Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4RIF4

Protein Details
Accession A0A1E4RIF4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-44TELIKKNFKNVQKQIEKQKKQVSDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 11.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013144  CRA_dom  
IPR024964  CTLH/CRA  
IPR006595  CTLH_C  
IPR045098  Fyv10_fam  
IPR044063  ZF_RING_GID  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0045721  P:negative regulation of gluconeogenesis  
GO:0043161  P:proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF10607  CTLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50897  CTLH  
PS51867  ZF_RING_GID  
Amino Acid Sequences MSEPTLNFHIQTRLIQFKIPTELIKKNFKNVQKQIEKQKKQVSDDVTKIKKNPKLPTAMKLEMVRKIIKNFESFQRKLQNNIKKDEELRSRLMARLENLTLLAQFTIDKKEESKEEGSKSVSDGGDRLLDLHNVNLINWYRDQTNLLIVDYLLKSNTYSGTNIGNKLLRSFQQTNLLKLIDYDLLENFNKVFVSIIEHHDLSLVVAWFNENRNALKKVNSNLEFEINYCEFLSLINKGQVNEAIYFSREKLSPYGNKGNYSDGDYEKHEKNLNKLKEIGGLLVYMSINEGVNPKNGNESTLFSSAVMANTPRFHEYKRLLSNERWESLSKCFIENFNKIYGISKTYPLFVYLSAGLSSLKTKSCYCNSENTIFHNDDYENNVDSKEDIYKKDLAVLTDKKFRGPNQYYRLLNKINNCPVCSPELFTLSKNLPYAQLITHIFEKPYKLPNGNIYPFDKLLKPSEKHLSEKNTLLRMKKIKDPLTREIFMIEDCIRVYPA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.38
3 0.37
4 0.36
5 0.41
6 0.38
7 0.37
8 0.36
9 0.43
10 0.46
11 0.55
12 0.54
13 0.56
14 0.62
15 0.65
16 0.69
17 0.7
18 0.74
19 0.74
20 0.8
21 0.82
22 0.86
23 0.84
24 0.83
25 0.83
26 0.8
27 0.75
28 0.74
29 0.71
30 0.68
31 0.69
32 0.7
33 0.67
34 0.64
35 0.65
36 0.67
37 0.65
38 0.65
39 0.66
40 0.63
41 0.67
42 0.66
43 0.68
44 0.68
45 0.64
46 0.61
47 0.58
48 0.55
49 0.5
50 0.5
51 0.47
52 0.42
53 0.43
54 0.45
55 0.43
56 0.43
57 0.42
58 0.47
59 0.51
60 0.49
61 0.53
62 0.56
63 0.54
64 0.58
65 0.64
66 0.63
67 0.6
68 0.65
69 0.63
70 0.58
71 0.6
72 0.61
73 0.6
74 0.55
75 0.52
76 0.5
77 0.47
78 0.45
79 0.45
80 0.38
81 0.32
82 0.31
83 0.28
84 0.24
85 0.23
86 0.2
87 0.17
88 0.14
89 0.12
90 0.07
91 0.08
92 0.09
93 0.13
94 0.13
95 0.14
96 0.16
97 0.19
98 0.22
99 0.26
100 0.3
101 0.31
102 0.33
103 0.36
104 0.36
105 0.33
106 0.32
107 0.32
108 0.26
109 0.21
110 0.18
111 0.16
112 0.15
113 0.15
114 0.15
115 0.11
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.13
120 0.12
121 0.12
122 0.16
123 0.16
124 0.16
125 0.17
126 0.18
127 0.16
128 0.16
129 0.18
130 0.14
131 0.17
132 0.16
133 0.15
134 0.13
135 0.13
136 0.15
137 0.14
138 0.13
139 0.1
140 0.09
141 0.09
142 0.1
143 0.11
144 0.1
145 0.1
146 0.11
147 0.17
148 0.19
149 0.2
150 0.22
151 0.23
152 0.21
153 0.22
154 0.23
155 0.19
156 0.24
157 0.26
158 0.26
159 0.34
160 0.35
161 0.36
162 0.36
163 0.34
164 0.26
165 0.23
166 0.23
167 0.14
168 0.13
169 0.11
170 0.09
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.1
175 0.09
176 0.09
177 0.08
178 0.08
179 0.05
180 0.1
181 0.12
182 0.15
183 0.17
184 0.17
185 0.17
186 0.17
187 0.17
188 0.12
189 0.11
190 0.08
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.08
196 0.11
197 0.1
198 0.11
199 0.15
200 0.19
201 0.2
202 0.23
203 0.26
204 0.28
205 0.35
206 0.36
207 0.34
208 0.32
209 0.33
210 0.29
211 0.25
212 0.26
213 0.17
214 0.15
215 0.13
216 0.12
217 0.09
218 0.09
219 0.1
220 0.07
221 0.08
222 0.11
223 0.12
224 0.12
225 0.13
226 0.13
227 0.14
228 0.13
229 0.13
230 0.1
231 0.1
232 0.11
233 0.11
234 0.12
235 0.1
236 0.11
237 0.12
238 0.16
239 0.19
240 0.25
241 0.33
242 0.32
243 0.34
244 0.34
245 0.34
246 0.3
247 0.29
248 0.25
249 0.18
250 0.19
251 0.19
252 0.23
253 0.22
254 0.23
255 0.25
256 0.24
257 0.3
258 0.38
259 0.38
260 0.35
261 0.36
262 0.34
263 0.34
264 0.33
265 0.25
266 0.16
267 0.14
268 0.11
269 0.11
270 0.1
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.07
277 0.07
278 0.09
279 0.1
280 0.1
281 0.14
282 0.14
283 0.15
284 0.15
285 0.17
286 0.18
287 0.19
288 0.19
289 0.14
290 0.16
291 0.15
292 0.14
293 0.12
294 0.09
295 0.09
296 0.1
297 0.11
298 0.13
299 0.13
300 0.14
301 0.22
302 0.25
303 0.33
304 0.38
305 0.42
306 0.44
307 0.45
308 0.53
309 0.5
310 0.47
311 0.41
312 0.35
313 0.32
314 0.32
315 0.35
316 0.27
317 0.23
318 0.23
319 0.26
320 0.3
321 0.32
322 0.3
323 0.26
324 0.26
325 0.25
326 0.26
327 0.23
328 0.22
329 0.2
330 0.22
331 0.21
332 0.22
333 0.22
334 0.2
335 0.2
336 0.15
337 0.15
338 0.12
339 0.12
340 0.11
341 0.11
342 0.09
343 0.09
344 0.11
345 0.1
346 0.11
347 0.13
348 0.15
349 0.21
350 0.27
351 0.32
352 0.33
353 0.4
354 0.43
355 0.48
356 0.47
357 0.45
358 0.45
359 0.41
360 0.38
361 0.32
362 0.27
363 0.22
364 0.25
365 0.22
366 0.18
367 0.17
368 0.17
369 0.15
370 0.15
371 0.15
372 0.18
373 0.19
374 0.2
375 0.23
376 0.26
377 0.26
378 0.32
379 0.32
380 0.26
381 0.31
382 0.35
383 0.36
384 0.42
385 0.42
386 0.4
387 0.43
388 0.44
389 0.47
390 0.48
391 0.53
392 0.52
393 0.6
394 0.61
395 0.61
396 0.65
397 0.59
398 0.56
399 0.54
400 0.56
401 0.57
402 0.57
403 0.55
404 0.49
405 0.46
406 0.46
407 0.4
408 0.34
409 0.27
410 0.28
411 0.27
412 0.27
413 0.3
414 0.27
415 0.29
416 0.27
417 0.25
418 0.22
419 0.22
420 0.24
421 0.19
422 0.23
423 0.21
424 0.23
425 0.26
426 0.26
427 0.26
428 0.26
429 0.3
430 0.28
431 0.34
432 0.38
433 0.37
434 0.39
435 0.47
436 0.54
437 0.54
438 0.54
439 0.5
440 0.47
441 0.46
442 0.45
443 0.39
444 0.33
445 0.37
446 0.42
447 0.4
448 0.43
449 0.51
450 0.53
451 0.55
452 0.6
453 0.59
454 0.55
455 0.61
456 0.61
457 0.59
458 0.6
459 0.58
460 0.6
461 0.6
462 0.6
463 0.61
464 0.64
465 0.65
466 0.69
467 0.73
468 0.73
469 0.73
470 0.7
471 0.62
472 0.54
473 0.45
474 0.36
475 0.34
476 0.25
477 0.18
478 0.17