNDDEQFDTSIFQYKSEKATRVPNVYLKLQIQYSKFGVEDFDFDFYNKTLTLNESNNSLKIPDDRFCGLENNVDNSYINSLIQLYRFCPIFYNSVIKNLLPEYLPNNNTTIITNKNPQGLSILIELGYLFDMMYKSHGEQVKISNFTQVLNQNKRANDEGLINIDELRSLSGYDLQKIIINFNKFLIDTISHDQLNQIKSLLKFDFYEFSNVEKIGNLFNIVFDVEVRSNGCESYDQQLINQLSLDLINPPQNVLNKMNGNQGFAKKNHSLITYLEYTANRVKIVPCNNHPYPPQFLHSLEIKQTLVQLPPILSINLPFNNQEYSLIKGFKKWLVPEFYVVKNPVNKKISFKPVVTQFNQEASKYDLLGYVCEINHDLDNTKGEHNLISYIKIKSSANSYFAKDQWFLFNDFLVMPISEEEVFNINYSWKKPTILCYHNVDHPLNQTFNYLNQSIINKIKLNDSILYRDHFACGIRENYKREYKILTRDEAPSAGTLVSIDAEFVTLKPEELEVSYDGFRNLVKPKVLSLARISVIRGDNNDQQGVPFIDDYILHTCPIYDYLTNFSGIEPNDLNPIKSEKNLVTLQTAYRKLWILINLGVIFVGHGLKNDFRTINLKVPQSQIRDTIDYFYLPDFKRKLSLKFLAYILLKEKVQTGNHDSIEDAYTALLLYKKYIELNAIGEFESTLHRIYLEGQQLRFKVPES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.49
3 0.5
4 0.54
5 0.58
6 0.6
7 0.57
8 0.53
9 0.52
10 0.48
11 0.48
12 0.44
13 0.38
14 0.35
15 0.35
16 0.32
17 0.31
18 0.32
19 0.24
20 0.19
21 0.18
22 0.19
23 0.17
24 0.18
25 0.16
26 0.14
27 0.12
28 0.12
29 0.13
30 0.14
31 0.14
32 0.15
33 0.17
34 0.2
35 0.21
36 0.23
37 0.23
38 0.25
39 0.27
40 0.27
41 0.3
42 0.3
43 0.33
44 0.35
45 0.41
46 0.37
47 0.38
48 0.39
49 0.36
50 0.35
51 0.35
52 0.34
53 0.33
54 0.35
55 0.31
56 0.3
57 0.36
58 0.38
59 0.37
60 0.4
61 0.39
62 0.37
63 0.38
64 0.38
65 0.38
66 0.4
67 0.48
68 0.48
69 0.5
70 0.51
71 0.54
72 0.56
73 0.51
74 0.51
75 0.49
76 0.47
77 0.42
78 0.4
79 0.34
80 0.3
81 0.32
82 0.25
83 0.2
84 0.17
85 0.19
86 0.23
87 0.23
88 0.25
89 0.25
90 0.3
91 0.3
92 0.32
93 0.4
94 0.36
95 0.39
96 0.39
97 0.42
98 0.37
99 0.41
100 0.4
101 0.36
102 0.37
103 0.34
104 0.31
105 0.27
106 0.26
107 0.23
108 0.23
109 0.2
110 0.18
111 0.2
112 0.23
113 0.23
114 0.28
115 0.27
116 0.27
117 0.29
118 0.32
119 0.36
120 0.39
121 0.43
122 0.41
123 0.41
124 0.38
125 0.35
126 0.33
127 0.27
128 0.21
129 0.16
130 0.14
131 0.14
132 0.13
133 0.14
134 0.13
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.13
140 0.15
141 0.2
142 0.21
143 0.23
144 0.24
145 0.27
146 0.28
147 0.27
148 0.25
149 0.21
150 0.21
151 0.19
152 0.19
153 0.16
154 0.13
155 0.13
156 0.11
157 0.09
158 0.08
159 0.09
160 0.12
161 0.12
162 0.13
163 0.13
164 0.14
165 0.14
166 0.15
167 0.18
168 0.16
169 0.17
170 0.19
171 0.21
172 0.22
173 0.24
174 0.22
175 0.19
176 0.17
177 0.2
178 0.17
179 0.14
180 0.15
181 0.13
182 0.18
183 0.18
184 0.18
185 0.18
186 0.18
187 0.18
188 0.24
189 0.28
190 0.29
191 0.36
192 0.36
193 0.33
194 0.34
195 0.33
196 0.27
197 0.22
198 0.16
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.07
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.05
209 0.06
210 0.06
211 0.09
212 0.17
213 0.24
214 0.35
215 0.43
216 0.47
217 0.56
218 0.66
219 0.73
220 0.76
221 0.79
222 0.8
223 0.83
224 0.85
225 0.8
226 0.7
227 0.61
228 0.55
229 0.53
230 0.48
231 0.39
232 0.36
233 0.35
234 0.36
235 0.37
236 0.33
237 0.27
238 0.24
239 0.25
240 0.21
241 0.19
242 0.17
243 0.15
244 0.14
245 0.11
246 0.09
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.14
251 0.15
252 0.17
253 0.23
254 0.26
255 0.23
256 0.25
257 0.26
258 0.27
259 0.28
260 0.27
261 0.22
262 0.22
263 0.2
264 0.2
265 0.19
266 0.17
267 0.24
268 0.23
269 0.24
270 0.28
271 0.31
272 0.34
273 0.35
274 0.4
275 0.33
276 0.33
277 0.32
278 0.25
279 0.25
280 0.21
281 0.19
282 0.13
283 0.12
284 0.12
285 0.11
286 0.11
287 0.08
288 0.07
289 0.09
290 0.08
291 0.09
292 0.1
293 0.1
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.08
298 0.11
299 0.09
300 0.12
301 0.14
302 0.14
303 0.17
304 0.18
305 0.21
306 0.19
307 0.21
308 0.24
309 0.27
310 0.31
311 0.3
312 0.32
313 0.29
314 0.3
315 0.29
316 0.25
317 0.2
318 0.16
319 0.13
320 0.12
321 0.1
322 0.08
323 0.07
324 0.06
325 0.08
326 0.07
327 0.08
328 0.09
329 0.13
330 0.14
331 0.16
332 0.16
333 0.17
334 0.18
335 0.19
336 0.18
337 0.14
338 0.13
339 0.12
340 0.11
341 0.08
342 0.11
343 0.1
344 0.09
345 0.1
346 0.09
347 0.09
348 0.1
349 0.11
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.08
355 0.13
356 0.2
357 0.25
358 0.28
359 0.28
360 0.35
361 0.36
362 0.37
363 0.33
364 0.28
365 0.28
366 0.26
367 0.29
368 0.26
369 0.26
370 0.26
371 0.24
372 0.22
373 0.16
374 0.17
375 0.15
376 0.12
377 0.1
378 0.09
379 0.1
380 0.1
381 0.12
382 0.11
383 0.1
384 0.1
385 0.11
386 0.13
387 0.12
388 0.15
389 0.13
390 0.16
391 0.16
392 0.17
393 0.16
394 0.14
395 0.13
396 0.11
397 0.11
398 0.08
399 0.09
400 0.09
401 0.1
402 0.1
403 0.1
404 0.1
405 0.11
406 0.18
407 0.17
408 0.18
409 0.17
410 0.18
411 0.17
412 0.18
413 0.17
414 0.13
415 0.13
416 0.13
417 0.15
418 0.17
419 0.18
420 0.2
421 0.22
422 0.2
423 0.21
424 0.24
425 0.23
426 0.22
427 0.21
428 0.19
429 0.21
430 0.21
431 0.19
432 0.15
433 0.14
434 0.14
435 0.15
436 0.13
437 0.08
438 0.07
439 0.07
440 0.08
441 0.07
442 0.08
443 0.1
444 0.11
445 0.12
446 0.17
447 0.26
448 0.27
449 0.31
450 0.3
451 0.28
452 0.36
453 0.4
454 0.37
455 0.3
456 0.3
457 0.28
458 0.31
459 0.3
460 0.29
461 0.24
462 0.23
463 0.25
464 0.28
465 0.28
466 0.26
467 0.29
468 0.28
469 0.34
470 0.39
471 0.4
472 0.45
473 0.48
474 0.52
475 0.51
476 0.52
477 0.5
478 0.5
479 0.53
480 0.5
481 0.5
482 0.48
483 0.47
484 0.41
485 0.43
486 0.43
487 0.44
488 0.42
489 0.41
490 0.38
491 0.38
492 0.39
493 0.35
494 0.32
495 0.26
496 0.28
497 0.29
498 0.31
499 0.3
500 0.27
501 0.27
502 0.26
503 0.26
504 0.2
505 0.18
506 0.16
507 0.16
508 0.16
509 0.15
510 0.14
511 0.12
512 0.12
513 0.12
514 0.11
515 0.12
516 0.13
517 0.14
518 0.14
519 0.15
520 0.15
521 0.15
522 0.14
523 0.13
524 0.12
525 0.11
526 0.12
527 0.13
528 0.13
529 0.14
530 0.15
531 0.17
532 0.23
533 0.23
534 0.23
535 0.23
536 0.26
537 0.27
538 0.28
539 0.28
540 0.23
541 0.25
542 0.23
543 0.23
544 0.2
545 0.16
546 0.14
547 0.11
548 0.16
549 0.14
550 0.14
551 0.15
552 0.16
553 0.22
554 0.24
555 0.26
556 0.22
557 0.3
558 0.33
559 0.35
560 0.36
561 0.34
562 0.34
563 0.33
564 0.33
565 0.26
566 0.23
567 0.21
568 0.22
569 0.19
570 0.19
571 0.19
572 0.17
573 0.16
574 0.14
575 0.14
576 0.11
577 0.11
578 0.09
579 0.1
580 0.09
581 0.09
582 0.1
583 0.09
584 0.09
585 0.07
586 0.07
587 0.06
588 0.09
589 0.13
590 0.13
591 0.14
592 0.16
593 0.17
594 0.17
595 0.16
596 0.14
597 0.11
598 0.13
599 0.15
600 0.13
601 0.16
602 0.16
603 0.17
604 0.18
605 0.19
606 0.16
607 0.17
608 0.17
609 0.16
610 0.16
611 0.15
612 0.14
613 0.12
614 0.13
615 0.09
616 0.08
617 0.06
618 0.06
619 0.06
620 0.07
621 0.08
622 0.07
623 0.09
624 0.09
625 0.09
626 0.1
627 0.11
628 0.12
629 0.13
630 0.17
631 0.16
632 0.19
633 0.2
634 0.18
635 0.18
636 0.16
637 0.15
638 0.11
639 0.11
640 0.11
641 0.16
642 0.17
643 0.16
644 0.17
645 0.17
646 0.17
647 0.17
648 0.16
649 0.14
650 0.15
651 0.18
652 0.19
653 0.23
654 0.22
655 0.21
656 0.21
657 0.17
658 0.17
659 0.14
660 0.12
661 0.08
662 0.08
663 0.08
664 0.06
665 0.06
666 0.04
667 0.03
668 0.04
669 0.04
670 0.04
671 0.06
672 0.06
673 0.07
674 0.12
675 0.14
676 0.14
677 0.16
678 0.21
679 0.24
680 0.26
681 0.26
682 0.24
683 0.22
684 0.21
685 0.24
686 0.24
687 0.28
688 0.3
689 0.36
690 0.37
691 0.38
692 0.4
693 0.38
694 0.33
695 0.26
696 0.23
697 0.18
698 0.16
699 0.16
700 0.14
701 0.12
702 0.1
703 0.09
704 0.07
705 0.07
706 0.05
707 0.04
708 0.04
709 0.1
710 0.11
711 0.12
712 0.12
713 0.12
714 0.14
715 0.14
716 0.17
717 0.15
718 0.16
719 0.16
720 0.16
721 0.17
722 0.15
723 0.15
724 0.14
725 0.1
726 0.12
727 0.15
728 0.17
729 0.16
730 0.16
731 0.17
732 0.2
733 0.2
734 0.16
735 0.14
736 0.15
737 0.16
738 0.2
739 0.18
740 0.16
741 0.16
742 0.16
743 0.18
744 0.16
745 0.19
746 0.15
747 0.17
748 0.17
749 0.16
750 0.15
751 0.13
752 0.13
753 0.1
754 0.1
755 0.09
756 0.07
757 0.07
758 0.07
759 0.07
760 0.06
761 0.05
762 0.07
763 0.06
764 0.07
765 0.08
766 0.08
767 0.09
768 0.09
769 0.09
770 0.08
771 0.1
772 0.13
773 0.15
774 0.15
775 0.14
776 0.21
777 0.2
778 0.19
779 0.18
780 0.14
781 0.11
782 0.11
783 0.11
784 0.06
785 0.07
786 0.1
787 0.1
788 0.1
789 0.13
790 0.15
791 0.18
792 0.19
793 0.23
794 0.22
795 0.24
796 0.31
797 0.29
798 0.29
799 0.29
800 0.31
801 0.31
802 0.3
803 0.34
804 0.29
805 0.31
806 0.31
807 0.28
808 0.25
809 0.22
810 0.25
811 0.21
812 0.2
813 0.21
814 0.18
815 0.2
816 0.22
817 0.21
818 0.17
819 0.16
820 0.18
821 0.21
822 0.29
823 0.32
824 0.34
825 0.42
826 0.43
827 0.46
828 0.46
829 0.43
830 0.42
831 0.38
832 0.35
833 0.29
834 0.29
835 0.28
836 0.29
837 0.27
838 0.23
839 0.23
840 0.2
841 0.18
842 0.19
843 0.18
844 0.15
845 0.14
846 0.14
847 0.12
848 0.13
849 0.13
850 0.12
851 0.09
852 0.1
853 0.13
854 0.14
855 0.14
856 0.14
857 0.14
858 0.15
859 0.15
860 0.17
861 0.14
862 0.17
863 0.19
864 0.22
865 0.2
866 0.22
867 0.25
868 0.26
869 0.28
870 0.27
871 0.3
872 0.33
873 0.34
874 0.36
875 0.37
876 0.35
877 0.36
878 0.34
879 0.32
880 0.33
881 0.35
882 0.39
883 0.4
884 0.4
885 0.42
886 0.48
887 0.54
888 0.52
889 0.49
890 0.47
891 0.51
892 0.57
893 0.53
894 0.5
895 0.42
896 0.43
897 0.44
898 0.37
899 0.3
900 0.27
901 0.26
902 0.21
903 0.2
904 0.17
905 0.15
906 0.16
907 0.15
908 0.13
909 0.12
910 0.13
911 0.13
912 0.12
913 0.12
914 0.13
915 0.12
916 0.11
917 0.13
918 0.15
919 0.14
920 0.14
921 0.14
922 0.13
923 0.13
924 0.16
925 0.14
926 0.16
927 0.19
928 0.19
929 0.19
930 0.21
931 0.21
932 0.18
933 0.24
934 0.24
935 0.24
936 0.26
937 0.29
938 0.31
939 0.32
940 0.34
941 0.29
942 0.27
943 0.28
944 0.27
945 0.26
946 0.23
947 0.21
948 0.18
949 0.17
950 0.17
951 0.12
952 0.1
953 0.08
954 0.07
955 0.09
956 0.09
957 0.09
958 0.09
959 0.1
960 0.1
961 0.1
962 0.1
963 0.12
964 0.14
965 0.16
966 0.19
967 0.18
968 0.21
969 0.22
970 0.3
971 0.37
972 0.39
973 0.42
974 0.44
975 0.46
976 0.48
977 0.51
978 0.44
979 0.37
980 0.38
981 0.37
982 0.32
983 0.29
984 0.26
985 0.22
986 0.24
987 0.26
988 0.21
989 0.17
990 0.19
991 0.21
992 0.23
993 0.26
994 0.27
995 0.25
996 0.25
997 0.29
998 0.28
999 0.29
1000 0.29
1001 0.27
1002 0.29
1003 0.28
1004 0.3
1005 0.29
1006 0.27
1007 0.25
1008 0.22
1009 0.21
1010 0.18
1011 0.19
1012 0.23
1013 0.26
1014 0.32
1015 0.35
1016 0.41
1017 0.48
1018 0.48
1019 0.47
1020 0.49
1021 0.49
1022 0.53
1023 0.54
1024 0.51
1025 0.47
1026 0.48
1027 0.47
1028 0.41
1029 0.35
1030 0.25
1031 0.21
1032 0.16
1033 0.12
1034 0.09
1035 0.07
1036 0.07
1037 0.06
1038 0.06
1039 0.05
1040 0.06
1041 0.06
1042 0.06
1043 0.08
1044 0.08
1045 0.08
1046 0.09
1047 0.09
1048 0.1
1049 0.1
1050 0.13
1051 0.11
1052 0.14
1053 0.15
1054 0.15
1055 0.15
1056 0.14
1057 0.14
1058 0.16
1059 0.19
1060 0.21
1061 0.23
1062 0.23
1063 0.25
1064 0.33
1065 0.33
1066 0.32
1067 0.32
1068 0.32
1069 0.31
1070 0.32
1071 0.3
1072 0.28
1073 0.29
1074 0.28
1075 0.28
1076 0.28
1077 0.32
1078 0.34
1079 0.35
1080 0.29
1081 0.27
1082 0.28
1083 0.26
1084 0.22
1085 0.16
1086 0.13
1087 0.12
1088 0.12
1089 0.15
1090 0.16
1091 0.15
1092 0.14
1093 0.14
1094 0.13
1095 0.14
1096 0.16
1097 0.15
1098 0.13
1099 0.13
1100 0.18
1101 0.2
1102 0.21
1103 0.2
1104 0.18
1105 0.2
1106 0.19
1107 0.21
1108 0.17
1109 0.17
1110 0.24
1111 0.25
1112 0.25
1113 0.23
1114 0.27
1115 0.26
1116 0.26
1117 0.31
1118 0.24
1119 0.29
1120 0.32
1121 0.31
1122 0.29
1123 0.29
1124 0.33
1125 0.36
1126 0.38
1127 0.32
1128 0.33
1129 0.33
1130 0.31
1131 0.33
1132 0.31
1133 0.26
1134 0.25
1135 0.29
1136 0.25
1137 0.23
1138 0.22
1139 0.17
1140 0.14
1141 0.11
1142 0.11
1143 0.07
1144 0.08
1145 0.11
1146 0.14
1147 0.17
1148 0.21
1149 0.21
1150 0.22
1151 0.27
1152 0.3
1153 0.35
1154 0.39
1155 0.41
1156 0.4
1157 0.46
1158 0.51
1159 0.51
1160 0.5
1161 0.47
1162 0.46
1163 0.46
1164 0.43
1165 0.4
1166 0.35
1167 0.3
1168 0.28
1169 0.24
1170 0.27
1171 0.24
1172 0.31
1173 0.3
1174 0.3
1175 0.38
1176 0.42
1177 0.46
1178 0.47
1179 0.54
1180 0.49
1181 0.51
1182 0.5
1183 0.48
1184 0.45
1185 0.41
1186 0.36
1187 0.33
1188 0.29
1189 0.26
1190 0.29
1191 0.29
1192 0.3
1193 0.34
1194 0.37
1195 0.41
1196 0.41
1197 0.41
1198 0.37
1199 0.33
1200 0.32
1201 0.26
1202 0.19
1203 0.11
1204 0.1
1205 0.09
1206 0.11
1207 0.11
1208 0.09
1209 0.11
1210 0.13
1211 0.15
1212 0.16
1213 0.18
1214 0.19
1215 0.19
1216 0.22
1217 0.23
1218 0.22
1219 0.2
1220 0.19
1221 0.17
1222 0.15
1223 0.16
1224 0.14
1225 0.13
1226 0.12
1227 0.11
1228 0.12
1229 0.15
1230 0.21
1231 0.28
1232 0.32
1233 0.33
1234 0.39
1235 0.41
1236 0.44