Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4RNJ5

Protein Details
Accession A0A1E4RNJ5    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-62APAKADPSRSKNKPKPTGNEGHydrophilic
76-97PSSTPSKHYKRPFDRHSRSGKAHydrophilic
192-215VESSVAKKAKQKSQKEKKFLDFEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-66KKKDVAPAKADPSRSKNKPKPTGNEGALKS
82-101KHYKRPFDRHSRSGKADSGK
230-253RGNFKRGGRRGGANAQGGRKPSSK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSFENKNLYDLLGNDVEDDSTPQLPIREVVKNTSSSKKKDVAPAKADPSRSKNKPKPTGNEGALKSRNNNKNVEAPSSTPSKHYKRPFDRHSRSGKADSGKKVRQGWGGNDKSELQDETEGLQDAVEDLEAESGESTTEAVAPKKSLNDYFAELKVKQQELDGSKNLRKANEGAEEKWSQGEVVAKQQESFVESSVAKKAKQKSQKEKKFLDFEATFADEQKPFRSESARGNFKRGGRRGGANAQGGRKPSSKATTADKKPLDDKNFPSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.16
4 0.14
5 0.15
6 0.12
7 0.11
8 0.12
9 0.12
10 0.13
11 0.14
12 0.16
13 0.19
14 0.23
15 0.24
16 0.29
17 0.31
18 0.35
19 0.39
20 0.46
21 0.49
22 0.48
23 0.52
24 0.54
25 0.54
26 0.59
27 0.64
28 0.63
29 0.62
30 0.63
31 0.65
32 0.63
33 0.62
34 0.59
35 0.57
36 0.58
37 0.6
38 0.65
39 0.65
40 0.72
41 0.78
42 0.8
43 0.8
44 0.78
45 0.79
46 0.72
47 0.72
48 0.63
49 0.62
50 0.58
51 0.52
52 0.49
53 0.5
54 0.53
55 0.49
56 0.5
57 0.44
58 0.47
59 0.48
60 0.47
61 0.4
62 0.34
63 0.33
64 0.34
65 0.32
66 0.28
67 0.33
68 0.34
69 0.41
70 0.47
71 0.55
72 0.61
73 0.71
74 0.76
75 0.8
76 0.82
77 0.82
78 0.82
79 0.77
80 0.72
81 0.66
82 0.61
83 0.57
84 0.55
85 0.54
86 0.54
87 0.51
88 0.52
89 0.51
90 0.5
91 0.49
92 0.45
93 0.45
94 0.46
95 0.45
96 0.4
97 0.38
98 0.36
99 0.3
100 0.28
101 0.22
102 0.12
103 0.1
104 0.1
105 0.1
106 0.1
107 0.09
108 0.08
109 0.07
110 0.06
111 0.05
112 0.05
113 0.04
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.04
126 0.05
127 0.06
128 0.07
129 0.08
130 0.08
131 0.1
132 0.12
133 0.12
134 0.13
135 0.14
136 0.16
137 0.18
138 0.2
139 0.21
140 0.19
141 0.21
142 0.24
143 0.22
144 0.19
145 0.17
146 0.2
147 0.21
148 0.25
149 0.26
150 0.26
151 0.28
152 0.33
153 0.34
154 0.3
155 0.28
156 0.25
157 0.26
158 0.31
159 0.31
160 0.27
161 0.31
162 0.31
163 0.29
164 0.28
165 0.23
166 0.14
167 0.12
168 0.15
169 0.11
170 0.18
171 0.21
172 0.2
173 0.21
174 0.21
175 0.2
176 0.19
177 0.18
178 0.12
179 0.12
180 0.12
181 0.13
182 0.19
183 0.21
184 0.2
185 0.26
186 0.33
187 0.39
188 0.49
189 0.58
190 0.63
191 0.73
192 0.81
193 0.84
194 0.84
195 0.83
196 0.8
197 0.71
198 0.68
199 0.57
200 0.48
201 0.43
202 0.38
203 0.3
204 0.25
205 0.26
206 0.2
207 0.21
208 0.23
209 0.21
210 0.19
211 0.22
212 0.24
213 0.25
214 0.33
215 0.41
216 0.48
217 0.48
218 0.53
219 0.56
220 0.58
221 0.65
222 0.6
223 0.57
224 0.51
225 0.55
226 0.56
227 0.58
228 0.58
229 0.55
230 0.54
231 0.52
232 0.51
233 0.48
234 0.46
235 0.41
236 0.37
237 0.37
238 0.38
239 0.38
240 0.39
241 0.46
242 0.52
243 0.56
244 0.63
245 0.6
246 0.59
247 0.62
248 0.67
249 0.65
250 0.62