Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4RJR3

Protein Details
Accession A0A1E4RJR3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
235-257GYNISMSKKKKNDEEKIKKDNSSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 15, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026699  Exosome_RNA_bind1/RRP40/RRP4  
IPR004088  KH_dom_type_1  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR041054  Rrp40_N  
Gene Ontology GO:0000178  C:exosome (RNase complex)  
GO:0043229  C:intracellular organelle  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF15985  KH_6  
PF18311  Rrp40_N  
Amino Acid Sequences MDSRLIIPGDSIDQENTNGNNERSNKTTIGPGIYKTPQEQDIIPTQSGILKSNSSNNNRLIYIESNPKRYIPQINDFVIGIITGIYGDFYKIQLQDFSPAVQLSMYSFPNATKKNRPNLKIGQAVYARIANCNKEIDVELDCNGSGFGLLDESGYIFDINLNFARELLFNENSIFLNKLSTKCSYEIAIGINGKIWLKCGDGIKTNKDDDEEENSTIDEDLEAAEIAAEHDDIDGYNISMSKKKKNDEEKIKKDNSSLVKDLKRTLAASRFLNICQKINLDQVDDELNAAFRNIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.2
3 0.19
4 0.22
5 0.24
6 0.24
7 0.29
8 0.32
9 0.35
10 0.36
11 0.39
12 0.35
13 0.32
14 0.37
15 0.33
16 0.35
17 0.33
18 0.3
19 0.32
20 0.34
21 0.35
22 0.32
23 0.33
24 0.29
25 0.29
26 0.29
27 0.26
28 0.31
29 0.32
30 0.3
31 0.26
32 0.24
33 0.25
34 0.25
35 0.23
36 0.17
37 0.16
38 0.17
39 0.25
40 0.33
41 0.36
42 0.4
43 0.41
44 0.42
45 0.4
46 0.4
47 0.35
48 0.3
49 0.29
50 0.34
51 0.34
52 0.36
53 0.37
54 0.37
55 0.35
56 0.37
57 0.41
58 0.37
59 0.41
60 0.42
61 0.42
62 0.42
63 0.4
64 0.36
65 0.27
66 0.2
67 0.12
68 0.06
69 0.04
70 0.03
71 0.03
72 0.03
73 0.03
74 0.04
75 0.05
76 0.05
77 0.08
78 0.09
79 0.1
80 0.11
81 0.12
82 0.15
83 0.15
84 0.15
85 0.13
86 0.13
87 0.12
88 0.1
89 0.1
90 0.08
91 0.1
92 0.1
93 0.09
94 0.1
95 0.11
96 0.17
97 0.21
98 0.25
99 0.32
100 0.38
101 0.48
102 0.55
103 0.57
104 0.58
105 0.61
106 0.63
107 0.6
108 0.53
109 0.5
110 0.42
111 0.4
112 0.34
113 0.29
114 0.22
115 0.19
116 0.2
117 0.15
118 0.15
119 0.16
120 0.14
121 0.13
122 0.13
123 0.12
124 0.12
125 0.11
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.09
130 0.08
131 0.06
132 0.04
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.04
145 0.04
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.08
152 0.08
153 0.1
154 0.13
155 0.12
156 0.12
157 0.12
158 0.13
159 0.13
160 0.13
161 0.12
162 0.08
163 0.1
164 0.12
165 0.14
166 0.15
167 0.17
168 0.19
169 0.19
170 0.2
171 0.19
172 0.17
173 0.17
174 0.15
175 0.16
176 0.14
177 0.12
178 0.12
179 0.12
180 0.12
181 0.11
182 0.11
183 0.09
184 0.1
185 0.13
186 0.15
187 0.17
188 0.24
189 0.28
190 0.31
191 0.34
192 0.34
193 0.32
194 0.31
195 0.3
196 0.26
197 0.29
198 0.27
199 0.24
200 0.23
201 0.22
202 0.21
203 0.19
204 0.16
205 0.08
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.06
224 0.08
225 0.09
226 0.15
227 0.19
228 0.27
229 0.33
230 0.39
231 0.48
232 0.57
233 0.67
234 0.73
235 0.81
236 0.82
237 0.85
238 0.85
239 0.77
240 0.69
241 0.65
242 0.62
243 0.57
244 0.53
245 0.52
246 0.52
247 0.53
248 0.54
249 0.51
250 0.46
251 0.4
252 0.41
253 0.4
254 0.4
255 0.39
256 0.4
257 0.37
258 0.37
259 0.43
260 0.4
261 0.35
262 0.32
263 0.34
264 0.32
265 0.36
266 0.36
267 0.3
268 0.28
269 0.27
270 0.27
271 0.24
272 0.21
273 0.16
274 0.14
275 0.12