Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2ARW1

Protein Details
Accession H2ARW1    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MEEIQKSSRNKPRRRDGPKFHGNKSKNBasic
60-97ETNEGSKKTNSRRPANRNKRNKRKRDRNRNSENDEFKLHydrophilic
268-316FYLAGSNEKEKRKKKKSKKKTAEGDRPKKSKKRSRQKKRKAFAEDVQASBasic
326-350LEAAGKKELQKRKRLQLQKEVTSNKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-24RNKPRRRDGPKFHGNK
66-87KKTNSRRPANRNKRNKRKRDRN
276-307KEKRKKKKSKKKTAEGDRPKKSKKRSRQKKRK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
KEGG kaf:KAFR_0C01160  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MEEIQKSSRNKPRRRDGPKFHGNKSKNAATNSIENSNKLGGKSVSNRGKELTPGQESGSETNEGSKKTNSRRPANRNKRNKRKRDRNRNSENDEFKLVMRLLPPNITEQSFKKTIEAVLGEDMFAKWKITDFYYVKGHYSSKLFTPPTYSRAYLTFQTMENLNDFSQKCHKISFVDDRDNATTAKFKISFYVKKLNNNQHNPKLNMEGTLENDELFKNFMKSMKLMEDKEHPEFAFNTFSILKPIEKEFAKQKMAEKLIEKKTEAALFYLAGSNEKEKRKKKKSKKKTAEGDRPKKSKKRSRQKKRKAFAEDVQASVPKNNNIVILEAAGKKELQKRKRLQLQKEVTSNKVHESKGPSKTNSKPKSSLRSYNANESMSKNPGKRAEPVKVLRRETS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.9
3 0.91
4 0.91
5 0.92
6 0.9
7 0.87
8 0.86
9 0.79
10 0.77
11 0.74
12 0.72
13 0.67
14 0.63
15 0.59
16 0.52
17 0.56
18 0.52
19 0.52
20 0.44
21 0.39
22 0.39
23 0.38
24 0.37
25 0.29
26 0.29
27 0.23
28 0.28
29 0.34
30 0.41
31 0.45
32 0.45
33 0.47
34 0.45
35 0.45
36 0.43
37 0.42
38 0.39
39 0.35
40 0.34
41 0.33
42 0.34
43 0.34
44 0.32
45 0.29
46 0.23
47 0.19
48 0.24
49 0.26
50 0.24
51 0.25
52 0.28
53 0.34
54 0.42
55 0.5
56 0.53
57 0.6
58 0.69
59 0.77
60 0.84
61 0.87
62 0.88
63 0.91
64 0.93
65 0.95
66 0.95
67 0.96
68 0.96
69 0.96
70 0.96
71 0.97
72 0.97
73 0.96
74 0.96
75 0.95
76 0.91
77 0.89
78 0.83
79 0.74
80 0.65
81 0.55
82 0.44
83 0.39
84 0.31
85 0.23
86 0.2
87 0.2
88 0.19
89 0.2
90 0.21
91 0.2
92 0.22
93 0.22
94 0.23
95 0.22
96 0.27
97 0.28
98 0.27
99 0.24
100 0.24
101 0.23
102 0.23
103 0.22
104 0.17
105 0.16
106 0.16
107 0.14
108 0.13
109 0.13
110 0.11
111 0.1
112 0.09
113 0.07
114 0.08
115 0.1
116 0.11
117 0.19
118 0.18
119 0.22
120 0.27
121 0.28
122 0.27
123 0.28
124 0.27
125 0.22
126 0.23
127 0.21
128 0.18
129 0.24
130 0.24
131 0.22
132 0.28
133 0.28
134 0.29
135 0.32
136 0.3
137 0.25
138 0.26
139 0.28
140 0.22
141 0.23
142 0.2
143 0.17
144 0.17
145 0.17
146 0.15
147 0.14
148 0.14
149 0.11
150 0.15
151 0.15
152 0.16
153 0.23
154 0.25
155 0.25
156 0.24
157 0.25
158 0.21
159 0.26
160 0.34
161 0.32
162 0.35
163 0.35
164 0.37
165 0.37
166 0.36
167 0.31
168 0.22
169 0.2
170 0.14
171 0.17
172 0.15
173 0.14
174 0.17
175 0.23
176 0.27
177 0.28
178 0.37
179 0.36
180 0.42
181 0.5
182 0.56
183 0.59
184 0.64
185 0.66
186 0.65
187 0.69
188 0.63
189 0.56
190 0.51
191 0.42
192 0.35
193 0.29
194 0.22
195 0.18
196 0.19
197 0.17
198 0.13
199 0.13
200 0.12
201 0.1
202 0.1
203 0.09
204 0.07
205 0.08
206 0.1
207 0.11
208 0.12
209 0.13
210 0.18
211 0.22
212 0.22
213 0.24
214 0.28
215 0.31
216 0.33
217 0.33
218 0.26
219 0.23
220 0.23
221 0.22
222 0.19
223 0.14
224 0.15
225 0.13
226 0.14
227 0.14
228 0.15
229 0.13
230 0.13
231 0.14
232 0.17
233 0.17
234 0.19
235 0.24
236 0.3
237 0.32
238 0.32
239 0.35
240 0.38
241 0.41
242 0.41
243 0.39
244 0.41
245 0.45
246 0.46
247 0.42
248 0.36
249 0.37
250 0.36
251 0.32
252 0.23
253 0.17
254 0.14
255 0.14
256 0.14
257 0.11
258 0.1
259 0.11
260 0.14
261 0.2
262 0.27
263 0.36
264 0.43
265 0.54
266 0.64
267 0.75
268 0.82
269 0.87
270 0.91
271 0.94
272 0.96
273 0.95
274 0.95
275 0.95
276 0.95
277 0.95
278 0.94
279 0.92
280 0.9
281 0.88
282 0.86
283 0.86
284 0.85
285 0.85
286 0.86
287 0.88
288 0.9
289 0.93
290 0.96
291 0.96
292 0.95
293 0.94
294 0.91
295 0.88
296 0.82
297 0.82
298 0.73
299 0.63
300 0.55
301 0.47
302 0.39
303 0.34
304 0.31
305 0.22
306 0.21
307 0.2
308 0.2
309 0.19
310 0.2
311 0.16
312 0.15
313 0.17
314 0.16
315 0.16
316 0.15
317 0.14
318 0.18
319 0.26
320 0.35
321 0.39
322 0.48
323 0.57
324 0.67
325 0.77
326 0.81
327 0.82
328 0.84
329 0.85
330 0.83
331 0.83
332 0.77
333 0.7
334 0.67
335 0.59
336 0.55
337 0.52
338 0.44
339 0.41
340 0.46
341 0.51
342 0.54
343 0.6
344 0.58
345 0.6
346 0.69
347 0.74
348 0.73
349 0.72
350 0.71
351 0.73
352 0.78
353 0.79
354 0.79
355 0.74
356 0.76
357 0.73
358 0.75
359 0.71
360 0.63
361 0.57
362 0.51
363 0.5
364 0.47
365 0.49
366 0.42
367 0.44
368 0.49
369 0.5
370 0.54
371 0.57
372 0.58
373 0.61
374 0.68
375 0.71
376 0.72